RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000283228.6

PTPRR-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type R, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRR, Length 3,529 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRR-201ENST00000283228 ADGRL2O95490 1459 aa13.8□□□□□ -0.2
PTPRR-201ENST00000283228 TAF3Q5VWG9 929 aa13.8□□□□□ -0.2
PTPRR-201ENST00000283228 ABCC2Q92887 1545 aa13.8□□□□□ -0.2
PTPRR-201ENST00000283228 FIBPO43427 364 aa13.8□□□□□ -0.2
PTPRR-201ENST00000283228 ZDHHC9Q9Y397 364 aa13.8□□□□□ -0.2
PTPRR-201ENST00000283228 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP13.79□□□□□ -0.2
PTPRR-201ENST00000283228 V9GYY5 206 aaPredicted RBP13.79□□□□□ -0.2
PTPRR-201ENST00000283228 DTNBO60941 627 aa13.79□□□□□ -0.2
PTPRR-201ENST00000283228 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP13.79□□□□□ -0.2
PTPRR-201ENST00000283228 CERS3Q8IU89 383 aa13.79□□□□□ -0.2
PTPRR-201ENST00000283228 NSD3Q9BZ95 1437 aa13.79□□□□□ -0.2
PTPRR-201ENST00000283228 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP13.78□□□□□ -0.2
PTPRR-201ENST00000283228 CCDC141Q6ZP82 1450 aa13.78□□□□□ -0.2
PTPRR-201ENST00000283228 TMPOP42166 694 aaKnown RBP13.78□□□□□ -0.2
PTPRR-201ENST00000283228 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP13.78□□□□□ -0.2
PTPRR-201ENST00000283228 CLEC17AQ6ZS10 378 aa13.78□□□□□ -0.2
PTPRR-201ENST00000283228 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP13.78□□□□□ -0.2
PTPRR-201ENST00000283228 PYCARDQ9ULZ3 195 aa13.78□□□□□ -0.2
PTPRR-201ENST00000283228 CCDC66A2RUB6 948 aa13.78□□□□□ -0.2
PTPRR-201ENST00000283228 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP13.78□□□□□ -0.2
PTPRR-201ENST00000283228 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP13.78□□□□□ -0.2
PTPRR-201ENST00000283228 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa13.78□□□□□ -0.2
PTPRR-201ENST00000283228 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP13.78□□□□□ -0.2
PTPRR-201ENST00000283228 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP13.78□□□□□ -0.2
PTPRR-201ENST00000283228 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa13.77□□□□□ -0.2
PTPRR-201ENST00000283228 REC8O95072 547 aa13.77□□□□□ -0.2
PTPRR-201ENST00000283228 TMX3Q96JJ7 454 aa13.77□□□□□ -0.2
PTPRR-201ENST00000283228 USP26Q9BXU7 913 aa13.77□□□□□ -0.2
PTPRR-201ENST00000283228 USP48Q86UV5 1035 aa13.77□□□□□ -0.21
PTPRR-201ENST00000283228 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa13.77□□□□□ -0.21
PTPRR-201ENST00000283228 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP13.77□□□□□ -0.21
PTPRR-201ENST00000283228 GIMAP6Q6P9H5 292 aa13.77□□□□□ -0.21
PTPRR-201ENST00000283228 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP13.76□□□□□ -0.21
PTPRR-201ENST00000283228 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP13.76□□□□□ -0.21
PTPRR-201ENST00000283228 ANO2Q9NQ90 1003 aa13.76□□□□□ -0.21
PTPRR-201ENST00000283228 ADGBQ8N7X0 1667 aa13.76□□□□□ -0.21
PTPRR-201ENST00000283228 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP13.76□□□□□ -0.21
PTPRR-201ENST00000283228 ATAD2Q6PL18 1390 aa13.76□□□□□ -0.21
PTPRR-201ENST00000283228 CHD1O14646 1710 aa13.76□□□□□ -0.21
PTPRR-201ENST00000283228 CLASP1Q7Z460 1538 aa13.76□□□□□ -0.21
PTPRR-201ENST00000283228 OGFRQ9NZT2 677 aa13.76□□□□□ -0.21
PTPRR-201ENST00000283228 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa13.75□□□□□ -0.21
PTPRR-201ENST00000283228 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa13.75□□□□□ -0.21
PTPRR-201ENST00000283228 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP13.75□□□□□ -0.21
PTPRR-201ENST00000283228 FAM184AQ8NB25 1140 aa13.75□□□□□ -0.21
PTPRR-201ENST00000283228 RILPL2Q969X0 211 aa13.74□□□□□ -0.21
PTPRR-201ENST00000283228 GGNBP2Q9H3C7 697 aa13.74□□□□□ -0.21
PTPRR-201ENST00000283228 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP13.74□□□□□ -0.21
