RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264010.8

CTCF-201, Transcript of CCCTC-binding factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTCF, Length 3,939 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTCF-201ENST00000264010 PTPRMP28827 1452 aa20.35■□□□□ 0.85
CTCF-201ENST00000264010 C8orf34Q49A92 452 aa20.35■□□□□ 0.85
CTCF-201ENST00000264010 AGLP35573 1532 aa20.35■□□□□ 0.85
CTCF-201ENST00000264010 TMEM2Q9UHN6 1383 aa20.34■□□□□ 0.85
CTCF-201ENST00000264010 PREX1Q8TCU6 1659 aa20.34■□□□□ 0.85
CTCF-201ENST00000264010 HSCBQ8IWL3 235 aa20.34■□□□□ 0.85
CTCF-201ENST00000264010 RICTORQ6R327 1708 aa20.34■□□□□ 0.85
CTCF-201ENST00000264010 METP08581 1390 aa20.34■□□□□ 0.85
CTCF-201ENST00000264010 ATP7BP35670 1465 aa20.34■□□□□ 0.85
CTCF-201ENST00000264010 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa20.34■□□□□ 0.85
CTCF-201ENST00000264010 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa20.34■□□□□ 0.85
CTCF-201ENST00000264010 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
CTCF-201ENST00000264010 CFAP44Q96MT7 982 aa20.33■□□□□ 0.85
CTCF-201ENST00000264010 LNPKQ9C0E8 428 aa20.33■□□□□ 0.85
CTCF-201ENST00000264010 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
CTCF-201ENST00000264010 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa20.33■□□□□ 0.85
CTCF-201ENST00000264010 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa20.33■□□□□ 0.85
CTCF-201ENST00000264010 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa20.33■□□□□ 0.85
CTCF-201ENST00000264010 CASC1Q6TDU7 716 aa20.33■□□□□ 0.84
CTCF-201ENST00000264010 PHACTR3Q96KR7 559 aa20.32■□□□□ 0.84
CTCF-201ENST00000264010 IL13P35225 146 aa20.3■□□□□ 0.84
CTCF-201ENST00000264010 DIP2BQ9P265 1576 aa20.3■□□□□ 0.84
CTCF-201ENST00000264010 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa20.3■□□□□ 0.84
CTCF-201ENST00000264010 MED14O60244 1454 aa20.29■□□□□ 0.84
CTCF-201ENST00000264010 ZMYND15Q9H091 742 aa20.29■□□□□ 0.84
CTCF-201ENST00000264010 TSPYL4Q9UJ04 414 aa20.29■□□□□ 0.84
CTCF-201ENST00000264010 SLC4A10Q6U841 1118 aa20.29■□□□□ 0.84
CTCF-201ENST00000264010 HMMRO75330 724 aa20.29■□□□□ 0.84
CTCF-201ENST00000264010 DCTN1Q14203 1278 aa20.29■□□□□ 0.84
CTCF-201ENST00000264010 GAS2L2Q8NHY3 880 aa20.29■□□□□ 0.84
CTCF-201ENST00000264010 MBIPQ9NS73 344 aa20.29■□□□□ 0.84
CTCF-201ENST00000264010 GCC1Q96CN9 775 aa20.28■□□□□ 0.84
CTCF-201ENST00000264010 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
CTCF-201ENST00000264010 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
CTCF-201ENST00000264010 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
CTCF-201ENST00000264010 NUTM2GQ5VZR2 741 aa20.27■□□□□ 0.84
CTCF-201ENST00000264010 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa20.27■□□□□ 0.84
CTCF-201ENST00000264010 APBB1O00213 710 aa20.27■□□□□ 0.83
CTCF-201ENST00000264010 FAM135BQ49AJ0 1406 aa20.26■□□□□ 0.83
CTCF-201ENST00000264010 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
CTCF-201ENST00000264010 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
CTCF-201ENST00000264010 ABTB2Q8N961 1025 aa20.26■□□□□ 0.83
CTCF-201ENST00000264010 ARHGAP45Q92619 1136 aa20.26■□□□□ 0.83
CTCF-201ENST00000264010 C22orf23Q9BZE7 217 aa20.26■□□□□ 0.83
CTCF-201ENST00000264010 C1orf115Q9H7X2 142 aa20.26■□□□□ 0.83
CTCF-201ENST00000264010 TBX22Q9Y458 520 aa20.25■□□□□ 0.83
CTCF-201ENST00000264010 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa20.25■□□□□ 0.83
