RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000281623.7

FBXO4-201, Transcript of F-box protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene FBXO4, Length 1,682 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO4-201ENST00000281623 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
FBXO4-201ENST00000281623 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
FBXO4-201ENST00000281623 COG3Q96JB2 828 aa22.03■■□□□ 1.12
FBXO4-201ENST00000281623 PLEKHG5O94827 1062 aa22.02■■□□□ 1.12
FBXO4-201ENST00000281623 NLRP6P59044 892 aa22.02■■□□□ 1.12
FBXO4-201ENST00000281623 SLIT3O75094 1523 aa22.02■■□□□ 1.12
FBXO4-201ENST00000281623 USP19O94966 1318 aa22.02■■□□□ 1.12
FBXO4-201ENST00000281623 USP31Q70CQ4 1352 aa22.01■■□□□ 1.11
FBXO4-201ENST00000281623 GOLGA2Q08379 1002 aa22.01■■□□□ 1.11
FBXO4-201ENST00000281623 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
FBXO4-201ENST00000281623 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP22■■□□□ 1.11
FBXO4-201ENST00000281623 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
FBXO4-201ENST00000281623 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
FBXO4-201ENST00000281623 RCAN3Q9UKA8 241 aa21.99■■□□□ 1.11
FBXO4-201ENST00000281623 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
FBXO4-201ENST00000281623 ADAMTS2O95450 1211 aa21.98■■□□□ 1.11
FBXO4-201ENST00000281623 FBLN1P23142 703 aa21.98■■□□□ 1.11
FBXO4-201ENST00000281623 DUSP27Q5VZP5 1158 aa21.98■■□□□ 1.11
FBXO4-201ENST00000281623 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
FBXO4-201ENST00000281623 PLCH1Q4KWH8 1693 aa21.97■■□□□ 1.11
FBXO4-201ENST00000281623 LTN1O94822 1766 aa21.97■■□□□ 1.11
FBXO4-201ENST00000281623 SLFN5Q08AF3 891 aa21.97■■□□□ 1.11
FBXO4-201ENST00000281623 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
FBXO4-201ENST00000281623 TCP11L2Q8N4U5 519 aa21.97■■□□□ 1.11
FBXO4-201ENST00000281623 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
FBXO4-201ENST00000281623 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
FBXO4-201ENST00000281623 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa21.96■■□□□ 1.11
FBXO4-201ENST00000281623 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
FBXO4-201ENST00000281623 NWD2Q9ULI1 1742 aa21.95■■□□□ 1.1
FBXO4-201ENST00000281623 PLEKHF1Q96S99 279 aa21.95■■□□□ 1.1
FBXO4-201ENST00000281623 NFAT5O94916 1531 aa21.94■■□□□ 1.1
FBXO4-201ENST00000281623 GCP02774 474 aa21.94■■□□□ 1.1
FBXO4-201ENST00000281623 WWC1Q8IX03 1113 aa21.94■■□□□ 1.1
FBXO4-201ENST00000281623 RRP1P56182 461 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
FBXO4-201ENST00000281623 CCDC27Q2M243 656 aa21.93■■□□□ 1.1
FBXO4-201ENST00000281623 KCNH5Q8NCM2 988 aa21.93■■□□□ 1.1
FBXO4-201ENST00000281623 E9PSI1 815 aa21.92■■□□□ 1.1
FBXO4-201ENST00000281623 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
FBXO4-201ENST00000281623 C8orf37Q96NL8 207 aa21.92■■□□□ 1.1
FBXO4-201ENST00000281623 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
FBXO4-201ENST00000281623 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
FBXO4-201ENST00000281623 CPDO75976 1380 aa21.91■■□□□ 1.1
FBXO4-201ENST00000281623 KIAA0232Q92628 1395 aa21.91■■□□□ 1.1
FBXO4-201ENST00000281623 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
FBXO4-201ENST00000281623 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
FBXO4-201ENST00000281623 FAM83GA6ND36 823 aa21.89■■□□□ 1.1
FBXO4-201ENST00000281623 IL13P35225 146 aa21.89■■□□□ 1.1
FBXO4-201ENST00000281623 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.1
