RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563200.5

PPP4C-205, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, human

TSL 5

Gene PPP4C, Length 1,447 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP4C-205	ENST00000563200	CAMK1D	Q8IU85	385 aa		21.99	■■□□□ 1.11
PPP4C-205	ENST00000563200	FAM71B	Q8TC56	605 aa		21.99	■■□□□ 1.11
PPP4C-205	ENST00000563200	NSMCE3	Q96MG7	304 aa		21.99	■■□□□ 1.11
PPP4C-205	ENST00000563200	SP110	Q9HB58	689 aa		21.99	■■□□□ 1.11
PPP4C-205	ENST00000563200	PCDH18	Q9HCL0	1135 aa		21.99	■■□□□ 1.11
PPP4C-205	ENST00000563200	ZFYVE26	Q68DK2	2539 aa		21.98	■■□□□ 1.11
PPP4C-205	ENST00000563200	MYO1F	O00160	1098 aa		21.98	■■□□□ 1.11
PPP4C-205	ENST00000563200	CBFA2T2	O43439	604 aa		21.98	■■□□□ 1.11
PPP4C-205	ENST00000563200	MMP20	O60882	483 aa		21.98	■■□□□ 1.11
PPP4C-205	ENST00000563200	PIAS2	O75928	621 aa		21.98	■■□□□ 1.11
PPP4C-205	ENST00000563200	C1S	P09871	688 aa		21.98	■■□□□ 1.11
PPP4C-205	ENST00000563200	IL4R	P24394	825 aa		21.98	■■□□□ 1.11
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC18A3	Q16572	532 aa		21.98	■■□□□ 1.11
PPP4C-205	ENST00000563200	BRAT1	Q6PJG6	821 aa		21.98	■■□□□ 1.11
PPP4C-205	ENST00000563200	DHRS13	Q6UX07	377 aa		21.98	■■□□□ 1.11
PPP4C-205	ENST00000563200	VSTM4	Q8IW00	320 aa		21.98	■■□□□ 1.11
PPP4C-205	ENST00000563200	GALNT15	Q8N3T1	639 aa		21.98	■■□□□ 1.11
PPP4C-205	ENST00000563200	OR8K1	Q8NGG5	319 aa		21.98	■■□□□ 1.11
PPP4C-205	ENST00000563200	PSKH2	Q96QS6	385 aa		21.98	■■□□□ 1.11
PPP4C-205	ENST00000563200	SIGLEC6	O43699	453 aa		21.97	■■□□□ 1.11
PPP4C-205	ENST00000563200	TM7SF2	O76062	418 aa		21.97	■■□□□ 1.11
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC10A7	Q0GE19	358 aa		21.97	■■□□□ 1.11
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF211	Q13398	564 aa	Predicted RBP	21.97	■■□□□ 1.11
PPP4C-205	ENST00000563200	TRIM14	Q14142	442 aa		21.97	■■□□□ 1.11
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF542P	Q5EBM4	170 aa		21.97	■■□□□ 1.11
PPP4C-205	ENST00000563200	TMCO3	Q6UWJ1	677 aa		21.97	■■□□□ 1.11
PPP4C-205	ENST00000563200	MARCH9	Q86YJ5	346 aa		21.97	■■□□□ 1.11
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF564	Q8TBZ8	553 aa	Predicted RBP	21.97	■■□□□ 1.11
PPP4C-205	ENST00000563200	CXorf40A	Q8TE69	158 aa		21.97	■■□□□ 1.11
PPP4C-205	ENST00000563200	ECHDC3	Q96DC8	303 aa		21.97	■■□□□ 1.11
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF599	Q96NL3	588 aa		21.97	■■□□□ 1.11
