RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635152.1

BRF1-222, Transcript of BRF1, RNA polymerase III transcription initiation factor subunit, human

TSL 2

Gene BRF1, Length 2,876 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BRF1-222	ENST00000635152	UXT	Q9UBK9	157 aa	Predicted RBP	13.19	□□□□□ -0.3
BRF1-222	ENST00000635152	PCDHB8	Q9UN66	801 aa		13.19	□□□□□ -0.3
BRF1-222	ENST00000635152	TLR6	Q9Y2C9	796 aa		13.19	□□□□□ -0.3
BRF1-222	ENST00000635152	PIRT	P0C851	137 aa		13.19	□□□□□ -0.3
BRF1-222	ENST00000635152	POU4F1	Q01851	419 aa		13.19	□□□□□ -0.3
BRF1-222	ENST00000635152	HNRNPD	Q14103	355 aa	Known RBP	13.19	□□□□□ -0.3
BRF1-222	ENST00000635152	FAM83E	Q2M2I3	478 aa		13.19	□□□□□ -0.3
BRF1-222	ENST00000635152	OR13J1	Q8NGT2	312 aa		13.19	□□□□□ -0.3
BRF1-222	ENST00000635152	PTCD2	Q8WV60	388 aa	Known RBP	13.19	□□□□□ -0.3
BRF1-222	ENST00000635152	ANKRD49	Q8WVL7	239 aa		13.19	□□□□□ -0.3
BRF1-222	ENST00000635152	HDAC10	Q969S8	669 aa		13.19	□□□□□ -0.3
BRF1-222	ENST00000635152	IMP4	Q96G21	291 aa	Known RBP	13.19	□□□□□ -0.3
BRF1-222	ENST00000635152	NPAS2	Q99743	824 aa		13.19	□□□□□ -0.3
BRF1-222	ENST00000635152	IGSF5	Q9NSI5	407 aa		13.19	□□□□□ -0.3
BRF1-222	ENST00000635152	COPG1	Q9Y678	874 aa	Known RBP	13.19	□□□□□ -0.3
BRF1-222	ENST00000635152	TDRD15	B5MCY1	1934 aa	Known RBP	13.19	□□□□□ -0.3
BRF1-222	ENST00000635152	MAGEA13P	A6NCF6	341 aa		13.18	□□□□□ -0.3
BRF1-222	ENST00000635152	TADA2A	O75478	443 aa		13.18	□□□□□ -0.3
BRF1-222	ENST00000635152	SLC4A1	P02730	911 aa		13.18	□□□□□ -0.3
BRF1-222	ENST00000635152	AQP4	P55087	323 aa		13.18	□□□□□ -0.3
BRF1-222	ENST00000635152	PRAME	P78395	509 aa		13.18	□□□□□ -0.3
BRF1-222	ENST00000635152	NSUN2	Q08J23	767 aa	Known RBP eCLIP	13.18	□□□□□ -0.3
BRF1-222	ENST00000635152	ART3	Q13508	389 aa		13.18	□□□□□ -0.3
BRF1-222	ENST00000635152	GRAMD1B	Q3KR37	738 aa		13.18	□□□□□ -0.3
BRF1-222	ENST00000635152	FBXL22	Q6P050	247 aa		13.18	□□□□□ -0.3
BRF1-222	ENST00000635152	PIM3	Q86V86	326 aa		13.18	□□□□□ -0.3
BRF1-222	ENST00000635152	FAM156A	Q8NDB6	213 aa		13.18	□□□□□ -0.3
BRF1-222	ENST00000635152	RP9	Q8TA86	221 aa	Known RBP	13.18	□□□□□ -0.3
BRF1-222	ENST00000635152	JADE3	Q92613	823 aa		13.18	□□□□□ -0.3
BRF1-222	ENST00000635152	EXT2	Q93063	718 aa		13.18	□□□□□ -0.3
BRF1-222	ENST00000635152	RPRD1A	Q96P16	312 aa	Predicted RBP	13.18	□□□□□ -0.3