FBXO4-201ENST00000281623 NGLY1Q96IV0 654 aa21.89■■□□□ 1.1
FBXO4-201ENST00000281623 PPP4R2Q9NY27 417 aa21.89■■□□□ 1.1
FBXO4-201ENST00000281623 PEAK1Q9H792 1746 aa21.89■■□□□ 1.1
FBXO4-201ENST00000281623 LMO7Q8WWI1 1683 aa21.89■■□□□ 1.09
FBXO4-201ENST00000281623 RGPD5Q99666 1765 aa21.89■■□□□ 1.09
FBXO4-201ENST00000281623 SLIT2O94813 1529 aa21.89■■□□□ 1.09
FBXO4-201ENST00000281623 NRAPQ86VF7 1730 aa21.89■■□□□ 1.09
FBXO4-201ENST00000281623 SOX12O15370 315 aa21.88■■□□□ 1.09
FBXO4-201ENST00000281623 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
FBXO4-201ENST00000281623 PRDM11Q9NQV5 511 aa21.88■■□□□ 1.09
FBXO4-201ENST00000281623 COL18A1P39060 1754 aa21.88■■□□□ 1.09
FBXO4-201ENST00000281623 AFF2P51816 1311 aa21.88■■□□□ 1.09
FBXO4-201ENST00000281623 BCL9LQ86UU0 1499 aa21.88■■□□□ 1.09
FBXO4-201ENST00000281623 NEUROD2Q15784 382 aa21.88■■□□□ 1.09
FBXO4-201ENST00000281623 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
FBXO4-201ENST00000281623 FCHSD2O94868 740 aa21.87■■□□□ 1.09
FBXO4-201ENST00000281623 WDR63Q8IWG1 891 aa21.87■■□□□ 1.09
FBXO4-201ENST00000281623 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa21.86■■□□□ 1.09
FBXO4-201ENST00000281623 RSPH6AQ9H0K4 717 aa21.86■■□□□ 1.09
FBXO4-201ENST00000281623 ABCC6O95255 1503 aa21.86■■□□□ 1.09
FBXO4-201ENST00000281623 POTEAQ6S8J7 498 aa21.85■■□□□ 1.09
FBXO4-201ENST00000281623 TMPOP42166 694 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
FBXO4-201ENST00000281623 CHRNA2Q15822 529 aa21.83■■□□□ 1.09
FBXO4-201ENST00000281623 ARHGEF25Q86VW2 580 aa21.83■■□□□ 1.09
FBXO4-201ENST00000281623 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
FBXO4-201ENST00000281623 ZBTB7CA1YPR0 619 aa21.82■■□□□ 1.08
FBXO4-201ENST00000281623 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
FBXO4-201ENST00000281623 PRKAR2BP31323 418 aa21.82■■□□□ 1.08
FBXO4-201ENST00000281623 USP21Q9UK80 565 aa21.82■■□□□ 1.08
FBXO4-201ENST00000281623 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa21.82■■□□□ 1.08
FBXO4-201ENST00000281623 RGPD1P0DJD0 1748 aa21.81■■□□□ 1.08
FBXO4-201ENST00000281623 BTG4Q9NY30 223 aa21.8■■□□□ 1.08
FBXO4-201ENST00000281623 TRIM35Q9UPQ4 493 aa21.8■■□□□ 1.08
FBXO4-201ENST00000281623 MAP3K19Q56UN5 1328 aa21.79■■□□□ 1.08
FBXO4-201ENST00000281623 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
FBXO4-201ENST00000281623 UNC5CLQ8IV45 518 aa21.79■■□□□ 1.08
FBXO4-201ENST00000281623 FLT4P35916 1363 aa21.78■■□□□ 1.08
FBXO4-201ENST00000281623 ATRNO75882 1429 aa21.78■■□□□ 1.08
FBXO4-201ENST00000281623 HMOX1P09601 288 aa21.78■■□□□ 1.08
FBXO4-201ENST00000281623 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.07
FBXO4-201ENST00000281623 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
FBXO4-201ENST00000281623 AXIN2Q9Y2T1 843 aa21.76■■□□□ 1.07
FBXO4-201ENST00000281623 RTL1A6NKG5 1358 aa21.76■■□□□ 1.07
FBXO4-201ENST00000281623 RIPK4P57078 832 aa21.75■■□□□ 1.07
FBXO4-201ENST00000281623 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa21.75■■□□□ 1.07
FBXO4-201ENST00000281623 KIF24Q5T7B8 1368 aa21.75■■□□□ 1.07
FBXO4-201ENST00000281623 NEFMP07197 916 aa21.75■■□□□ 1.07
FBXO4-201ENST00000281623 MYH16Q9H6N6 1097 aa21.75■■□□□ 1.07
FBXO4-201ENST00000281623 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
FBXO4-201ENST00000281623 PLIN1O60240 522 aa21.74■■□□□ 1.07
FBXO4-201ENST00000281623 GLI3P10071 1580 aa21.74■■□□□ 1.07
FBXO4-201ENST00000281623 IL16Q14005 1332 aa21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.9 ms