RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549362.1

USP25-210, Transcript of ubiquitin specific peptidase 25, humanhuman

TSL 2

Gene USP25, Length 606 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25-210ENST00000549362 MAPK4P31152 587 aa4.5□□□□□ -1.69
USP25-210ENST00000549362 SFNP31947 248 aa4.5□□□□□ -1.69
USP25-210ENST00000549362 HOXD13P35453 343 aa4.5□□□□□ -1.69
USP25-210ENST00000549362 MAPK9P45984 424 aa4.5□□□□□ -1.69
USP25-210ENST00000549362 SLC11A2P49281 568 aa4.5□□□□□ -1.69
USP25-210ENST00000549362 PEX5P50542 639 aa4.5□□□□□ -1.69
USP25-210ENST00000549362 PSMC6P62333 389 aa4.5□□□□□ -1.69
USP25-210ENST00000549362 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
USP25-210ENST00000549362 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
USP25-210ENST00000549362 ZXDAP98168 799 aa4.5□□□□□ -1.69
USP25-210ENST00000549362 SATB1Q01826 763 aa4.5□□□□□ -1.69
USP25-210ENST00000549362 CDR2Q01850 454 aa4.5□□□□□ -1.69
USP25-210ENST00000549362 KRT17Q04695 432 aa4.5□□□□□ -1.69
USP25-210ENST00000549362 PLP2Q04941 152 aa4.5□□□□□ -1.69
USP25-210ENST00000549362 PTP4A2Q12974 167 aa4.5□□□□□ -1.69
USP25-210ENST00000549362 BNIP1Q12981 228 aa4.5□□□□□ -1.69
USP25-210ENST00000549362 SPARCL1Q14515 664 aa4.5□□□□□ -1.69
USP25-210ENST00000549362 NAA25Q14CX7 972 aa4.5□□□□□ -1.69
USP25-210ENST00000549362 TRADDQ15628 312 aa4.5□□□□□ -1.69
USP25-210ENST00000549362 CCNG2Q16589 344 aa4.5□□□□□ -1.69
USP25-210ENST00000549362 PFKFB4Q16877 469 aa4.5□□□□□ -1.69
USP25-210ENST00000549362 PARP6Q2NL67 630 aa4.5□□□□□ -1.69
USP25-210ENST00000549362 USH1GQ495M9 461 aa4.5□□□□□ -1.69
USP25-210ENST00000549362 CBWD6Q4V339 395 aa4.5□□□□□ -1.69
USP25-210ENST00000549362 EPC2Q52LR7 807 aa4.5□□□□□ -1.69
USP25-210ENST00000549362 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
USP25-210ENST00000549362 CRB2Q5IJ48 1285 aa4.5□□□□□ -1.69
USP25-210ENST00000549362 CBWD3Q5JTY5 395 aa4.5□□□□□ -1.69
USP25-210ENST00000549362 CBWD5Q5RIA9 395 aa4.5□□□□□ -1.69
USP25-210ENST00000549362 DCAF12L1Q5VU92 463 aa4.5□□□□□ -1.69
USP25-210ENST00000549362 NUGGCQ68CJ6 796 aa4.5□□□□□ -1.69
USP25-210ENST00000549362 ACAD10Q6JQN1 1059 aa4.5□□□□□ -1.69
USP25-210ENST00000549362 TATDN1Q6P1N9 297 aa4.5□□□□□ -1.69
USP25-210ENST00000549362 GJB7Q6PEY0 223 aa4.5□□□□□ -1.69
USP25-210ENST00000549362 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa4.5□□□□□ -1.69
USP25-210ENST00000549362 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
USP25-210ENST00000549362 EXOC3L1Q86VI1 746 aa4.5□□□□□ -1.69
USP25-210ENST00000549362 FAM71AQ8IYT1 594 aa4.5□□□□□ -1.69
USP25-210ENST00000549362 ARHGAP24Q8N264 748 aa4.5□□□□□ -1.69
USP25-210ENST00000549362 FAM46DQ8NEK8 389 aa4.5□□□□□ -1.69
USP25-210ENST00000549362 RDM1Q8NG50 284 aa4.5□□□□□ -1.69
USP25-210ENST00000549362 ZNF398Q8TD17 642 aa4.5□□□□□ -1.69
USP25-210ENST00000549362 TCP11Q8WWU5 503 aa4.5□□□□□ -1.69
USP25-210ENST00000549362 GLG1Q92896 1179 aa4.5□□□□□ -1.69
USP25-210ENST00000549362 SCAMP4Q969E2 229 aa4.5□□□□□ -1.69
USP25-210ENST00000549362 SPSB4Q96A44 273 aa4.5□□□□□ -1.69
USP25-210ENST00000549362 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
USP25-210ENST00000549362 LENG9Q96B70 501 aa4.5□□□□□ -1.69
USP25-210ENST00000549362 C18orf8Q96DM3 657 aa4.5□□□□□ -1.69
USP25-210ENST00000549362 ARHGEF26Q96DR7 871 aa4.5□□□□□ -1.69
