RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264345.7

HERC3-201, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,764 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-201ENST00000264345 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa10.87□□□□□ -0.67
HERC3-201ENST00000264345 MCM2P49736 904 aa10.86□□□□□ -0.67
HERC3-201ENST00000264345 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP10.86□□□□□ -0.67
HERC3-201ENST00000264345 MED14O60244 1454 aa10.86□□□□□ -0.67
HERC3-201ENST00000264345 PTPRCP08575 1304 aa10.86□□□□□ -0.67
HERC3-201ENST00000264345 IL27Q8NEV9 243 aa10.86□□□□□ -0.67
HERC3-201ENST00000264345 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP10.86□□□□□ -0.67
HERC3-201ENST00000264345 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP10.86□□□□□ -0.67
HERC3-201ENST00000264345 USP32Q8NFA0 1604 aa10.86□□□□□ -0.67
HERC3-201ENST00000264345 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP10.86□□□□□ -0.67
HERC3-201ENST00000264345 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa10.86□□□□□ -0.67
HERC3-201ENST00000264345 KIF24Q5T7B8 1368 aa10.86□□□□□ -0.67
HERC3-201ENST00000264345 TRIM35Q9UPQ4 493 aa10.86□□□□□ -0.67
HERC3-201ENST00000264345 PHF14O94880 888 aa10.85□□□□□ -0.67
HERC3-201ENST00000264345 PTMAP06454 111 aaKnown RBP10.85□□□□□ -0.67
HERC3-201ENST00000264345 CCDC30Q5VVM6 783 aa10.85□□□□□ -0.67
HERC3-201ENST00000264345 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa10.85□□□□□ -0.67
HERC3-201ENST00000264345 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa10.85□□□□□ -0.67
HERC3-201ENST00000264345 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa10.85□□□□□ -0.67
HERC3-201ENST00000264345 WAPLQ7Z5K2 1190 aa10.85□□□□□ -0.67
HERC3-201ENST00000264345 SULT6B1Q6IMI4 303 aa10.85□□□□□ -0.67
HERC3-201ENST00000264345 FOXD4L1Q9NU39 408 aa10.85□□□□□ -0.67
HERC3-201ENST00000264345 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa10.85□□□□□ -0.67
HERC3-201ENST00000264345 ATP7BP35670 1465 aa10.85□□□□□ -0.67
HERC3-201ENST00000264345 ZBTB7CA1YPR0 619 aa10.85□□□□□ -0.67
HERC3-201ENST00000264345 PLEKHF1Q96S99 279 aa10.85□□□□□ -0.67
HERC3-201ENST00000264345 C1orf115Q9H7X2 142 aa10.85□□□□□ -0.67
HERC3-201ENST00000264345 POLKQ9UBT6 870 aa10.85□□□□□ -0.67
HERC3-201ENST00000264345 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP10.84□□□□□ -0.67
HERC3-201ENST00000264345 SIRT1Q96EB6 747 aa10.84□□□□□ -0.67
HERC3-201ENST00000264345 MBIPQ9NS73 344 aa10.84□□□□□ -0.67
HERC3-201ENST00000264345 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa10.84□□□□□ -0.67
HERC3-201ENST00000264345 NME9Q86XW9 330 aa10.84□□□□□ -0.67
HERC3-201ENST00000264345 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa10.84□□□□□ -0.67
HERC3-201ENST00000264345 GNAI2P04899 355 aa10.84□□□□□ -0.67
HERC3-201ENST00000264345 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa10.84□□□□□ -0.67
HERC3-201ENST00000264345 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP10.84□□□□□ -0.67
HERC3-201ENST00000264345 TNNQ9UQP3 1299 aa10.83□□□□□ -0.68
HERC3-201ENST00000264345 IQSEC2Q5JU85 1478 aa10.83□□□□□ -0.68
HERC3-201ENST00000264345 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa10.83□□□□□ -0.68
HERC3-201ENST00000264345 MYOM1P52179 1685 aa10.83□□□□□ -0.68
HERC3-201ENST00000264345 ERC2O15083 957 aa10.82□□□□□ -0.68
HERC3-201ENST00000264345 VAMP4O75379 141 aa10.82□□□□□ -0.68
HERC3-201ENST00000264345 SEC24BO95487 1268 aa10.82□□□□□ -0.68
HERC3-201ENST00000264345 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP10.82□□□□□ -0.68
HERC3-201ENST00000264345 RBM25P49756 843 aaKnown RBP10.81□□□□□ -0.68
HERC3-201ENST00000264345 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP10.81□□□□□ -0.68
HERC3-201ENST00000264345 SLC4A2P04920 1241 aa10.81□□□□□ -0.68
