RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532751.1

PTPRK-222, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 4

Gene PTPRK, Length 563 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-222ENST00000532751 UPK3BL2E5RIL1 263 aa22.16■■□□□ 1.14
PTPRK-222ENST00000532751 AREL1O15033 823 aa22.16■■□□□ 1.14
PTPRK-222ENST00000532751 SLC31A1O15431 190 aa22.16■■□□□ 1.14
PTPRK-222ENST00000532751 KRT86O43790 486 aa22.16■■□□□ 1.14
PTPRK-222ENST00000532751 CST8O60676 142 aa22.16■■□□□ 1.14
PTPRK-222ENST00000532751 MAGEC1O60732 1142 aa22.16■■□□□ 1.14
PTPRK-222ENST00000532751 CCNB1P14635 433 aa22.16■■□□□ 1.14
PTPRK-222ENST00000532751 TGM2P21980 687 aa22.16■■□□□ 1.14
PTPRK-222ENST00000532751 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
PTPRK-222ENST00000532751 CTNNA2P26232 953 aa22.16■■□□□ 1.14
PTPRK-222ENST00000532751 AKT2P31751 481 aa22.16■■□□□ 1.14
PTPRK-222ENST00000532751 CETN2P41208 172 aa22.16■■□□□ 1.14
PTPRK-222ENST00000532751 MARCKSL1P49006 195 aa22.16■■□□□ 1.14
PTPRK-222ENST00000532751 NR2C2P49116 596 aa22.16■■□□□ 1.14
PTPRK-222ENST00000532751 MAXP61244 160 aa22.16■■□□□ 1.14
PTPRK-222ENST00000532751 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
PTPRK-222ENST00000532751 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
PTPRK-222ENST00000532751 PPP2R5EQ16537 467 aa22.16■■□□□ 1.14
PTPRK-222ENST00000532751 UGP2Q16851 508 aa22.16■■□□□ 1.14
PTPRK-222ENST00000532751 TMEM259Q4ZIN3 620 aa22.16■■□□□ 1.14
PTPRK-222ENST00000532751 SEL1L3Q68CR1 1132 aa22.16■■□□□ 1.14
PTPRK-222ENST00000532751 ERAP2Q6P179 960 aa22.16■■□□□ 1.14
PTPRK-222ENST00000532751 LRRC57Q8N9N7 239 aa22.16■■□□□ 1.14
PTPRK-222ENST00000532751 SLC17A9Q9BYT1 436 aa22.16■■□□□ 1.14
PTPRK-222ENST00000532751 BRD8Q9H0E9 1235 aa22.16■■□□□ 1.14
PTPRK-222ENST00000532751 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP22.16■■□□□ 1.14
PTPRK-222ENST00000532751 TRIM10Q9UDY6 481 aa22.16■■□□□ 1.14
PTPRK-222ENST00000532751 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPRK-222ENST00000532751 SOCS5O75159 536 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPRK-222ENST00000532751 KRT10P13645 584 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPRK-222ENST00000532751 PRLRP16471 622 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPRK-222ENST00000532751 CES1P23141 567 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPRK-222ENST00000532751 RWDD2BP57060 319 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPRK-222ENST00000532751 COPS2P61201 443 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPRK-222ENST00000532751 AP1B1Q10567 949 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPRK-222ENST00000532751 SGCGQ13326 291 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPRK-222ENST00000532751 KIF19Q2TAC6 998 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPRK-222ENST00000532751 LRRC73Q5JTD7 316 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPRK-222ENST00000532751 LAYNQ6UX15 382 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPRK-222ENST00000532751 NPNTQ6UXI9 565 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPRK-222ENST00000532751 PEX26Q7Z412 305 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPRK-222ENST00000532751 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
PTPRK-222ENST00000532751 MFSD2AQ8NA29 543 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPRK-222ENST00000532751 ECHDC3Q96DC8 303 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPRK-222ENST00000532751 LGMNQ99538 433 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPRK-222ENST00000532751 GAREM1Q9H706 876 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPRK-222ENST00000532751 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
PTPRK-222ENST00000532751 GGT7Q9UJ14 662 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPRK-222ENST00000532751 ITM2BQ9Y287 266 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPRK-222ENST00000532751 TTLL3Q9Y4R7 772 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPRK-222ENST00000532751 A0A1W2PR77 199 aa22.14■■□□□ 1.13
