RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516042.1

RNU6-772P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 772, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-772P, Length 105 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-772P-201ENST00000516042 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-772P-201ENST00000516042 TBC1D9BQ66K14 1250 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-772P-201ENST00000516042 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP0.89□□□□□ -2.27
RNU6-772P-201ENST00000516042 ZNF614Q8N883 585 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-772P-201ENST00000516042 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP0.89□□□□□ -2.27
RNU6-772P-201ENST00000516042 IQCDQ96DY2 449 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-772P-201ENST00000516042 LRRC46Q96FV0 321 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-772P-201ENST00000516042 SCRN2Q96FV2 425 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-772P-201ENST00000516042 TEFMQ96QE5 360 aaKnown RBP0.89□□□□□ -2.27
RNU6-772P-201ENST00000516042 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-772P-201ENST00000516042 TMEM60Q9H2L4 133 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-772P-201ENST00000516042 GPR83Q9NYM4 423 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-772P-201ENST00000516042 TMEM181Q9P2C4 612 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-772P-201ENST00000516042 ASIC3Q9UHC3 531 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-772P-201ENST00000516042 SLC12A4Q9UP95 1085 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-772P-201ENST00000516042 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-772P-201ENST00000516042 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-772P-201ENST00000516042 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP0.88□□□□□ -2.27
RNU6-772P-201ENST00000516042 TBC1D3DA0A087WVF3 549 aa0.88□□□□□ -2.27
RNU6-772P-201ENST00000516042 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa0.88□□□□□ -2.27
RNU6-772P-201ENST00000516042 TBC1D3EA0A087X179 549 aa0.88□□□□□ -2.27
RNU6-772P-201ENST00000516042 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa0.88□□□□□ -2.27
RNU6-772P-201ENST00000516042 TBC1D3BA6NDS4 549 aa0.88□□□□□ -2.27
RNU6-772P-201ENST00000516042 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP0.88□□□□□ -2.27
RNU6-772P-201ENST00000516042 CLCA1A8K7I4 914 aa0.88□□□□□ -2.27
RNU6-772P-201ENST00000516042 TBC1D3LB9A6J9 549 aa0.88□□□□□ -2.27
RNU6-772P-201ENST00000516042 ALG1L2C9J202 215 aa0.88□□□□□ -2.27
RNU6-772P-201ENST00000516042 WNT9BO14905 357 aa0.88□□□□□ -2.27
RNU6-772P-201ENST00000516042 NDUFS7O75251 213 aa0.88□□□□□ -2.27
RNU6-772P-201ENST00000516042 TAF5LO75529 589 aa0.88□□□□□ -2.27
RNU6-772P-201ENST00000516042 CAVIN2O95810 425 aa0.88□□□□□ -2.27
RNU6-772P-201ENST00000516042 TBC1D3HP0C7X1 549 aa0.88□□□□□ -2.27
RNU6-772P-201ENST00000516042 SRGAP2BP0DMP2 458 aa0.88□□□□□ -2.27
RNU6-772P-201ENST00000516042 MYBP10242 640 aa0.88□□□□□ -2.27
RNU6-772P-201ENST00000516042 IDEP14735 1019 aa0.88□□□□□ -2.27
RNU6-772P-201ENST00000516042 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP0.88□□□□□ -2.27
RNU6-772P-201ENST00000516042 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP0.88□□□□□ -2.27
RNU6-772P-201ENST00000516042 EPHB1P54762 984 aa0.88□□□□□ -2.27
RNU6-772P-201ENST00000516042 SPOCK1Q08629 439 aa0.88□□□□□ -2.27
RNU6-772P-201ENST00000516042 RAPSNQ13702 412 aa0.88□□□□□ -2.27
RNU6-772P-201ENST00000516042 LPIN1Q14693 890 aa0.88□□□□□ -2.27
RNU6-772P-201ENST00000516042 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP0.88□□□□□ -2.27
RNU6-772P-201ENST00000516042 TUBB8Q3ZCM7 444 aa0.88□□□□□ -2.27
RNU6-772P-201ENST00000516042 XKR4Q5GH76 650 aa0.88□□□□□ -2.27
RNU6-772P-201ENST00000516042 KCNT1Q5JUK3 1230 aa0.88□□□□□ -2.27
RNU6-772P-201ENST00000516042 TMEM268Q5VZI3 342 aa0.88□□□□□ -2.27
RNU6-772P-201ENST00000516042 RAP1GAP2Q684P5 730 aa0.88□□□□□ -2.27
RNU6-772P-201ENST00000516042 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa0.88□□□□□ -2.27
