RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264640.8

SMARCE1-201, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 631 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-201ENST00000264640 PYGBP11216 843 aa10.08□□□□□ -0.8
SMARCE1-201ENST00000264640 ITGAEP38570 1179 aa10.08□□□□□ -0.8
SMARCE1-201ENST00000264640 STK26Q9P289 416 aa10.08□□□□□ -0.8
SMARCE1-201ENST00000264640 CHD4Q14839 1912 aa10.07□□□□□ -0.8
SMARCE1-201ENST00000264640 ALS2Q96Q42 1657 aa10.07□□□□□ -0.8
SMARCE1-201ENST00000264640 VGFO15240 615 aaPredicted RBP10.07□□□□□ -0.8
SMARCE1-201ENST00000264640 TRIM37O94972 964 aa10.07□□□□□ -0.8
SMARCE1-201ENST00000264640 SLAIN1Q8ND83 568 aa10.07□□□□□ -0.8
SMARCE1-201ENST00000264640 BTG4Q9NY30 223 aa10.07□□□□□ -0.8
SMARCE1-201ENST00000264640 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP10.07□□□□□ -0.8
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SMARCE1-201ENST00000264640 OCEL1Q9H607 264 aa10.05□□□□□ -0.8
SMARCE1-201ENST00000264640 TECPR2O15040 1411 aa10.05□□□□□ -0.8
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SMARCE1-201ENST00000264640 NINLQ9Y2I6 1382 aa10.04□□□□□ -0.8
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SMARCE1-201ENST00000264640 APBA3O96018 575 aa10.04□□□□□ -0.8
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP10.04□□□□□ -0.8
SMARCE1-201ENST00000264640 PCDHB8Q9UN66 801 aa10.04□□□□□ -0.8
SMARCE1-201ENST00000264640 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa10.04□□□□□ -0.8
SMARCE1-201ENST00000264640 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa10.04□□□□□ -0.8
SMARCE1-201ENST00000264640 SBNO1A3KN83 1393 aa10.03□□□□□ -0.8
SMARCE1-201ENST00000264640 UTRNP46939 3433 aa10.03□□□□□ -0.8
SMARCE1-201ENST00000264640 PHF8Q9UPP1 1060 aa10.03□□□□□ -0.8
SMARCE1-201ENST00000264640 PARD3Q8TEW0 1356 aa10.02□□□□□ -0.8
SMARCE1-201ENST00000264640 ST18O60284 1047 aa10.02□□□□□ -0.81
SMARCE1-201ENST00000264640 PSME1Q06323 249 aa10.02□□□□□ -0.81
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SMARCE1-201ENST00000264640 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.81
SMARCE1-201ENST00000264640 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa10.02□□□□□ -0.81
SMARCE1-201ENST00000264640 SBF2Q86WG5 1849 aa10□□□□□ -0.81
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SMARCE1-201ENST00000264640 FAM196AQ6ZSG2 479 aa10□□□□□ -0.81
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SMARCE1-201ENST00000264640 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa10□□□□□ -0.81
SMARCE1-201ENST00000264640 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
SMARCE1-201ENST00000264640 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa9.99□□□□□ -0.81
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SMARCE1-201ENST00000264640 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
SMARCE1-201ENST00000264640 C1QTNF8P60827 252 aa9.98□□□□□ -0.81
SMARCE1-201ENST00000264640 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP9.98□□□□□ -0.81
SMARCE1-201ENST00000264640 GSE1Q14687 1217 aa9.98□□□□□ -0.81
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SMARCE1-201ENST00000264640 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa9.98□□□□□ -0.81
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SMARCE1-201ENST00000264640 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
SMARCE1-201ENST00000264640 PIK3C2GO75747 1445 aa9.96□□□□□ -0.82
SMARCE1-201ENST00000264640 PEAK1Q9H792 1746 aa9.96□□□□□ -0.82
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SMARCE1-201ENST00000264640 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
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SMARCE1-201ENST00000264640 ITSN1Q15811 1721 aa9.94□□□□□ -0.82
SMARCE1-201ENST00000264640 ZBTB7AO95365 584 aa9.94□□□□□ -0.82
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SMARCE1-201ENST00000264640 AKAP12Q02952 1782 aa9.93□□□□□ -0.82
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SMARCE1-201ENST00000264640 ANKARQ7Z5J8 1434 aa9.93□□□□□ -0.82
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SMARCE1-201ENST00000264640 SSH2Q76I76 1423 aa9.92□□□□□ -0.82
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SMARCE1-201ENST00000264640 PTGER2P43116 358 aa9.91□□□□□ -0.82
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SMARCE1-201ENST00000264640 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
SMARCE1-201ENST00000264640 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
SMARCE1-201ENST00000264640 TULP4Q9NRJ4 1543 aa9.91□□□□□ -0.82
SMARCE1-201ENST00000264640 SHANK3Q9BYB0 1731 aa9.9□□□□□ -0.82
SMARCE1-201ENST00000264640 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa9.9□□□□□ -0.82
SMARCE1-201ENST00000264640 PRR36Q9H6K5 1346 aa9.9□□□□□ -0.82
SMARCE1-201ENST00000264640 NUTM2GQ5VZR2 741 aa9.9□□□□□ -0.82
SMARCE1-201ENST00000264640 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
SMARCE1-201ENST00000264640 BARGINQ6ZT62 677 aa9.89□□□□□ -0.83
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