USP25-210ENST00000549362 TMEM176AQ96HP8 235 aa4.5□□□□□ -1.69
USP25-210ENST00000549362 VCPIP1Q96JH7 1222 aa4.5□□□□□ -1.69
USP25-210ENST00000549362 TEPSINQ96N21 525 aa4.5□□□□□ -1.69
USP25-210ENST00000549362 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
USP25-210ENST00000549362 DPYSL5Q9BPU6 564 aa4.5□□□□□ -1.69
USP25-210ENST00000549362 HEPHQ9BQS7 1158 aa4.5□□□□□ -1.69
USP25-210ENST00000549362 STRA6Q9BX79 667 aa4.5□□□□□ -1.69
USP25-210ENST00000549362 PITPNM3Q9BZ71 974 aa4.5□□□□□ -1.69
USP25-210ENST00000549362 MAGEB5Q9BZ81 275 aa4.5□□□□□ -1.69
USP25-210ENST00000549362 DPH1Q9BZG8 443 aa4.5□□□□□ -1.69
USP25-210ENST00000549362 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
USP25-210ENST00000549362 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
USP25-210ENST00000549362 CHST8Q9H2A9 424 aa4.5□□□□□ -1.69
USP25-210ENST00000549362 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
USP25-210ENST00000549362 GOLPH3Q9H4A6 298 aa4.5□□□□□ -1.69
USP25-210ENST00000549362 ECT2Q9H8V3 914 aa4.5□□□□□ -1.69
USP25-210ENST00000549362 C17orf75Q9HAS0 396 aa4.5□□□□□ -1.69
USP25-210ENST00000549362 GPR35Q9HC97 309 aa4.5□□□□□ -1.69
USP25-210ENST00000549362 TMEM8AQ9HCN3 771 aa4.5□□□□□ -1.69
USP25-210ENST00000549362 OBP2BQ9NPH6 170 aa4.5□□□□□ -1.69
USP25-210ENST00000549362 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
USP25-210ENST00000549362 TBC1D22BQ9NU19 505 aa4.5□□□□□ -1.69
USP25-210ENST00000549362 RRN3Q9NYV6 651 aa4.5□□□□□ -1.69
USP25-210ENST00000549362 TMOD4Q9NZQ9 345 aa4.5□□□□□ -1.69
USP25-210ENST00000549362 XPR1Q9UBH6 696 aa4.5□□□□□ -1.69
USP25-210ENST00000549362 POLLQ9UGP5 575 aa4.5□□□□□ -1.69
USP25-210ENST00000549362 LGALS13Q9UHV8 139 aa4.5□□□□□ -1.69
USP25-210ENST00000549362 ANAPC5Q9UJX4 755 aa4.5□□□□□ -1.69
USP25-210ENST00000549362 GJD2Q9UKL4 321 aa4.5□□□□□ -1.69
USP25-210ENST00000549362 SUFUQ9UMX1 484 aa4.5□□□□□ -1.69
USP25-210ENST00000549362 CLCA2Q9UQC9 943 aa4.5□□□□□ -1.69
USP25-210ENST00000549362 C15orf41Q9Y2V0 281 aa4.5□□□□□ -1.69
USP25-210ENST00000549362 USH1CQ9Y6N9 552 aa4.5□□□□□ -1.69
USP25-210ENST00000549362 ZHX2Q9Y6X8 837 aa4.5□□□□□ -1.69
USP25-210ENST00000549362 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa4.49□□□□□ -1.69
USP25-210ENST00000549362 TMEM120BA0PK00 339 aa4.49□□□□□ -1.69
USP25-210ENST00000549362 PMS2P1A4D2B8 440 aa4.49□□□□□ -1.69
USP25-210ENST00000549362 FAM47DPA6NHR8 397 aa4.49□□□□□ -1.69
USP25-210ENST00000549362 PRSS29PA6NIE9 313 aa4.49□□□□□ -1.69
USP25-210ENST00000549362 TCP11X1B4DZS4 312 aa4.49□□□□□ -1.69
USP25-210ENST00000549362 RAB27BO00194 218 aa4.49□□□□□ -1.69
USP25-210ENST00000549362 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
USP25-210ENST00000549362 AREL1O15033 823 aa4.49□□□□□ -1.69
USP25-210ENST00000549362 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP4.49□□□□□ -1.69
USP25-210ENST00000549362 CHMP2AO43633 222 aa4.49□□□□□ -1.69
USP25-210ENST00000549362 ANP32DO95626 131 aa4.49□□□□□ -1.69
USP25-210ENST00000549362 NDUFB10O96000 172 aa4.49□□□□□ -1.69
USP25-210ENST00000549362 CHEK2O96017 543 aa4.49□□□□□ -1.69
USP25-210ENST00000549362 OAS1P00973 400 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
USP25-210ENST00000549362 SHBGP04278 402 aa4.49□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.9 ms