RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000536405.5

DKFZP434K028-202, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene DKFZP434K028, Length 2,466 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKFZP434K028-202ENST00000536405 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP17.28■□□□□ 0.36
DKFZP434K028-202ENST00000536405 ZYG11BQ9C0D3 744 aa17.28■□□□□ 0.36
DKFZP434K028-202ENST00000536405 NT5MQ9NPB1 228 aa17.28■□□□□ 0.36
DKFZP434K028-202ENST00000536405 PDP2Q9P2J9 529 aa17.28■□□□□ 0.36
DKFZP434K028-202ENST00000536405 TRIM17Q9Y577 477 aa17.28■□□□□ 0.36
DKFZP434K028-202ENST00000536405 TMEM114B3SHH9 223 aa17.27■□□□□ 0.36
DKFZP434K028-202ENST00000536405 H3BNX3 289 aa17.27■□□□□ 0.36
DKFZP434K028-202ENST00000536405 TIMM44O43615 452 aa17.27■□□□□ 0.36
DKFZP434K028-202ENST00000536405 TBC1D4O60343 1298 aa17.27■□□□□ 0.36
DKFZP434K028-202ENST00000536405 ANXA9O76027 345 aa17.27■□□□□ 0.36
DKFZP434K028-202ENST00000536405 VAPBO95292 243 aa17.27■□□□□ 0.36
DKFZP434K028-202ENST00000536405 EPHA3P29320 983 aa17.27■□□□□ 0.36
DKFZP434K028-202ENST00000536405 GLRBP48167 497 aa17.27■□□□□ 0.36
DKFZP434K028-202ENST00000536405 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP17.27■□□□□ 0.36
DKFZP434K028-202ENST00000536405 ITKQ08881 620 aa17.27■□□□□ 0.36
DKFZP434K028-202ENST00000536405 CTBP1Q13363 440 aa17.27■□□□□ 0.36
DKFZP434K028-202ENST00000536405 PKN3Q6P5Z2 889 aa17.27■□□□□ 0.36
DKFZP434K028-202ENST00000536405 NPAS4Q8IUM7 802 aa17.27■□□□□ 0.36
DKFZP434K028-202ENST00000536405 DENND6AQ8IWF6 608 aa17.27■□□□□ 0.36
DKFZP434K028-202ENST00000536405 JADE3Q92613 823 aa17.27■□□□□ 0.36
DKFZP434K028-202ENST00000536405 DEFB118Q96PH6 123 aa17.27■□□□□ 0.36
DKFZP434K028-202ENST00000536405 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP17.27■□□□□ 0.36
DKFZP434K028-202ENST00000536405 TASP1Q9H6P5 420 aa17.27■□□□□ 0.36
DKFZP434K028-202ENST00000536405 AIM2O14862 343 aa17.27■□□□□ 0.35
DKFZP434K028-202ENST00000536405 GJB3O75712 270 aa17.27■□□□□ 0.35
DKFZP434K028-202ENST00000536405 SLC2A3P11169 496 aa17.27■□□□□ 0.35
DKFZP434K028-202ENST00000536405 ATF6P18850 670 aa17.27■□□□□ 0.35
DKFZP434K028-202ENST00000536405 AVPR1AP37288 418 aa17.27■□□□□ 0.35
DKFZP434K028-202ENST00000536405 KCNQ1P51787 676 aa17.27■□□□□ 0.35
DKFZP434K028-202ENST00000536405 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP17.27■□□□□ 0.35
DKFZP434K028-202ENST00000536405 PCID2Q5JVF3 399 aa17.27■□□□□ 0.35
DKFZP434K028-202ENST00000536405 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa17.27■□□□□ 0.35
DKFZP434K028-202ENST00000536405 ARHGAP18Q8N392 663 aa17.27■□□□□ 0.35
DKFZP434K028-202ENST00000536405 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa17.27■□□□□ 0.35
DKFZP434K028-202ENST00000536405 RTKNQ9BST9 563 aa17.27■□□□□ 0.35
DKFZP434K028-202ENST00000536405 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa17.27■□□□□ 0.35
DKFZP434K028-202ENST00000536405 FSD1LQ9BXM9 530 aa17.27■□□□□ 0.35
DKFZP434K028-202ENST00000536405 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP17.27■□□□□ 0.35
DKFZP434K028-202ENST00000536405 WASH4PA8MWX3 477 aa17.26■□□□□ 0.35
DKFZP434K028-202ENST00000536405 MATN2O00339 956 aa17.26■□□□□ 0.35
DKFZP434K028-202ENST00000536405 FKTNO75072 461 aa17.26■□□□□ 0.35
DKFZP434K028-202ENST00000536405 ARNTP27540 789 aa17.26■□□□□ 0.35
DKFZP434K028-202ENST00000536405 PRDX6P30041 224 aa17.26■□□□□ 0.35
DKFZP434K028-202ENST00000536405 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP17.26■□□□□ 0.35
DKFZP434K028-202ENST00000536405 TRIP10Q15642 601 aa17.26■□□□□ 0.35
DKFZP434K028-202ENST00000536405 CNGA3Q16281 694 aa17.26■□□□□ 0.35
DKFZP434K028-202ENST00000536405 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP17.26■□□□□ 0.35
DKFZP434K028-202ENST00000536405 RANBP10Q6VN20 620 aa17.26■□□□□ 0.35
DKFZP434K028-202ENST00000536405 BTN2A3PQ96KV6 586 aa17.26■□□□□ 0.35
