RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000255198.2

ZBED3-201, Transcript of zinc finger BED-type containing 3, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZBED3, Length 6,172 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3-201ENST00000255198 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa24.25■■□□□ 1.47
ZBED3-201ENST00000255198 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP24.25■■□□□ 1.47
ZBED3-201ENST00000255198 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa24.24■■□□□ 1.47
ZBED3-201ENST00000255198 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa24.24■■□□□ 1.47
ZBED3-201ENST00000255198 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP24.24■■□□□ 1.47
ZBED3-201ENST00000255198 TNMDQ9H2S6 317 aa24.24■■□□□ 1.47
ZBED3-201ENST00000255198 BICDL1Q6ZP65 573 aa24.24■■□□□ 1.47
ZBED3-201ENST00000255198 CDCA7LQ96GN5 454 aa24.24■■□□□ 1.47
ZBED3-201ENST00000255198 MBD3O95983 291 aa24.23■■□□□ 1.47
ZBED3-201ENST00000255198 MPHOSPH8Q99549 860 aa24.23■■□□□ 1.47
ZBED3-201ENST00000255198 CNTLNQ9NXG0 1405 aa24.23■■□□□ 1.47
ZBED3-201ENST00000255198 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa24.23■■□□□ 1.47
ZBED3-201ENST00000255198 JMYQ8N9B5 988 aa24.23■■□□□ 1.47
ZBED3-201ENST00000255198 ZNF76P36508 570 aa24.22■■□□□ 1.47
ZBED3-201ENST00000255198 SSR1P43307 286 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
ZBED3-201ENST00000255198 OSCARQ8IYS5 282 aa24.21■■□□□ 1.47
ZBED3-201ENST00000255198 CHMP4BP1P59074 171 aa24.21■■□□□ 1.47
ZBED3-201ENST00000255198 DACH1Q9UI36 760 aa24.21■■□□□ 1.47
ZBED3-201ENST00000255198 USP5P45974 858 aa24.2■■□□□ 1.47
ZBED3-201ENST00000255198 RABEP1Q15276 862 aa24.2■■□□□ 1.46
ZBED3-201ENST00000255198 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
ZBED3-201ENST00000255198 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
ZBED3-201ENST00000255198 CCDC57Q2TAC2 916 aa24.19■■□□□ 1.46
ZBED3-201ENST00000255198 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
ZBED3-201ENST00000255198 LRRCC1Q9C099 1032 aa24.19■■□□□ 1.46
ZBED3-201ENST00000255198 CCDC7Q96M83 1385 aa24.19■■□□□ 1.46
ZBED3-201ENST00000255198 TDO2P48775 406 aa24.18■■□□□ 1.46
ZBED3-201ENST00000255198 TXNDC2Q86VQ3 553 aa24.18■■□□□ 1.46
ZBED3-201ENST00000255198 RAI14Q9P0K7 980 aa24.18■■□□□ 1.46
ZBED3-201ENST00000255198 MCM2P49736 904 aa24.18■■□□□ 1.46
ZBED3-201ENST00000255198 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
ZBED3-201ENST00000255198 CCDC192P0DO97 292 aa24.18■■□□□ 1.46
ZBED3-201ENST00000255198 AACSQ86V21 672 aa24.17■■□□□ 1.46
ZBED3-201ENST00000255198 SULT6B1Q6IMI4 303 aa24.17■■□□□ 1.46
ZBED3-201ENST00000255198 KIAA0754O94854 1291 aa24.17■■□□□ 1.46
ZBED3-201ENST00000255198 PRAM1Q96QH2 718 aa24.16■■□□□ 1.46
ZBED3-201ENST00000255198 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
ZBED3-201ENST00000255198 AAMPQ13685 434 aa24.15■■□□□ 1.46
ZBED3-201ENST00000255198 PRDM2Q13029 1718 aa24.15■■□□□ 1.46
ZBED3-201ENST00000255198 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
ZBED3-201ENST00000255198 PIP4K2BP78356 416 aa24.15■■□□□ 1.46
ZBED3-201ENST00000255198 CCDC66A2RUB6 948 aa24.15■■□□□ 1.46
ZBED3-201ENST00000255198 AEBP1Q8IUX7 1158 aa24.15■■□□□ 1.46
ZBED3-201ENST00000255198 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
ZBED3-201ENST00000255198 GCC1Q96CN9 775 aa24.14■■□□□ 1.46
ZBED3-201ENST00000255198 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP24.14■■□□□ 1.46
ZBED3-201ENST00000255198 ANKRD1Q15327 319 aa24.14■■□□□ 1.46
ZBED3-201ENST00000255198 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP24.14■■□□□ 1.45
ZBED3-201ENST00000255198 UBAC1Q9BSL1 405 aa24.14■■□□□ 1.45
