RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511139.1

FAM172A-209, Transcript of family with sequence similarity 172 member A, human

TSL 5

Gene FAM172A, Length 310 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM172A-209	ENST00000511139	CELF2-AS1	Q8N7Q2	184 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	TMEM35B	Q8NCS4	154 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	DEFB124	Q8NES8	71 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	PLEKHO2	Q8TD55	490 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	GANC	Q8TET4	914 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	SETD7	Q8WTS6	366 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	BTN2A2	Q8WVV5	523 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	ZNF606	Q8WXB4	792 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	RLN3	Q8WXF3	142 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	RFFL	Q8WZ73	363 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	FAM131C	Q96AQ9	280 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	TMEM159	Q96B96	161 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	FAM149B1	Q96BN6	582 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	SLC39A13	Q96H72	371 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	FEM1C	Q96JP0	617 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	ALPK1	Q96QP1	1244 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	HAPLN3	Q96S86	360 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	ELF4	Q99607	663 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	ULBP1	Q9BZM6	244 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	B3GNT4	Q9C0J1	378 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	KLHL25	Q9H0H3	589 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	SDCBP2	Q9H190	292 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	NMUR1	Q9HB89	426 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	APOBEC3G	Q9HC16	384 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	PRSS16	Q9NQE7	514 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	TMEM74B	Q9NUR3	256 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	ABCB8	Q9NUT2	735 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	OSER1	Q9NX31	292 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	FBXL12	Q9NXK8	326 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	FTSJ1	Q9UET6	329 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	RWDD2A	Q9UIY3	292 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	TCFL5	Q9UL49	500 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	HPCAL4	Q9UM19	191 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	HS3ST2	Q9Y278	367 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	TBC1D30	Q9Y2I9	924 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	TMA7	Q9Y2S6	64 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	FHOD1	Q9Y613	1164 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	CSNK1G3	Q9Y6M4	447 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	PCDH15	Q96QU1	1955 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139		A0A1B0GTQ1	180 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	TEX51	A0A1B0GUA7	166 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	ILVBL	A1L0T0	632 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	SRRM3	A6NNA2	597 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	YJEFN3	A6XGL0	299 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139		E7ENQ6	273 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139		H0Y8X5	98 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139		M0QYT0	321 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139		M0QYV0	167 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	TLR4	O00206	839 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	TPP1	O14773	563 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	KLF4	O43474	513 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	TSPAN6	O43657	245 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	AP1G1	O43747	822 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	TBL1X	O60907	577 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	RFPL3	O75679	317 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	TCEA3	O75764	348 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	TRUB2	O95900	331 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	IGLV3-25	P01717	112 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	ITGAV	P06756	1048 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	TRIM49	P0CI25	452 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	TRIM49C	P0CI26	452 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	KRT10	P13645	584 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	CKMT2	P17540	419 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	RPL10	P27635	214 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	AKT2	P31751	481 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	ACTN2	P35609	894 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	HK2	P52789	917 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	ERVPABLB-1	P60509	514 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	HNRNPK	P61978	463 aa	Known RBP eCLIP	4.54	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	UBE2H	P62256	183 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	RPS14	P62263	151 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	RPS21	P63220	83 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	EIF3I	Q13347	325 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	RTP5	Q14D33	572 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	TPD52L1	Q16890	204 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	GEN1	Q17RS7	908 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	ANKRD39	Q53RE8	183 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	BROX	Q5VW32	411 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	ANKRD40	Q6AI12	368 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	SPOPL	Q6IQ16	392 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	KIAA1161	Q6NSJ0	714 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	PMF1	Q6P1K2	205 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	LVRN	Q6Q4G3	990 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	RNF111	Q6ZNA4	994 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	TRIM59	Q8IWR1	403 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	RAVER1	Q8IY67	606 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	PCDH20	Q8N6Y1	951 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	UBR7	Q8N806	425 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	DCAF4L2	Q8NA75	395 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	DENND6B	Q8NEG7	585 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	NAT6	Q93015	286 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	ZNF578	Q96N58	590 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	TWNK	Q96RR1	684 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	CDADC1	Q9BWV3	514 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	DPH1	Q9BZG8	443 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	IKZF4	Q9H2S9	585 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	WDCP	Q9H6R7	721 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	SYNC	Q9H7C4	482 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	KLHL11	Q9NVR0	708 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	PRR13	Q9NZ81	148 aa		4.54	□□□□□ -1.68

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