RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516217.1

RNU6-1262P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1262, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1262P, Length 96 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1262P-201ENST00000516217 CALCOCO2Q13137 446 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-1262P-201ENST00000516217 SEMA3BQ13214 749 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-1262P-201ENST00000516217 UNC119Q13432 240 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-1262P-201ENST00000516217 CCNIQ14094 377 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-1262P-201ENST00000516217 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-1262P-201ENST00000516217 LY6DQ14210 128 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-1262P-201ENST00000516217 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-1262P-201ENST00000516217 SS18Q15532 418 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-1262P-201ENST00000516217 OASLQ15646 514 aaKnown RBP-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-1262P-201ENST00000516217 CHRFAM7AQ494W8 412 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-1262P-201ENST00000516217 AMOTQ4VCS5 1084 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-1262P-201ENST00000516217 DCAF6Q58WW2 860 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-1262P-201ENST00000516217 LIPKQ5VXJ0 399 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-1262P-201ENST00000516217 KLHL24Q6TFL4 600 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-1262P-201ENST00000516217 IL27RAQ6UWB1 636 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-1262P-201ENST00000516217 NECAB2Q7Z6G3 386 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-1262P-201ENST00000516217 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-1262P-201ENST00000516217 AMIGO1Q86WK6 493 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-1262P-201ENST00000516217 ZNF280BQ86YH2 543 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-1262P-201ENST00000516217 RHOT1Q8IXI2 618 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-1262P-201ENST00000516217 DPP10Q8N608 796 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-1262P-201ENST00000516217 MYCT1Q8N699 235 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-1262P-201ENST00000516217 OR2I1PQ8NGU4 316 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-1262P-201ENST00000516217 IFI44Q8TCB0 444 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-1262P-201ENST00000516217 ANAPC16Q96DE5 110 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-1262P-201ENST00000516217 ARSGQ96EG1 525 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-1262P-201ENST00000516217 RAX2Q96IS3 184 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-1262P-201ENST00000516217 PRAC1Q96KF2 57 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-1262P-201ENST00000516217 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-1262P-201ENST00000516217 WDFY2Q96P53 400 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-1262P-201ENST00000516217 MOGAT1Q96PD6 335 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-1262P-201ENST00000516217 SMC6Q96SB8 1091 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-1262P-201ENST00000516217 DMRTA2Q96SC8 542 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-1262P-201ENST00000516217 C7orf25Q9BPX7 421 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-1262P-201ENST00000516217 LZTS2Q9BRK4 669 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-1262P-201ENST00000516217 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-1262P-201ENST00000516217 VN1R3Q9BXE9 311 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-1262P-201ENST00000516217 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-1262P-201ENST00000516217 TMX1Q9H3N1 280 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-1262P-201ENST00000516217 MS4A5Q9H3V2 200 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-1262P-201ENST00000516217 HEXA-AS1Q9H8Q6 139 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-1262P-201ENST00000516217 PCDH9Q9HC56 1237 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-1262P-201ENST00000516217 VPS45Q9NRW7 570 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-1262P-201ENST00000516217 ABHD10Q9NUJ1 306 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-1262P-201ENST00000516217 EXD2Q9NVH0 621 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-1262P-201ENST00000516217 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-1262P-201ENST00000516217 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-1262P-201ENST00000516217 ZNF337Q9Y3M9 751 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-1262P-201ENST00000516217 CAPN7Q9Y6W3 813 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-1262P-201ENST00000516217 STAB1Q9NY15 2570 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-1262P-201ENST00000516217 NCOR2Q9Y618 2525 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-1262P-201ENST00000516217 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-1262P-201ENST00000516217 CPED1A4D0V7 1026 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-1262P-201ENST00000516217 EPOPA6NHQ4 379 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-1262P-201ENST00000516217 ANKRD63C9JTQ0 380 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-1262P-201ENST00000516217 J3QRE1 110 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-1262P-201ENST00000516217 TAF4O00268 1085 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-1262P-201ENST00000516217 EXOC5O00471 708 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-1262P-201ENST00000516217 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-1262P-201ENST00000516217 TGM5O43548 720 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-1262P-201ENST00000516217 MAGEC1O60732 1142 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-1262P-201ENST00000516217 IGHV4-39P01824 125 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-1262P-201ENST00000516217 RAF1P04049 648 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-1262P-201ENST00000516217 MYZAPP0CAP1 466 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-1262P-201ENST00000516217 CELP19835 753 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-1262P-201ENST00000516217 NDUFS1P28331 727 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-1262P-201ENST00000516217 DUSP1P28562 367 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-1262P-201ENST00000516217 EPHA3P29320 983 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-1262P-201ENST00000516217 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-1262P-201ENST00000516217 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-1262P-201ENST00000516217 IGFALSP35858 605 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-1262P-201ENST00000516217 NASPP49321 788 aaPredicted RBP-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-1262P-201ENST00000516217 ADORA2A-AS1P86434 159 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-1262P-201ENST00000516217 SP3Q02447 781 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-1262P-201ENST00000516217 KRT17Q04695 432 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-1262P-201ENST00000516217 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-1262P-201ENST00000516217 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-1262P-201ENST00000516217 DNASE1L3Q13609 305 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-1262P-201ENST00000516217 UBE4AQ14139 1066 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-1262P-201ENST00000516217 KIF22Q14807 665 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-1262P-201ENST00000516217 NR1D2Q14995 579 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-1262P-201ENST00000516217 PTPN21Q16825 1174 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-1262P-201ENST00000516217 Q1RN00 199 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-1262P-201ENST00000516217 SPIN3Q5JUX0 258 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-1262P-201ENST00000516217 CERCAMQ5T4B2 595 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-1262P-201ENST00000516217 AAGABQ6PD74 315 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-1262P-201ENST00000516217 MFSD6Q6ZSS7 791 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-1262P-201ENST00000516217 IGFN1Q86VF2 1251 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-1262P-201ENST00000516217 TMEM219Q86XT9 240 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-1262P-201ENST00000516217 ODF3L1Q8IXM7 274 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-1262P-201ENST00000516217 MYOCDQ8IZQ8 938 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-1262P-201ENST00000516217 HORMAD2Q8N7B1 307 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-1262P-201ENST00000516217 LRRC57Q8N9N7 239 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-1262P-201ENST00000516217 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-1262P-201ENST00000516217 OR52N4Q8NGI2 321 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-1262P-201ENST00000516217 LINC01006Q8NI28 216 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-1262P-201ENST00000516217 AGAP11Q8TF27 550 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-1262P-201ENST00000516217 TSPEARQ8WU66 669 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-1262P-201ENST00000516217 RAB24Q969Q5 203 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-1262P-201ENST00000516217 PPP2R3CQ969Q6 453 aa-0.79□□□□□ -2.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.3 ms