RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577409.1

CNDP2-204, Transcript of carnosine dipeptidase 2, humanhuman

TSL 2

Gene CNDP2, Length 422 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNDP2-204ENST00000577409 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP21.11■□□□□ 0.97
CNDP2-204ENST00000577409 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa21.11■□□□□ 0.97
CNDP2-204ENST00000577409 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa21.11■□□□□ 0.97
CNDP2-204ENST00000577409 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP21.1■□□□□ 0.97
CNDP2-204ENST00000577409 KCNK1O00180 336 aa21.1■□□□□ 0.97
CNDP2-204ENST00000577409 VILLO15195 856 aa21.1■□□□□ 0.97
CNDP2-204ENST00000577409 RAD51BO15315 384 aa21.1■□□□□ 0.97
CNDP2-204ENST00000577409 TSPAN6O43657 245 aa21.1■□□□□ 0.97
CNDP2-204ENST00000577409 CCNB1P14635 433 aa21.1■□□□□ 0.97
CNDP2-204ENST00000577409 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP21.1■□□□□ 0.97
CNDP2-204ENST00000577409 SERPINA4P29622 427 aa21.1■□□□□ 0.97
CNDP2-204ENST00000577409 RPS21P63220 83 aaKnown RBP21.1■□□□□ 0.97
CNDP2-204ENST00000577409 BCL2L1Q07817 233 aa21.1■□□□□ 0.97
CNDP2-204ENST00000577409 UGP2Q16851 508 aa21.1■□□□□ 0.97
CNDP2-204ENST00000577409 HLA-BQ31612 363 aa21.1■□□□□ 0.97
CNDP2-204ENST00000577409 UAP1L1Q3KQV9 507 aa21.1■□□□□ 0.97
CNDP2-204ENST00000577409 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP21.1■□□□□ 0.97
CNDP2-204ENST00000577409 TFDP3Q5H9I0 405 aa21.1■□□□□ 0.97
CNDP2-204ENST00000577409 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP21.1■□□□□ 0.97
CNDP2-204ENST00000577409 CCDC112Q8NEF3 446 aa21.1■□□□□ 0.97
CNDP2-204ENST00000577409 HEMGNQ9BXL5 484 aa21.1■□□□□ 0.97
CNDP2-204ENST00000577409 SCUBE2Q9NQ36 999 aa21.1■□□□□ 0.97
CNDP2-204ENST00000577409 DMTF1Q9Y222 760 aa21.1■□□□□ 0.97
CNDP2-204ENST00000577409 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP21.1■□□□□ 0.97
CNDP2-204ENST00000577409 UPK3BL1B0FP48 263 aa21.09■□□□□ 0.97
CNDP2-204ENST00000577409 UPK3BL2E5RIL1 263 aa21.09■□□□□ 0.97
CNDP2-204ENST00000577409 NEMP1O14524 444 aa21.09■□□□□ 0.97
CNDP2-204ENST00000577409 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP21.09■□□□□ 0.97
CNDP2-204ENST00000577409 MMP20O60882 483 aa21.09■□□□□ 0.97
CNDP2-204ENST00000577409 FTCDO95954 541 aa21.09■□□□□ 0.97
CNDP2-204ENST00000577409 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP21.09■□□□□ 0.97
CNDP2-204ENST00000577409 JCHAINP01591 159 aa21.09■□□□□ 0.97
CNDP2-204ENST00000577409 HLA-DQB2P05538 268 aa21.09■□□□□ 0.97
CNDP2-204ENST00000577409 CD38P28907 300 aa21.09■□□□□ 0.97
CNDP2-204ENST00000577409 CTSKP43235 329 aa21.09■□□□□ 0.97
CNDP2-204ENST00000577409 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP21.09■□□□□ 0.97
CNDP2-204ENST00000577409 DSC2Q02487 901 aa21.09■□□□□ 0.97
CNDP2-204ENST00000577409 NIPAL4Q0D2K0 466 aa21.09■□□□□ 0.97
CNDP2-204ENST00000577409 TRAF2Q12933 501 aa21.09■□□□□ 0.97
CNDP2-204ENST00000577409 ZBTB17Q13105 803 aa21.09■□□□□ 0.97
CNDP2-204ENST00000577409 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP21.09■□□□□ 0.97
CNDP2-204ENST00000577409 TEAD4Q15561 434 aa21.09■□□□□ 0.97
CNDP2-204ENST00000577409 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa21.09■□□□□ 0.97
CNDP2-204ENST00000577409 AADACL2Q6P093 401 aa21.09■□□□□ 0.97
CNDP2-204ENST00000577409 BRAT1Q6PJG6 821 aa21.09■□□□□ 0.97
CNDP2-204ENST00000577409 KDM7AQ6ZMT4 941 aa21.09■□□□□ 0.97
CNDP2-204ENST00000577409 BBS5Q8N3I7 341 aa21.09■□□□□ 0.97
CNDP2-204ENST00000577409 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP21.09■□□□□ 0.97
CNDP2-204ENST00000577409 CNTD1Q8N815 330 aa21.09■□□□□ 0.97
CNDP2-204ENST00000577409 ARRDC2Q8TBH0 407 aa21.09■□□□□ 0.97