PPP4C-205	ENST00000563200	WRAP53	Q9BUR4	548 aa	Known RBP	21.97	■■□□□ 1.11
PPP4C-205	ENST00000563200	CINP	Q9BW66	212 aa	Predicted RBP	21.97	■■□□□ 1.11
PPP4C-205	ENST00000563200	TSPY26P	Q9H489	355 aa		21.97	■■□□□ 1.11
PPP4C-205	ENST00000563200	PCDH12	Q9NPG4	1184 aa		21.97	■■□□□ 1.11
PPP4C-205	ENST00000563200	KLF15	Q9UIH9	416 aa		21.97	■■□□□ 1.11
PPP4C-205	ENST00000563200	RIOK3	O14730	519 aa	Known RBP	21.97	■■□□□ 1.11
PPP4C-205	ENST00000563200	RFPL3	O75679	317 aa		21.97	■■□□□ 1.11
PPP4C-205	ENST00000563200	CDK4	P11802	303 aa		21.97	■■□□□ 1.11
PPP4C-205	ENST00000563200	NME1	P15531	152 aa	Known RBP	21.97	■■□□□ 1.11
PPP4C-205	ENST00000563200	CKMT2	P17540	419 aa		21.97	■■□□□ 1.11
PPP4C-205	ENST00000563200	IGFALS	P35858	605 aa		21.97	■■□□□ 1.11
PPP4C-205	ENST00000563200	ARSE	P51690	589 aa		21.97	■■□□□ 1.11
PPP4C-205	ENST00000563200	ELP6	Q0PNE2	266 aa		21.97	■■□□□ 1.11
PPP4C-205	ENST00000563200	CAMK2B	Q13554	666 aa		21.97	■■□□□ 1.11
PPP4C-205	ENST00000563200	PDE1C	Q14123	709 aa	Predicted RBP	21.97	■■□□□ 1.11
PPP4C-205	ENST00000563200	LBR	Q14739	615 aa	Known RBP	21.97	■■□□□ 1.11
PPP4C-205	ENST00000563200	CCDC157	Q569K6	752 aa		21.97	■■□□□ 1.11
PPP4C-205	ENST00000563200	TMCO4	Q5TGY1	634 aa		21.97	■■□□□ 1.11
PPP4C-205	ENST00000563200	PARG	Q86W56	976 aa		21.97	■■□□□ 1.11
PPP4C-205	ENST00000563200	CPNE8	Q86YQ8	564 aa		21.97	■■□□□ 1.11
PPP4C-205	ENST00000563200	TP53I13	Q8NBR0	393 aa	Predicted RBP	21.97	■■□□□ 1.11
PPP4C-205	ENST00000563200	OR4C6	Q8NH72	309 aa		21.97	■■□□□ 1.11
PPP4C-205	ENST00000563200	ZCCHC14	Q8WYQ9	949 aa	Known RBP	21.97	■■□□□ 1.11
PPP4C-205	ENST00000563200	PACSIN1	Q9BY11	444 aa		21.97	■■□□□ 1.11
PPP4C-205	ENST00000563200	ATP13A3	Q9H7F0	1226 aa		21.97	■■□□□ 1.11
PPP4C-205	ENST00000563200	RCOR3	Q9P2K3	495 aa	Predicted RBP	21.97	■■□□□ 1.11
PPP4C-205	ENST00000563200	SHROOM3	Q8TF72	1996 aa		21.96	■■□□□ 1.11
PPP4C-205	ENST00000563200	ITPR1	Q14643	2758 aa		21.96	■■□□□ 1.11
PPP4C-205	ENST00000563200	SSU72P8	A0A1W2PR75	194 aa		21.96	■■□□□ 1.11
PPP4C-205	ENST00000563200	TRAFD1	O14545	582 aa	Predicted RBP	21.96	■■□□□ 1.11
PPP4C-205	ENST00000563200	MAFK	O60675	156 aa		21.96	■■□□□ 1.11
PPP4C-205	ENST00000563200	CSF2	P04141	144 aa		21.96	■■□□□ 1.11
PPP4C-205	ENST00000563200	SERPINA4	P29622	427 aa		21.96	■■□□□ 1.11
PPP4C-205	ENST00000563200	MMP12	P39900	470 aa		21.96	■■□□□ 1.11