CTCF-201ENST00000264010 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
CTCF-201ENST00000264010 CHMP4AQ9BY43 222 aa20.25■□□□□ 0.83
CTCF-201ENST00000264010 USP32Q8NFA0 1604 aa20.25■□□□□ 0.83
CTCF-201ENST00000264010 TTC21AQ8NDW8 1320 aa20.25■□□□□ 0.83
CTCF-201ENST00000264010 NFKBIBQ15653 356 aa20.24■□□□□ 0.83
CTCF-201ENST00000264010 FAM83GA6ND36 823 aa20.24■□□□□ 0.83
CTCF-201ENST00000264010 VAMP4O75379 141 aa20.24■□□□□ 0.83
CTCF-201ENST00000264010 LTKP29376 864 aa20.24■□□□□ 0.83
CTCF-201ENST00000264010 DLC1Q96QB1 1528 aa20.24■□□□□ 0.83
CTCF-201ENST00000264010 CHD1LQ86WJ1 897 aa20.23■□□□□ 0.83
CTCF-201ENST00000264010 AATKQ6ZMQ8 1374 aa20.23■□□□□ 0.83
CTCF-201ENST00000264010 PSME1Q06323 249 aa20.23■□□□□ 0.83
CTCF-201ENST00000264010 ANKLE2Q86XL3 938 aa20.23■□□□□ 0.83
CTCF-201ENST00000264010 NCLP19338 710 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
CTCF-201ENST00000264010 MCM10Q7L590 875 aa20.23■□□□□ 0.83
CTCF-201ENST00000264010 IQSEC2Q5JU85 1478 aa20.23■□□□□ 0.83
CTCF-201ENST00000264010 PLEKHG3A1L390 1219 aa20.22■□□□□ 0.83
CTCF-201ENST00000264010 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa20.22■□□□□ 0.83
CTCF-201ENST00000264010 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
CTCF-201ENST00000264010 PNPLA6Q8IY17 1366 aa20.22■□□□□ 0.83
CTCF-201ENST00000264010 AEBP1Q8IUX7 1158 aa20.21■□□□□ 0.83
CTCF-201ENST00000264010 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa20.21■□□□□ 0.83
CTCF-201ENST00000264010 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa20.2■□□□□ 0.82
CTCF-201ENST00000264010 TPRNQ4KMQ1 711 aa20.2■□□□□ 0.82
CTCF-201ENST00000264010 TSPYL6Q8N831 410 aa20.2■□□□□ 0.82
CTCF-201ENST00000264010 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa20.19■□□□□ 0.82
CTCF-201ENST00000264010 ROBO2Q9HCK4 1378 aa20.19■□□□□ 0.82
CTCF-201ENST00000264010 C8orf58Q8NAV2 365 aa20.19■□□□□ 0.82
CTCF-201ENST00000264010 SLC4A2P04920 1241 aa20.18■□□□□ 0.82
CTCF-201ENST00000264010 PRR36Q9H6K5 1346 aa20.17■□□□□ 0.82
CTCF-201ENST00000264010 SMC5Q8IY18 1101 aa20.16■□□□□ 0.82
CTCF-201ENST00000264010 REREQ9P2R6 1566 aa20.15■□□□□ 0.82
CTCF-201ENST00000264010 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
CTCF-201ENST00000264010 NLRP1Q9C000 1473 aa20.15■□□□□ 0.82
CTCF-201ENST00000264010 ESCO1Q5FWF5 840 aa20.15■□□□□ 0.82
CTCF-201ENST00000264010 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.82
CTCF-201ENST00000264010 CCDC30Q5VVM6 783 aa20.14■□□□□ 0.81
CTCF-201ENST00000264010 NUCB1Q02818 461 aa20.14■□□□□ 0.81
CTCF-201ENST00000264010 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
CTCF-201ENST00000264010 NECTIN2Q92692 538 aa20.14■□□□□ 0.81
CTCF-201ENST00000264010 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
CTCF-201ENST00000264010 TBC1D32Q96NH3 1257 aa20.13■□□□□ 0.81
CTCF-201ENST00000264010 FLT4P35916 1363 aa20.13■□□□□ 0.81
CTCF-201ENST00000264010 TEFQ10587 303 aa20.13■□□□□ 0.81
CTCF-201ENST00000264010 MIS18AQ9NYP9 233 aa20.13■□□□□ 0.81
CTCF-201ENST00000264010 PHF8Q9UPP1 1060 aa20.13■□□□□ 0.81
CTCF-201ENST00000264010 CD163L1Q9NR16 1453 aa20.12■□□□□ 0.81
CTCF-201ENST00000264010 MAP3K19Q56UN5 1328 aa20.12■□□□□ 0.81
CTCF-201ENST00000264010 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
CTCF-201ENST00000264010 CDC45O75419 566 aa20.12■□□□□ 0.81
CTCF-201ENST00000264010 MYO5BQ9ULV0 1848 aa20.12■□□□□ 0.81
CTCF-201ENST00000264010 GOLGA6L22H0YM25 854 aa20.11■□□□□ 0.81
CTCF-201ENST00000264010 SEC24BO95487 1268 aa20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 83.4 ms