BRF1-222	ENST00000635152	PRKD2	Q9BZL6	878 aa		13.18	□□□□□ -0.3
BRF1-222	ENST00000635152	UPF3A	Q9H1J1	476 aa	Known RBP	13.18	□□□□□ -0.3
BRF1-222	ENST00000635152	VTI1B	Q9UEU0	232 aa		13.18	□□□□□ -0.3
BRF1-222	ENST00000635152	GTF3C5	Q9Y5Q8	519 aa	Predicted RBP	13.18	□□□□□ -0.3
BRF1-222	ENST00000635152	NYNRIN	Q9P2P1	1898 aa	Known RBP	13.18	□□□□□ -0.3
BRF1-222	ENST00000635152	KIF3C	O14782	793 aa		13.18	□□□□□ -0.3
BRF1-222	ENST00000635152	PRKAR2A	P13861	404 aa	Known RBP	13.18	□□□□□ -0.3
BRF1-222	ENST00000635152	XRCC1	P18887	633 aa	Predicted RBP	13.18	□□□□□ -0.3
BRF1-222	ENST00000635152	ATP5F1	P24539	256 aa	Predicted RBP	13.18	□□□□□ -0.3
BRF1-222	ENST00000635152	HTR7	P34969	479 aa		13.18	□□□□□ -0.3
BRF1-222	ENST00000635152	MRPS22	P82650	360 aa	Known RBP	13.18	□□□□□ -0.3
BRF1-222	ENST00000635152	C10orf120	Q5SQS8	335 aa		13.18	□□□□□ -0.3
BRF1-222	ENST00000635152	RYBP	Q8N488	228 aa	Predicted RBP	13.18	□□□□□ -0.3
BRF1-222	ENST00000635152	KLHDC9	Q8NEP7	349 aa		13.18	□□□□□ -0.3
BRF1-222	ENST00000635152	SLC39A13	Q96H72	371 aa		13.18	□□□□□ -0.3
BRF1-222	ENST00000635152	CNDP1	Q96KN2	507 aa		13.18	□□□□□ -0.3
BRF1-222	ENST00000635152	ZCWPW1	Q9H0M4	648 aa		13.18	□□□□□ -0.3
BRF1-222	ENST00000635152	CLIC5	Q9NZA1	410 aa		13.18	□□□□□ -0.3
BRF1-222	ENST00000635152	MARCH4	Q9P2E8	410 aa	Predicted RBP	13.18	□□□□□ -0.3
BRF1-222	ENST00000635152	SCML2	Q9UQR0	700 aa		13.18	□□□□□ -0.3
BRF1-222	ENST00000635152		A0A087X1B8	175 aa		13.18	□□□□□ -0.3
BRF1-222	ENST00000635152	ARHGEF37	A1IGU5	675 aa		13.18	□□□□□ -0.3
BRF1-222	ENST00000635152	EME2	A4GXA9	379 aa	Predicted RBP	13.18	□□□□□ -0.3
BRF1-222	ENST00000635152	LYN	P07948	512 aa		13.18	□□□□□ -0.3
BRF1-222	ENST00000635152	MMP2	P08253	660 aa		13.18	□□□□□ -0.3
BRF1-222	ENST00000635152	PRKAA2	P54646	552 aa		13.18	□□□□□ -0.3
BRF1-222	ENST00000635152	FCGRT	P55899	365 aa		13.18	□□□□□ -0.3
BRF1-222	ENST00000635152	LBR	Q14739	615 aa	Known RBP	13.18	□□□□□ -0.3
BRF1-222	ENST00000635152	VARS2	Q5ST30	1063 aa	Known RBP	13.18	□□□□□ -0.3
BRF1-222	ENST00000635152	GPR158	Q5T848	1215 aa		13.18	□□□□□ -0.3
BRF1-222	ENST00000635152	OR52E8	Q6IFG1	317 aa		13.18	□□□□□ -0.3
BRF1-222	ENST00000635152	BNC2	Q6ZN30	1099 aa	Predicted RBP	13.18	□□□□□ -0.3
BRF1-222	ENST00000635152	PIWIL4	Q7Z3Z4	852 aa	Known RBP	13.18	□□□□□ -0.3
BRF1-222	ENST00000635152	KBTBD6	Q86V97	674 aa		13.18	□□□□□ -0.3