HERC3-201ENST00000264345 PPLO60437 1756 aa10.81□□□□□ -0.68
HERC3-201ENST00000264345 KCNJ4P48050 445 aa10.81□□□□□ -0.68
HERC3-201ENST00000264345 RUFY2Q8WXA3 655 aa10.81□□□□□ -0.68
HERC3-201ENST00000264345 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa10.81□□□□□ -0.68
HERC3-201ENST00000264345 AATKQ6ZMQ8 1374 aa10.81□□□□□ -0.68
HERC3-201ENST00000264345 FAM135BQ49AJ0 1406 aa10.8□□□□□ -0.68
HERC3-201ENST00000264345 GRPEL1Q9HAV7 217 aa10.8□□□□□ -0.68
HERC3-201ENST00000264345 TTC21AQ8NDW8 1320 aa10.8□□□□□ -0.68
HERC3-201ENST00000264345 RILPL2Q969X0 211 aa10.8□□□□□ -0.68
HERC3-201ENST00000264345 TNRQ92752 1358 aa10.8□□□□□ -0.68
HERC3-201ENST00000264345 ADGRB1O14514 1584 aa10.8□□□□□ -0.68
HERC3-201ENST00000264345 MROH2AA6NES4 1674 aa10.8□□□□□ -0.68
HERC3-201ENST00000264345 TULP4Q9NRJ4 1543 aa10.8□□□□□ -0.68
HERC3-201ENST00000264345 IL13P35225 146 aa10.8□□□□□ -0.68
HERC3-201ENST00000264345 CCDC173Q0VFZ6 552 aa10.8□□□□□ -0.68
HERC3-201ENST00000264345 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP10.8□□□□□ -0.68
HERC3-201ENST00000264345 MROH1Q8NDA8 1641 aa10.79□□□□□ -0.68
HERC3-201ENST00000264345 NUTM2FA1L443 756 aa10.79□□□□□ -0.68
HERC3-201ENST00000264345 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa10.79□□□□□ -0.68
HERC3-201ENST00000264345 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP10.79□□□□□ -0.68
HERC3-201ENST00000264345 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP10.79□□□□□ -0.68
HERC3-201ENST00000264345 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa10.79□□□□□ -0.68
HERC3-201ENST00000264345 MBD3O95983 291 aa10.79□□□□□ -0.68
HERC3-201ENST00000264345 TTC22Q5TAA0 569 aa10.79□□□□□ -0.68
HERC3-201ENST00000264345 LRRCC1Q9C099 1032 aa10.79□□□□□ -0.68
HERC3-201ENST00000264345 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP10.78□□□□□ -0.68
HERC3-201ENST00000264345 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP10.78□□□□□ -0.68
HERC3-201ENST00000264345 MCTP1Q6DN14 999 aa10.78□□□□□ -0.68
HERC3-201ENST00000264345 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP10.78□□□□□ -0.68
HERC3-201ENST00000264345 ANKRD44Q8N8A2 993 aa10.78□□□□□ -0.68
HERC3-201ENST00000264345 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP10.77□□□□□ -0.68
HERC3-201ENST00000264345 DCTPP1Q9H773 170 aa10.77□□□□□ -0.69
HERC3-201ENST00000264345 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP10.77□□□□□ -0.69
HERC3-201ENST00000264345 NLRP6P59044 892 aa10.77□□□□□ -0.69
HERC3-201ENST00000264345 TEFQ10587 303 aa10.77□□□□□ -0.69
HERC3-201ENST00000264345 C1orf141Q5JVX7 400 aa10.77□□□□□ -0.69
HERC3-201ENST00000264345 NASPP49321 788 aaPredicted RBP10.76□□□□□ -0.69
HERC3-201ENST00000264345 ANO2Q9NQ90 1003 aa10.76□□□□□ -0.69
HERC3-201ENST00000264345 YEATS2Q9ULM3 1422 aa10.76□□□□□ -0.69
HERC3-201ENST00000264345 ABCC4O15439 1325 aa10.76□□□□□ -0.69
HERC3-201ENST00000264345 DLC1Q96QB1 1528 aa10.76□□□□□ -0.69
HERC3-201ENST00000264345 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP10.76□□□□□ -0.69
HERC3-201ENST00000264345 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa10.76□□□□□ -0.69
HERC3-201ENST00000264345 PNPLA6Q8IY17 1366 aa10.76□□□□□ -0.69
HERC3-201ENST00000264345 GNAT3A8MTJ3 354 aa10.76□□□□□ -0.69
HERC3-201ENST00000264345 IFT172Q9UG01 1749 aa10.75□□□□□ -0.69
HERC3-201ENST00000264345 RAB11FIP3O75154 756 aa10.75□□□□□ -0.69
HERC3-201ENST00000264345 CNTROBQ8N137 903 aa10.75□□□□□ -0.69
HERC3-201ENST00000264345 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP10.75□□□□□ -0.69
HERC3-201ENST00000264345 KIAA0232Q92628 1395 aa10.75□□□□□ -0.69
HERC3-201ENST00000264345 KIAA2012Q0VF49 1180 aa10.75□□□□□ -0.69
HERC3-201ENST00000264345 PHACTR3Q96KR7 559 aa10.75□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 123.6 ms