RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000608295.5

HDDC2-204, Transcript of HD domain containing 2, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene HDDC2, Length 879 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDDC2-204ENST00000608295 CBFA2T3O75081 653 aa14.61□□□□□ -0.07
HDDC2-204ENST00000608295 PEX11BO96011 259 aa14.61□□□□□ -0.07
HDDC2-204ENST00000608295 PCCBP05166 539 aa14.61□□□□□ -0.07
HDDC2-204ENST00000608295 MAN1A1P33908 653 aa14.61□□□□□ -0.07
HDDC2-204ENST00000608295 NUDT1P36639 197 aa14.61□□□□□ -0.07
HDDC2-204ENST00000608295 MMP13P45452 471 aa14.61□□□□□ -0.07
HDDC2-204ENST00000608295 CLDN6P56747 220 aa14.61□□□□□ -0.07
HDDC2-204ENST00000608295 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
HDDC2-204ENST00000608295 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
HDDC2-204ENST00000608295 PTPRRQ15256 657 aa14.61□□□□□ -0.07
HDDC2-204ENST00000608295 IRF4Q15306 451 aa14.61□□□□□ -0.07
HDDC2-204ENST00000608295 DENND2CQ68D51 928 aa14.61□□□□□ -0.07
HDDC2-204ENST00000608295 NPNTQ6UXI9 565 aa14.61□□□□□ -0.07
HDDC2-204ENST00000608295 RFX6Q8HWS3 928 aa14.61□□□□□ -0.07
HDDC2-204ENST00000608295 PQLC3Q8N755 202 aa14.61□□□□□ -0.07
HDDC2-204ENST00000608295 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
HDDC2-204ENST00000608295 RAB7BQ96AH8 199 aa14.61□□□□□ -0.07
HDDC2-204ENST00000608295 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa14.61□□□□□ -0.07
HDDC2-204ENST00000608295 SCNM1Q9BWG6 230 aa14.61□□□□□ -0.07
HDDC2-204ENST00000608295 CEP41Q9BYV8 373 aa14.61□□□□□ -0.07
HDDC2-204ENST00000608295 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
HDDC2-204ENST00000608295 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
HDDC2-204ENST00000608295 UCKL1Q9NWZ5 548 aa14.61□□□□□ -0.07
HDDC2-204ENST00000608295 DNAJC28Q9NX36 388 aa14.61□□□□□ -0.07
HDDC2-204ENST00000608295 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
HDDC2-204ENST00000608295 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa14.61□□□□□ -0.07
HDDC2-204ENST00000608295 HEY1Q9Y5J3 304 aa14.61□□□□□ -0.07
HDDC2-204ENST00000608295 A0A0U1RQS6 177 aa14.6□□□□□ -0.07
HDDC2-204ENST00000608295 FPGTO14772 594 aa14.6□□□□□ -0.07
HDDC2-204ENST00000608295 NEBLO76041 1014 aa14.6□□□□□ -0.07
HDDC2-204ENST00000608295 TM7SF2O76062 418 aa14.6□□□□□ -0.07
HDDC2-204ENST00000608295 CPP00450 1065 aa14.6□□□□□ -0.07
HDDC2-204ENST00000608295 C6P13671 934 aa14.6□□□□□ -0.07
HDDC2-204ENST00000608295 COMTP21964 271 aa14.6□□□□□ -0.07
HDDC2-204ENST00000608295 KDELR1P24390 212 aa14.6□□□□□ -0.07
HDDC2-204ENST00000608295 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
HDDC2-204ENST00000608295 MMP12P39900 470 aa14.6□□□□□ -0.07
HDDC2-204ENST00000608295 GARSP41250 739 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
HDDC2-204ENST00000608295 MARCKSL1P49006 195 aa14.6□□□□□ -0.07
HDDC2-204ENST00000608295 AP1S1P61966 158 aa14.6□□□□□ -0.07
HDDC2-204ENST00000608295 ELP6Q0PNE2 266 aa14.6□□□□□ -0.07
HDDC2-204ENST00000608295 GALNT2Q10471 571 aa14.6□□□□□ -0.07
HDDC2-204ENST00000608295 TRAF2Q12933 501 aa14.6□□□□□ -0.07
HDDC2-204ENST00000608295 DNAJC3Q13217 504 aa14.6□□□□□ -0.07
HDDC2-204ENST00000608295 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
HDDC2-204ENST00000608295 PDK2Q15119 407 aa14.6□□□□□ -0.07
HDDC2-204ENST00000608295 UGP2Q16851 508 aa14.6□□□□□ -0.07
HDDC2-204ENST00000608295 ODF2Q5BJF6 829 aa14.6□□□□□ -0.07
HDDC2-204ENST00000608295 MARC1Q5VT66 337 aa14.6□□□□□ -0.07