PTPRR-201ENST00000283228 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP13.74□□□□□ -0.21
PTPRR-201ENST00000283228 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa13.74□□□□□ -0.21
PTPRR-201ENST00000283228 CCDC112Q8NEF3 446 aa13.74□□□□□ -0.21
PTPRR-201ENST00000283228 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP13.74□□□□□ -0.21
PTPRR-201ENST00000283228 TTC37Q6PGP7 1564 aa13.74□□□□□ -0.21
PTPRR-201ENST00000283228 SCAPERQ9BY12 1400 aa13.74□□□□□ -0.21
PTPRR-201ENST00000283228 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP13.74□□□□□ -0.21
PTPRR-201ENST00000283228 SDSP20132 328 aa13.74□□□□□ -0.21
PTPRR-201ENST00000283228 MCCP23508 829 aa13.74□□□□□ -0.21
PTPRR-201ENST00000283228 TSHZ3Q63HK5 1081 aa13.74□□□□□ -0.21
PTPRR-201ENST00000283228 ADCY10Q96PN6 1610 aa13.74□□□□□ -0.21
PTPRR-201ENST00000283228 KIF3BO15066 747 aa13.73□□□□□ -0.21
PTPRR-201ENST00000283228 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP13.73□□□□□ -0.21
PTPRR-201ENST00000283228 RSPH4AQ5TD94 716 aa13.73□□□□□ -0.21
PTPRR-201ENST00000283228 TIGD1Q96MW7 591 aa13.73□□□□□ -0.21
PTPRR-201ENST00000283228 PTGS1P23219 599 aa13.73□□□□□ -0.21
PTPRR-201ENST00000283228 TTC22Q5TAA0 569 aa13.73□□□□□ -0.21
PTPRR-201ENST00000283228 CFAP44Q96MT7 982 aa13.73□□□□□ -0.21
PTPRR-201ENST00000283228 TNNT1P13805 278 aa13.73□□□□□ -0.21
PTPRR-201ENST00000283228 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP13.73□□□□□ -0.21
PTPRR-201ENST00000283228 TRIM34Q9BYJ4 488 aa13.73□□□□□ -0.21
PTPRR-201ENST00000283228 CNPY2Q9Y2B0 182 aa13.73□□□□□ -0.21
PTPRR-201ENST00000283228 CCDC183Q5T5S1 534 aa13.72□□□□□ -0.21
PTPRR-201ENST00000283228 FEZ1Q99689 392 aa13.72□□□□□ -0.21
PTPRR-201ENST00000283228 TMEM132EQ6IEE7 984 aa13.72□□□□□ -0.21
PTPRR-201ENST00000283228 ZBTB9Q96C00 473 aa13.72□□□□□ -0.21
PTPRR-201ENST00000283228 CROCC2H7BZ55 1655 aa13.72□□□□□ -0.21
PTPRR-201ENST00000283228 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP13.72□□□□□ -0.21
PTPRR-201ENST00000283228 ERC2O15083 957 aa13.72□□□□□ -0.21
PTPRR-201ENST00000283228 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP13.72□□□□□ -0.21
PTPRR-201ENST00000283228 KDM4AO75164 1064 aa13.72□□□□□ -0.21
PTPRR-201ENST00000283228 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP13.72□□□□□ -0.21
PTPRR-201ENST00000283228 PLA2R1Q13018 1463 aa13.71□□□□□ -0.21
PTPRR-201ENST00000283228 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa13.71□□□□□ -0.21
PTPRR-201ENST00000283228 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP13.71□□□□□ -0.21
PTPRR-201ENST00000283228 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP13.7□□□□□ -0.22
PTPRR-201ENST00000283228 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa13.7□□□□□ -0.22
PTPRR-201ENST00000283228 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa13.7□□□□□ -0.22
PTPRR-201ENST00000283228 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP13.7□□□□□ -0.22
PTPRR-201ENST00000283228 UVSSAQ2YD98 709 aa13.7□□□□□ -0.22
PTPRR-201ENST00000283228 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP13.7□□□□□ -0.22
PTPRR-201ENST00000283228 TRIM5Q9C035 493 aa13.7□□□□□ -0.22
PTPRR-201ENST00000283228 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa13.7□□□□□ -0.22
PTPRR-201ENST00000283228 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP13.7□□□□□ -0.22
PTPRR-201ENST00000283228 CAMK4Q16566 473 aa13.7□□□□□ -0.22
PTPRR-201ENST00000283228 SIRT2Q8IXJ6 389 aa13.7□□□□□ -0.22
PTPRR-201ENST00000283228 SHANK2Q9UPX8 1470 aa13.69□□□□□ -0.22
PTPRR-201ENST00000283228 HMOX1P09601 288 aa13.69□□□□□ -0.22
PTPRR-201ENST00000283228 LRMPQ12912 555 aa13.69□□□□□ -0.22
PTPRR-201ENST00000283228 CCDC186Q7Z3E2 898 aa13.69□□□□□ -0.22
PTPRR-201ENST00000283228 TRIM35Q9UPQ4 493 aa13.69□□□□□ -0.22
PTPRR-201ENST00000283228 KIAA1524Q8TCG1 905 aa13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.6 ms