PPP4C-205	ENST00000563200	MBNL1	Q9NR56	388 aa	Known RBP	21.96	■■□□□ 1.11
PPP4C-205	ENST00000563200	DNAJC28	Q9NX36	388 aa		21.96	■■□□□ 1.11
PPP4C-205	ENST00000563200	UVRAG	Q9P2Y5	699 aa		21.96	■■□□□ 1.11
PPP4C-205	ENST00000563200	SEPT3	Q9UH03	358 aa		21.96	■■□□□ 1.11
PPP4C-205	ENST00000563200	PROSC	O94903	275 aa		21.95	■■□□□ 1.1
PPP4C-205	ENST00000563200	CD48	P09326	243 aa		21.95	■■□□□ 1.1
PPP4C-205	ENST00000563200	CR2	P20023	1033 aa		21.95	■■□□□ 1.1
PPP4C-205	ENST00000563200	XPA	P23025	273 aa	Predicted RBP	21.95	■■□□□ 1.1
PPP4C-205	ENST00000563200	ACP1	P24666	158 aa		21.95	■■□□□ 1.1
PPP4C-205	ENST00000563200	HNRNPK	P61978	463 aa	Known RBP eCLIP	21.95	■■□□□ 1.1
PPP4C-205	ENST00000563200	EIF2B5	Q13144	721 aa	Known RBP	21.95	■■□□□ 1.1
PPP4C-205	ENST00000563200	ILK	Q13418	452 aa		21.95	■■□□□ 1.1
PPP4C-205	ENST00000563200	AGER	Q15109	404 aa		21.95	■■□□□ 1.1
PPP4C-205	ENST00000563200	TMPRSS12	Q86WS5	348 aa		21.95	■■□□□ 1.1
PPP4C-205	ENST00000563200	SPOCK2	Q92563	424 aa		21.95	■■□□□ 1.1
PPP4C-205	ENST00000563200	PNMA8B	Q9ULN7	279 aa	Predicted RBP	21.95	■■□□□ 1.1
PPP4C-205	ENST00000563200	ATP8A1	Q9Y2Q0	1164 aa		21.95	■■□□□ 1.1
PPP4C-205	ENST00000563200	FAM208B	Q5VWN6	2430 aa		21.94	■■□□□ 1.1
PPP4C-205	ENST00000563200	FAM149A	A5PLN7	773 aa		21.94	■■□□□ 1.1
PPP4C-205	ENST00000563200	TAF4	O00268	1085 aa		21.94	■■□□□ 1.1
PPP4C-205	ENST00000563200	SCAMP1	O15126	338 aa		21.94	■■□□□ 1.1
PPP4C-205	ENST00000563200	H2AFZ	P0C0S5	128 aa		21.94	■■□□□ 1.1
PPP4C-205	ENST00000563200	C6	P13671	934 aa		21.94	■■□□□ 1.1
PPP4C-205	ENST00000563200	RENBP	P51606	427 aa		21.94	■■□□□ 1.1
PPP4C-205	ENST00000563200	CDH6	P55285	790 aa		21.94	■■□□□ 1.1
PPP4C-205	ENST00000563200	AP1S1	P61966	158 aa		21.94	■■□□□ 1.1
PPP4C-205	ENST00000563200	YPEL5	P62699	121 aa		21.94	■■□□□ 1.1
PPP4C-205	ENST00000563200	ATP13A4	Q4VNC1	1196 aa		21.94	■■□□□ 1.1
PPP4C-205	ENST00000563200	H2AFV	Q71UI9	128 aa		21.94	■■□□□ 1.1
PPP4C-205	ENST00000563200	PGBD5	Q8N414	524 aa		21.94	■■□□□ 1.1
PPP4C-205	ENST00000563200	RNF214	Q8ND24	703 aa		21.94	■■□□□ 1.1
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF548	Q8NEK5	533 aa	Predicted RBP	21.94	■■□□□ 1.1
PPP4C-205	ENST00000563200	C1QTNF7	Q9BXJ2	289 aa		21.94	■■□□□ 1.1
PPP4C-205	ENST00000563200	ABHD10	Q9NUJ1	306 aa		21.94	■■□□□ 1.1
PPP4C-205	ENST00000563200	CTTNBP2NL	Q9P2B4	639 aa		21.94	■■□□□ 1.1

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