RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515183.5

SH3BP2-227, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 4

Gene SH3BP2, Length 566 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-227ENST00000515183 PTK2BQ14289 1009 aa14.52□□□□□ -0.09
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SH3BP2-227ENST00000515183 TMEM52BQ4KMG9 183 aa14.52□□□□□ -0.09
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SH3BP2-227ENST00000515183 CAMK1DQ8IU85 385 aa14.52□□□□□ -0.09
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SH3BP2-227ENST00000515183 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP14.49□□□□□ -0.093e-6■■■■□ 20.9
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