BRF1-222	ENST00000635152	DCP1B	Q8IZD4	617 aa	Known RBP	13.18	□□□□□ -0.3
BRF1-222	ENST00000635152	UMODL1-AS1	Q8N2C9	162 aa		13.18	□□□□□ -0.3
BRF1-222	ENST00000635152	BLOC1S5	Q8TDH9	187 aa		13.18	□□□□□ -0.3
BRF1-222	ENST00000635152	FBXO32	Q969P5	355 aa		13.18	□□□□□ -0.3
BRF1-222	ENST00000635152	C1orf74	Q96LT6	269 aa		13.18	□□□□□ -0.3
BRF1-222	ENST00000635152	FAM193B	Q96PV7	902 aa	Predicted RBP	13.18	□□□□□ -0.3
BRF1-222	ENST00000635152	TUBGCP5	Q96RT8	1024 aa		13.18	□□□□□ -0.3
BRF1-222	ENST00000635152	ALG9	Q9H6U8	611 aa		13.18	□□□□□ -0.3
BRF1-222	ENST00000635152	MRM3	Q9HC36	420 aa	Known RBP	13.18	□□□□□ -0.3
BRF1-222	ENST00000635152	ZBTB26	Q9HCK0	441 aa		13.18	□□□□□ -0.3
BRF1-222	ENST00000635152	MYLK	Q15746	1914 aa		13.17	□□□□□ -0.3
BRF1-222	ENST00000635152		A8MT66	165 aa		13.17	□□□□□ -0.3
BRF1-222	ENST00000635152	SLCO1B7	G3V0H7	640 aa		13.17	□□□□□ -0.3
BRF1-222	ENST00000635152		H3BNX3	289 aa		13.17	□□□□□ -0.3
BRF1-222	ENST00000635152	TXNDC9	O14530	226 aa		13.17	□□□□□ -0.3
BRF1-222	ENST00000635152	RNASEH1	O60930	286 aa	Known RBP	13.17	□□□□□ -0.3
BRF1-222	ENST00000635152	RHOQ	P17081	205 aa		13.17	□□□□□ -0.3
BRF1-222	ENST00000635152	CALR	P27797	417 aa	Known RBP	13.17	□□□□□ -0.3
BRF1-222	ENST00000635152	ACVRL1	P37023	503 aa		13.17	□□□□□ -0.3
BRF1-222	ENST00000635152	DPP6	P42658	865 aa		13.17	□□□□□ -0.3
BRF1-222	ENST00000635152	CAP1	Q01518	475 aa		13.17	□□□□□ -0.3
BRF1-222	ENST00000635152	FLOT2	Q14254	428 aa		13.17	□□□□□ -0.3
BRF1-222	ENST00000635152	PPP1R3A	Q16821	1122 aa		13.17	□□□□□ -0.3
BRF1-222	ENST00000635152	CTXN3	Q4LDR2	81 aa		13.17	□□□□□ -0.3
BRF1-222	ENST00000635152	SIRPB2	Q5JXA9	342 aa		13.17	□□□□□ -0.3
BRF1-222	ENST00000635152	HECTD2	Q5U5R9	776 aa		13.17	□□□□□ -0.3
BRF1-222	ENST00000635152	AGAP9	Q5VTM2	703 aa		13.17	□□□□□ -0.3
BRF1-222	ENST00000635152	C16orf89	Q6UX73	402 aa		13.17	□□□□□ -0.3
BRF1-222	ENST00000635152	GK5	Q6ZS86	529 aa		13.17	□□□□□ -0.3
BRF1-222	ENST00000635152	LCA5	Q86VQ0	697 aa		13.17	□□□□□ -0.3
BRF1-222	ENST00000635152	CILP2	Q8IUL8	1156 aa		13.17	□□□□□ -0.3
BRF1-222	ENST00000635152	PGBD5	Q8N414	524 aa		13.17	□□□□□ -0.3
BRF1-222	ENST00000635152	MYEOV	Q96EZ4	313 aa		13.17	□□□□□ -0.3
BRF1-222	ENST00000635152	TBATA	Q96M53	351 aa		13.17	□□□□□ -0.3
BRF1-222	ENST00000635152	SEPT5	Q99719	369 aa	Predicted RBP	13.17	□□□□□ -0.3

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