PTPRK-222ENST00000532751 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
PTPRK-222ENST00000532751 GJB3O75712 270 aa22.14■■□□□ 1.13
PTPRK-222ENST00000532751 NFKBIAP25963 317 aa22.14■■□□□ 1.13
PTPRK-222ENST00000532751 BNC1Q01954 994 aa22.14■■□□□ 1.13
PTPRK-222ENST00000532751 OVGP1Q12889 678 aa22.14■■□□□ 1.13
PTPRK-222ENST00000532751 LLGL1Q15334 1064 aa22.14■■□□□ 1.13
PTPRK-222ENST00000532751 HLA-BQ31612 363 aa22.14■■□□□ 1.13
PTPRK-222ENST00000532751 NT5DC3Q86UY8 548 aa22.14■■□□□ 1.13
PTPRK-222ENST00000532751 IQCHQ86VS3 1027 aa22.14■■□□□ 1.13
PTPRK-222ENST00000532751 UBL4BQ8N7F7 174 aa22.14■■□□□ 1.13
PTPRK-222ENST00000532751 FAM174AQ8TBP5 190 aa22.14■■□□□ 1.13
PTPRK-222ENST00000532751 LRRN4Q8WUT4 740 aa22.14■■□□□ 1.13
PTPRK-222ENST00000532751 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
PTPRK-222ENST00000532751 OLFM3Q96PB7 478 aa22.14■■□□□ 1.13
PTPRK-222ENST00000532751 SEMA3CQ99985 751 aa22.14■■□□□ 1.13
PTPRK-222ENST00000532751 NOD2Q9HC29 1040 aa22.14■■□□□ 1.13
PTPRK-222ENST00000532751 SNX11Q9Y5W9 270 aa22.14■■□□□ 1.13
PTPRK-222ENST00000532751 SPTBN4Q9H254 2564 aa22.14■■□□□ 1.13
PTPRK-222ENST00000532751 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
PTPRK-222ENST00000532751 LRRK1Q38SD2 2015 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPRK-222ENST00000532751 A0A0U1RQJ8 604 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPRK-222ENST00000532751 IGLON5A6NGN9 336 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPRK-222ENST00000532751 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
PTPRK-222ENST00000532751 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
PTPRK-222ENST00000532751 WNT9AO14904 365 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPRK-222ENST00000532751 SPINT1O43278 529 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPRK-222ENST00000532751 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
PTPRK-222ENST00000532751 WNT1P04628 370 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPRK-222ENST00000532751 CCDC175P0C221 793 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPRK-222ENST00000532751 CTSKP43235 329 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPRK-222ENST00000532751 TMEM52BQ4KMG9 183 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPRK-222ENST00000532751 OR2I1PQ8NGU4 316 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPRK-222ENST00000532751 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
PTPRK-222ENST00000532751 ASB12Q8WXK4 309 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPRK-222ENST00000532751 P3H4Q92791 437 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPRK-222ENST00000532751 MYOCQ99972 504 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPRK-222ENST00000532751 PCDH12Q9NPG4 1184 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPRK-222ENST00000532751 GUCA1BQ9UMX6 200 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPRK-222ENST00000532751 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPRK-222ENST00000532751 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPRK-222ENST00000532751 TLR4O00206 839 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRK-222ENST00000532751 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
PTPRK-222ENST00000532751 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
PTPRK-222ENST00000532751 DFNA5O60443 496 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRK-222ENST00000532751 TM7SF2O76062 418 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRK-222ENST00000532751 JCHAINP01591 159 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRK-222ENST00000532751 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
PTPRK-222ENST00000532751 SLC14A1Q13336 389 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRK-222ENST00000532751 CCDC181Q5TID7 509 aa22.12■■□□□ 1.13
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