RNU6-772P-201ENST00000516042 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa0.88□□□□□ -2.27
RNU6-772P-201ENST00000516042 WDR73Q6P4I2 378 aa0.88□□□□□ -2.27
RNU6-772P-201ENST00000516042 KRBA2Q6ZNG9 492 aa0.88□□□□□ -2.27
RNU6-772P-201ENST00000516042 KIAA0408Q6ZU52 694 aa0.88□□□□□ -2.27
RNU6-772P-201ENST00000516042 RNF144BQ7Z419 303 aa0.88□□□□□ -2.27
RNU6-772P-201ENST00000516042 SFTPA2Q8IWL1 248 aa0.88□□□□□ -2.27
RNU6-772P-201ENST00000516042 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP0.88□□□□□ -2.27
RNU6-772P-201ENST00000516042 Q8N377 158 aa0.88□□□□□ -2.27
RNU6-772P-201ENST00000516042 CLEC4CQ8WTT0 213 aa0.88□□□□□ -2.27
RNU6-772P-201ENST00000516042 SLC20A1Q8WUM9 679 aa0.88□□□□□ -2.27
RNU6-772P-201ENST00000516042 CHMP4CQ96CF2 233 aa0.88□□□□□ -2.27
RNU6-772P-201ENST00000516042 MCRS1Q96EZ8 462 aa0.88□□□□□ -2.27
RNU6-772P-201ENST00000516042 AIFM3Q96NN9 605 aa0.88□□□□□ -2.27
RNU6-772P-201ENST00000516042 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP0.88□□□□□ -2.27
RNU6-772P-201ENST00000516042 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa0.88□□□□□ -2.27
RNU6-772P-201ENST00000516042 MAGEB5Q9BZ81 275 aa0.88□□□□□ -2.27
RNU6-772P-201ENST00000516042 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP0.88□□□□□ -2.27
RNU6-772P-201ENST00000516042 PCDHAC1Q9H158 963 aa0.88□□□□□ -2.27
RNU6-772P-201ENST00000516042 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa0.88□□□□□ -2.27
RNU6-772P-201ENST00000516042 TAF1P21675 1872 aa0.88□□□□□ -2.27
RNU6-772P-201ENST00000516042 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP0.88□□□□□ -2.27
RNU6-772P-201ENST00000516042 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa0.87□□□□□ -2.27
RNU6-772P-201ENST00000516042 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa0.87□□□□□ -2.27
RNU6-772P-201ENST00000516042 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa0.87□□□□□ -2.27
RNU6-772P-201ENST00000516042 FAM157AC9JC47 383 aa0.87□□□□□ -2.27
RNU6-772P-201ENST00000516042 PLRG1O43660 514 aaKnown RBP0.87□□□□□ -2.27
RNU6-772P-201ENST00000516042 ZIC3O60481 467 aa0.87□□□□□ -2.27
RNU6-772P-201ENST00000516042 WDR1O75083 606 aa0.87□□□□□ -2.27
RNU6-772P-201ENST00000516042 IGHV4-39P01824 125 aa0.87□□□□□ -2.27
RNU6-772P-201ENST00000516042 MMP2P08253 660 aa0.87□□□□□ -2.27
RNU6-772P-201ENST00000516042 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP0.87□□□□□ -2.27
RNU6-772P-201ENST00000516042 MYL4P12829 197 aa0.87□□□□□ -2.27
RNU6-772P-201ENST00000516042 EGR1P18146 543 aa0.87□□□□□ -2.27
RNU6-772P-201ENST00000516042 PRPH2P23942 346 aa0.87□□□□□ -2.27
RNU6-772P-201ENST00000516042 GSTM2P28161 218 aa0.87□□□□□ -2.27
RNU6-772P-201ENST00000516042 PGFP49763 221 aa0.87□□□□□ -2.27
RNU6-772P-201ENST00000516042 MMP14P50281 582 aa0.87□□□□□ -2.27
RNU6-772P-201ENST00000516042 BMXP51813 675 aa0.87□□□□□ -2.27
RNU6-772P-201ENST00000516042 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP0.87□□□□□ -2.27
RNU6-772P-201ENST00000516042 KRTAP10-10P60014 251 aa0.87□□□□□ -2.27
RNU6-772P-201ENST00000516042 MS4A2Q01362 244 aa0.87□□□□□ -2.27
RNU6-772P-201ENST00000516042 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP0.87□□□□□ -2.27
RNU6-772P-201ENST00000516042 COX10Q12887 443 aa0.87□□□□□ -2.27
RNU6-772P-201ENST00000516042 CAPSQ13938 189 aa0.87□□□□□ -2.27
RNU6-772P-201ENST00000516042 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP0.87□□□□□ -2.27
RNU6-772P-201ENST00000516042 GXYLT1Q4G148 440 aa0.87□□□□□ -2.27
RNU6-772P-201ENST00000516042 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP0.87□□□□□ -2.27
RNU6-772P-201ENST00000516042 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa0.87□□□□□ -2.27
RNU6-772P-201ENST00000516042 DENND6AQ8IWF6 608 aa0.87□□□□□ -2.27
RNU6-772P-201ENST00000516042 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa0.87□□□□□ -2.27
RNU6-772P-201ENST00000516042 CCDC150Q8NCX0 1101 aa0.87□□□□□ -2.27
RNU6-772P-201ENST00000516042 FCAMRQ8WWV6 532 aa0.87□□□□□ -2.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27 ms