ZBED3-201ENST00000255198 CFAP70Q5T0N1 1121 aa24.13■■□□□ 1.45
ZBED3-201ENST00000255198 BCAR3O75815 825 aa24.13■■□□□ 1.45
ZBED3-201ENST00000255198 TAF3Q5VWG9 929 aa24.13■■□□□ 1.45
ZBED3-201ENST00000255198 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
ZBED3-201ENST00000255198 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa24.12■■□□□ 1.45
ZBED3-201ENST00000255198 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa24.12■■□□□ 1.45
ZBED3-201ENST00000255198 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
ZBED3-201ENST00000255198 PPP2R1AP30153 589 aa24.12■■□□□ 1.45
ZBED3-201ENST00000255198 EZRP15311 586 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
ZBED3-201ENST00000255198 CADPSQ9ULU8 1353 aa24.11■■□□□ 1.45
ZBED3-201ENST00000255198 PDRG1Q9NUG6 133 aa24.11■■□□□ 1.45
ZBED3-201ENST00000255198 BRPF3Q9ULD4 1205 aa24.11■■□□□ 1.45
ZBED3-201ENST00000255198 SPATA32Q96LK8 384 aa24.11■■□□□ 1.45
ZBED3-201ENST00000255198 SPG7Q9UQ90 795 aa24.11■■□□□ 1.45
ZBED3-201ENST00000255198 LRP2BPQ9P2M1 347 aa24.1■■□□□ 1.45
ZBED3-201ENST00000255198 KRT85P78386 507 aa24.1■■□□□ 1.45
ZBED3-201ENST00000255198 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
ZBED3-201ENST00000255198 CBFA2T2O43439 604 aa24.1■■□□□ 1.45
ZBED3-201ENST00000255198 CCT4P50991 539 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
ZBED3-201ENST00000255198 CEP57L1Q8IYX8 460 aa24.1■■□□□ 1.45
ZBED3-201ENST00000255198 TXLNBQ8N3L3 684 aa24.1■■□□□ 1.45
ZBED3-201ENST00000255198 CCDC112Q8NEF3 446 aa24.09■■□□□ 1.45
ZBED3-201ENST00000255198 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa24.09■■□□□ 1.45
ZBED3-201ENST00000255198 DESP17661 470 aa24.09■■□□□ 1.45
ZBED3-201ENST00000255198 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
ZBED3-201ENST00000255198 KIAA1328Q86T90 577 aa24.09■■□□□ 1.45
ZBED3-201ENST00000255198 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
ZBED3-201ENST00000255198 EIF5P55010 431 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.44
ZBED3-201ENST00000255198 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.44
ZBED3-201ENST00000255198 SCLT1Q96NL6 688 aa24.08■■□□□ 1.44
ZBED3-201ENST00000255198 IDH1O75874 414 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.44
ZBED3-201ENST00000255198 CDK19Q9BWU1 502 aa24.07■■□□□ 1.44
ZBED3-201ENST00000255198 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa24.07■■□□□ 1.44
ZBED3-201ENST00000255198 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa24.07■■□□□ 1.44
ZBED3-201ENST00000255198 WIZO95785 1651 aa24.07■■□□□ 1.44
ZBED3-201ENST00000255198 MYOM3Q5VTT5 1437 aa24.07■■□□□ 1.44
ZBED3-201ENST00000255198 BTBD11A6QL63 1104 aa24.07■■□□□ 1.44
ZBED3-201ENST00000255198 DDX11Q96FC9 970 aa24.07■■□□□ 1.44
ZBED3-201ENST00000255198 CDKL5O76039 1030 aa24.06■■□□□ 1.44
ZBED3-201ENST00000255198 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
ZBED3-201ENST00000255198 SRGAP3O43295 1099 aa24.06■■□□□ 1.44
ZBED3-201ENST00000255198 ERLIN1O75477 346 aa24.06■■□□□ 1.44
ZBED3-201ENST00000255198 CCDC102AQ96A19 550 aa24.05■■□□□ 1.44
ZBED3-201ENST00000255198 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
ZBED3-201ENST00000255198 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
ZBED3-201ENST00000255198 TAF4BQ92750 862 aa24.05■■□□□ 1.44
ZBED3-201ENST00000255198 ABCF2Q9UG63 623 aa24.04■■□□□ 1.44
ZBED3-201ENST00000255198 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa24.04■■□□□ 1.44
ZBED3-201ENST00000255198 CABP1Q9NZU7 370 aa24.04■■□□□ 1.44
ZBED3-201ENST00000255198 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa24.04■■□□□ 1.44
ZBED3-201ENST00000255198 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 67.8 ms