HDDC2-204ENST00000608295 ERAP2Q6P179 960 aa14.6□□□□□ -0.07
HDDC2-204ENST00000608295 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
HDDC2-204ENST00000608295 SLCO6A1Q86UG4 719 aa14.6□□□□□ -0.07
HDDC2-204ENST00000608295 MARCH9Q86YJ5 346 aa14.6□□□□□ -0.07
HDDC2-204ENST00000608295 BBS5Q8N3I7 341 aa14.6□□□□□ -0.07
HDDC2-204ENST00000608295 CCNYQ8ND76 341 aa14.6□□□□□ -0.07
HDDC2-204ENST00000608295 ACRBPQ8NEB7 543 aa14.6□□□□□ -0.07
HDDC2-204ENST00000608295 FAM71BQ8TC56 605 aa14.6□□□□□ -0.07
HDDC2-204ENST00000608295 BMFQ96LC9 184 aa14.6□□□□□ -0.07
HDDC2-204ENST00000608295 PSKH2Q96QS6 385 aa14.6□□□□□ -0.07
HDDC2-204ENST00000608295 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa14.6□□□□□ -0.07
HDDC2-204ENST00000608295 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
HDDC2-204ENST00000608295 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa14.6□□□□□ -0.07
HDDC2-204ENST00000608295 NOD2Q9HC29 1040 aa14.6□□□□□ -0.07
HDDC2-204ENST00000608295 DKK3Q9UBP4 350 aa14.6□□□□□ -0.07
HDDC2-204ENST00000608295 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa14.6□□□□□ -0.07
HDDC2-204ENST00000608295 TSPAN11A1L157 253 aa14.59□□□□□ -0.07
HDDC2-204ENST00000608295 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
HDDC2-204ENST00000608295 PCDHGA12O60330 932 aa14.59□□□□□ -0.07
HDDC2-204ENST00000608295 MAGEC1O60732 1142 aa14.59□□□□□ -0.07
HDDC2-204ENST00000608295 MYF5P13349 255 aa14.59□□□□□ -0.07
HDDC2-204ENST00000608295 CTPS1P17812 591 aa14.59□□□□□ -0.07
HDDC2-204ENST00000608295 LIG3P49916 1009 aa14.59□□□□□ -0.07
HDDC2-204ENST00000608295 RENBPP51606 427 aa14.59□□□□□ -0.07
HDDC2-204ENST00000608295 DSC2Q02487 901 aa14.59□□□□□ -0.07
HDDC2-204ENST00000608295 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
HDDC2-204ENST00000608295 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
HDDC2-204ENST00000608295 SPA17Q15506 151 aa14.59□□□□□ -0.07
HDDC2-204ENST00000608295 INAVAQ3KP66 663 aa14.59□□□□□ -0.07
HDDC2-204ENST00000608295 KAZNQ674X7 775 aa14.59□□□□□ -0.07
HDDC2-204ENST00000608295 BRAT1Q6PJG6 821 aa14.59□□□□□ -0.07
HDDC2-204ENST00000608295 RAD9BQ6WBX8 426 aa14.59□□□□□ -0.07
HDDC2-204ENST00000608295 NYAP1Q6ZVC0 841 aa14.59□□□□□ -0.07
HDDC2-204ENST00000608295 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa14.59□□□□□ -0.07
HDDC2-204ENST00000608295 IQCHQ86VS3 1027 aa14.59□□□□□ -0.07
HDDC2-204ENST00000608295 MAP7D3Q8IWC1 876 aa14.59□□□□□ -0.07
HDDC2-204ENST00000608295 RBFAQ8N0V3 343 aa14.59□□□□□ -0.07
HDDC2-204ENST00000608295 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
HDDC2-204ENST00000608295 SAP25Q8TEE9 199 aa14.59□□□□□ -0.07
HDDC2-204ENST00000608295 HAUS1Q96CS2 278 aa14.59□□□□□ -0.07
HDDC2-204ENST00000608295 CNDP2Q96KP4 475 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
HDDC2-204ENST00000608295 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
HDDC2-204ENST00000608295 SMIM14Q96QK8 99 aa14.59□□□□□ -0.07
HDDC2-204ENST00000608295 MGME1Q9BQP7 344 aa14.59□□□□□ -0.07
HDDC2-204ENST00000608295 SEPT10Q9P0V9 454 aa14.59□□□□□ -0.07
HDDC2-204ENST00000608295 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa14.59□□□□□ -0.07
HDDC2-204ENST00000608295 PTPRBP23467 1997 aa14.59□□□□□ -0.07
HDDC2-204ENST00000608295 RCCD1A6NED2 376 aa14.58□□□□□ -0.08
HDDC2-204ENST00000608295 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa14.58□□□□□ -0.08
HDDC2-204ENST00000608295 KCNK1O00180 336 aa14.58□□□□□ -0.08
HDDC2-204ENST00000608295 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.8 ms