CNDP2-204ENST00000577409 SEMA3CQ99985 751 aa21.09■□□□□ 0.97
CNDP2-204ENST00000577409 RTKNQ9BST9 563 aa21.09■□□□□ 0.97
CNDP2-204ENST00000577409 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa21.09■□□□□ 0.97
CNDP2-204ENST00000577409 SLC17A9Q9BYT1 436 aa21.09■□□□□ 0.97
CNDP2-204ENST00000577409 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa21.09■□□□□ 0.97
CNDP2-204ENST00000577409 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP21.09■□□□□ 0.97
CNDP2-204ENST00000577409 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP21.09■□□□□ 0.97
CNDP2-204ENST00000577409 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP21.09■□□□□ 0.97
CNDP2-204ENST00000577409 CACNA1AO00555 2505 aa21.09■□□□□ 0.97
CNDP2-204ENST00000577409 PRAMEF26H0Y7S4 382 aa21.08■□□□□ 0.97
CNDP2-204ENST00000577409 H0Y8X5 98 aa21.08■□□□□ 0.97
CNDP2-204ENST00000577409 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP21.08■□□□□ 0.97
CNDP2-204ENST00000577409 NUDT1P36639 197 aa21.08■□□□□ 0.97
CNDP2-204ENST00000577409 CLDN2P57739 230 aa21.08■□□□□ 0.97
CNDP2-204ENST00000577409 TFDP2Q14188 446 aa21.08■□□□□ 0.97
CNDP2-204ENST00000577409 PDK1Q15118 436 aa21.08■□□□□ 0.97
CNDP2-204ENST00000577409 PPP2R5EQ16537 467 aa21.08■□□□□ 0.97
CNDP2-204ENST00000577409 TMEM52BQ4KMG9 183 aa21.08■□□□□ 0.97
CNDP2-204ENST00000577409 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa21.08■□□□□ 0.97
CNDP2-204ENST00000577409 ALG1LQ6GMV1 187 aa21.08■□□□□ 0.97
CNDP2-204ENST00000577409 CCDC50Q8IVM0 306 aa21.08■□□□□ 0.97
CNDP2-204ENST00000577409 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP21.08■□□□□ 0.97
CNDP2-204ENST00000577409 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP21.08■□□□□ 0.97
CNDP2-204ENST00000577409 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP21.08■□□□□ 0.97
CNDP2-204ENST00000577409 IL12RB2Q99665 862 aa21.08■□□□□ 0.97
CNDP2-204ENST00000577409 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP21.08■□□□□ 0.97
CNDP2-204ENST00000577409 CEP41Q9BYV8 373 aa21.08■□□□□ 0.97
CNDP2-204ENST00000577409 GAREM1Q9H706 876 aa21.08■□□□□ 0.97
CNDP2-204ENST00000577409 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa21.08■□□□□ 0.97
CNDP2-204ENST00000577409 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP21.07■□□□□ 0.96
CNDP2-204ENST00000577409 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP21.07■□□□□ 0.96
CNDP2-204ENST00000577409 CCDC66A2RUB6 948 aa21.07■□□□□ 0.96
CNDP2-204ENST00000577409 TLR4O00206 839 aa21.07■□□□□ 0.96
CNDP2-204ENST00000577409 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP21.07■□□□□ 0.96
CNDP2-204ENST00000577409 PYGMP11217 842 aa21.07■□□□□ 0.96
CNDP2-204ENST00000577409 SDHBP21912 280 aa21.07■□□□□ 0.96
CNDP2-204ENST00000577409 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP21.07■□□□□ 0.96
CNDP2-204ENST00000577409 ITKQ08881 620 aa21.07■□□□□ 0.96
CNDP2-204ENST00000577409 AP1B1Q10567 949 aa21.07■□□□□ 0.96
CNDP2-204ENST00000577409 PTPRRQ15256 657 aa21.07■□□□□ 0.96
CNDP2-204ENST00000577409 GCNT7Q6ZNI0 430 aa21.07■□□□□ 0.96
CNDP2-204ENST00000577409 PEX26Q7Z412 305 aa21.07■□□□□ 0.96
CNDP2-204ENST00000577409 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP21.07■□□□□ 0.96
CNDP2-204ENST00000577409 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP21.07■□□□□ 0.96
CNDP2-204ENST00000577409 TXLNBQ8N3L3 684 aa21.07■□□□□ 0.96
CNDP2-204ENST00000577409 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP21.07■□□□□ 0.96
CNDP2-204ENST00000577409 MFSD2AQ8NA29 543 aa21.07■□□□□ 0.96
CNDP2-204ENST00000577409 HAUS1Q96CS2 278 aa21.07■□□□□ 0.96
CNDP2-204ENST00000577409 AMFRQ9UKV5 643 aa21.07■□□□□ 0.96
CNDP2-204ENST00000577409 GUCA1BQ9UMX6 200 aa21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.3 ms