DKFZP434K028-202ENST00000536405 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP17.26■□□□□ 0.35
DKFZP434K028-202ENST00000536405 GBP5Q96PP8 586 aa17.26■□□□□ 0.35
DKFZP434K028-202ENST00000536405 TTPALQ9BTX7 342 aa17.26■□□□□ 0.35
DKFZP434K028-202ENST00000536405 KLHL4Q9C0H6 718 aa17.26■□□□□ 0.35
DKFZP434K028-202ENST00000536405 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP17.26■□□□□ 0.35
DKFZP434K028-202ENST00000536405 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa17.26■□□□□ 0.35
DKFZP434K028-202ENST00000536405 CLIC5Q9NZA1 410 aa17.26■□□□□ 0.35
DKFZP434K028-202ENST00000536405 PSMD3O43242 534 aa17.26■□□□□ 0.35
DKFZP434K028-202ENST00000536405 GNRH1P01148 92 aa17.26■□□□□ 0.35
DKFZP434K028-202ENST00000536405 AHSGP02765 367 aa17.26■□□□□ 0.35
DKFZP434K028-202ENST00000536405 RHOQP17081 205 aa17.26■□□□□ 0.35
DKFZP434K028-202ENST00000536405 PIK3R1P27986 724 aa17.26■□□□□ 0.35
DKFZP434K028-202ENST00000536405 ETFBP38117 255 aa17.26■□□□□ 0.35
DKFZP434K028-202ENST00000536405 GRIA4P48058 902 aa17.26■□□□□ 0.35
DKFZP434K028-202ENST00000536405 CSRP3P50461 194 aa17.26■□□□□ 0.35
DKFZP434K028-202ENST00000536405 NUDT2P50583 147 aa17.26■□□□□ 0.35
DKFZP434K028-202ENST00000536405 GEMP55040 296 aa17.26■□□□□ 0.35
DKFZP434K028-202ENST00000536405 WNT3AP56704 352 aa17.26■□□□□ 0.35
DKFZP434K028-202ENST00000536405 MPP1Q00013 466 aa17.26■□□□□ 0.35
DKFZP434K028-202ENST00000536405 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP17.26■□□□□ 0.35
DKFZP434K028-202ENST00000536405 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP17.26■□□□□ 0.35
DKFZP434K028-202ENST00000536405 NADSYN1Q6IA69 706 aa17.26■□□□□ 0.35
DKFZP434K028-202ENST00000536405 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP17.26■□□□□ 0.35
DKFZP434K028-202ENST00000536405 KBTBD6Q86V97 674 aa17.26■□□□□ 0.35
DKFZP434K028-202ENST00000536405 SNX32Q86XE0 403 aa17.26■□□□□ 0.35
DKFZP434K028-202ENST00000536405 CFAP52Q8N1V2 620 aa17.26■□□□□ 0.35
DKFZP434K028-202ENST00000536405 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa17.26■□□□□ 0.35
DKFZP434K028-202ENST00000536405 SPPL2BQ8TCT7 592 aa17.26■□□□□ 0.35
DKFZP434K028-202ENST00000536405 TLR5O60602 858 aa17.25■□□□□ 0.35
DKFZP434K028-202ENST00000536405 PIGNO95427 931 aa17.25■□□□□ 0.35
DKFZP434K028-202ENST00000536405 JUNP05412 331 aaKnown RBP17.25■□□□□ 0.35
DKFZP434K028-202ENST00000536405 ACVRL1P37023 503 aa17.25■□□□□ 0.35
DKFZP434K028-202ENST00000536405 POLE2P56282 527 aa17.25■□□□□ 0.35
DKFZP434K028-202ENST00000536405 DSC2Q02487 901 aa17.25■□□□□ 0.35
DKFZP434K028-202ENST00000536405 DLG1Q12959 904 aa17.25■□□□□ 0.35
DKFZP434K028-202ENST00000536405 SEPT6Q14141 434 aa17.25■□□□□ 0.35
DKFZP434K028-202ENST00000536405 ZNF460Q14592 562 aa17.25■□□□□ 0.35
DKFZP434K028-202ENST00000536405 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP17.25■□□□□ 0.35
DKFZP434K028-202ENST00000536405 METTL21CQ5VZV1 264 aa17.25■□□□□ 0.35
DKFZP434K028-202ENST00000536405 ACAD11Q709F0 780 aa17.25■□□□□ 0.35
DKFZP434K028-202ENST00000536405 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP17.25■□□□□ 0.35
DKFZP434K028-202ENST00000536405 KCTD4Q8WVF5 259 aa17.25■□□□□ 0.35
DKFZP434K028-202ENST00000536405 GPR22Q99680 433 aa17.25■□□□□ 0.35
DKFZP434K028-202ENST00000536405 NUF2Q9BZD4 464 aa17.25■□□□□ 0.35
DKFZP434K028-202ENST00000536405 TMEM248Q9NWD8 314 aa17.25■□□□□ 0.35
DKFZP434K028-202ENST00000536405 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa17.25■□□□□ 0.35
DKFZP434K028-202ENST00000536405 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP17.25■□□□□ 0.35
DKFZP434K028-202ENST00000536405 CD86P42081 329 aa17.25■□□□□ 0.35
DKFZP434K028-202ENST00000536405 NAGLUP54802 743 aa17.25■□□□□ 0.35
DKFZP434K028-202ENST00000536405 ANO4Q32M45 955 aa17.25■□□□□ 0.35
DKFZP434K028-202ENST00000536405 TMEM198Q66K66 360 aa17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.2 ms