RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550358.5

PTPRB-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRB, Length 6,583 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-208ENST00000550358 OVGP1Q12889 678 aa8.56□□□□□ -1.04
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PTPRB-208ENST00000550358 PMF1Q6P1K2 205 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 PACS1Q6VY07 963 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 CCDC33Q8N5R6 958 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 C4orf32Q8N8J7 132 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 SCAIQ8N9R8 606 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 ASZ1Q8WWH4 475 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 RNF145Q96MT1 663 aa8.56□□□□□ -1.04
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PTPRB-208ENST00000550358 CDH19Q9H159 772 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP8.56□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
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PTPRB-208ENST00000550358 RAB14P61106 215 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 NR1D2Q14995 579 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 INAVAQ3KP66 663 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 DUPD1Q68J44 220 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
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PTPRB-208ENST00000550358 SERHL2Q9H4I8 314 aa8.55□□□□□ -1.04
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PTPRB-208ENST00000550358 USP2O75604 605 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
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PTPRB-208ENST00000550358 PDK4Q16654 411 aa8.55□□□□□ -1.04
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PTPRB-208ENST00000550358 CRNNQ9UBG3 495 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 PRKAG3Q9UGI9 489 aa8.55□□□□□ -1.04
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PTPRB-208ENST00000550358 C16orf59Q7L2K0 433 aa8.55□□□□□ -1.04
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PTPRB-208ENST00000550358 DSELQ8IZU8 1212 aa8.55□□□□□ -1.04
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PTPRB-208ENST00000550358 GSTM5P46439 218 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa8.55□□□□□ -1.04
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PTPRB-208ENST00000550358 SPPL2AQ8TCT8 520 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 FIG4Q92562 907 aa8.55□□□□□ -1.04
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PTPRB-208ENST00000550358 EXD2Q9NVH0 621 aa8.55□□□□□ -1.04
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PTPRB-208ENST00000550358 FUT2Q10981 343 aa8.55□□□□□ -1.04
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PTPRB-208ENST00000550358 PRR23AA6NEV1 266 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 H3BM21 787 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 NDST3O95803 873 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 NOS3P29474 1203 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 CLK2P49760 499 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 BLVRAP53004 296 aa8.54□□□□□ -1.04
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