RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504440.1

NPHP3-AS1-202, NPHP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NPHP3-AS1, Length 2,507 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 TXNDC16Q9P2K2 825 aa6.67□□□□□ -1.34
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP6.67□□□□□ -1.34
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 A0A0G2JMZ2 1700 aa6.67□□□□□ -1.34
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 A0A096LPK6 155 aa6.67□□□□□ -1.34
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa6.67□□□□□ -1.34
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 M0QYT0 321 aa6.67□□□□□ -1.34
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 NRP1O14786 923 aa6.67□□□□□ -1.34
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CELF2O95319 508 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 C2P06681 752 aa6.67□□□□□ -1.34
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 POLBP06746 335 aa6.67□□□□□ -1.34
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CYP2C8P10632 490 aa6.67□□□□□ -1.34
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 UQCRBP14927 111 aa6.67□□□□□ -1.34
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CNTFP26441 200 aa6.67□□□□□ -1.34
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CD68P34810 354 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 GP5P40197 560 aa6.67□□□□□ -1.34
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 MS4A2Q01362 244 aa6.67□□□□□ -1.34
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 BTKQ06187 659 aa6.67□□□□□ -1.34
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ZBTB6Q15916 424 aa6.67□□□□□ -1.34
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 LIN52Q52LA3 116 aa6.67□□□□□ -1.34
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ZNF484Q5JVG2 852 aa6.67□□□□□ -1.34
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 TMEM201Q5SNT2 666 aa6.67□□□□□ -1.34
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 STXBP5Q5T5C0 1151 aa6.67□□□□□ -1.34
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CDCP2Q5VXM1 449 aa6.67□□□□□ -1.34
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 PAOXQ6QHF9 649 aa6.67□□□□□ -1.34
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CYS1Q717R9 158 aa6.67□□□□□ -1.34
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 OSTM1Q86WC4 334 aa6.67□□□□□ -1.34
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 MFN1Q8IWA4 741 aa6.67□□□□□ -1.34
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 NPWQ8N729 165 aa6.67□□□□□ -1.34
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 DNAAF3Q8N9W5 541 aa6.67□□□□□ -1.34
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 FAM156AQ8NDB6 213 aa6.67□□□□□ -1.34
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa6.67□□□□□ -1.34
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 C16orf70Q9BSU1 422 aa6.67□□□□□ -1.34
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SPATA16Q9BXB7 569 aa6.67□□□□□ -1.34
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa6.67□□□□□ -1.34
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 RECQL4O94761 1208 aa6.66□□□□□ -1.34
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SBK3P0C264 359 aa6.66□□□□□ -1.34
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 MLNP12872 115 aa6.66□□□□□ -1.34
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 PTPN3P26045 913 aa6.66□□□□□ -1.34
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 NMBRP28336 390 aa6.66□□□□□ -1.34
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 DPP6P42658 865 aa6.66□□□□□ -1.34
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 MATKP42679 507 aa6.66□□□□□ -1.34
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SLC26A2P50443 739 aa6.66□□□□□ -1.34
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CDK7P50613 346 aa6.66□□□□□ -1.34
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 MRPS22P82650 360 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 FOLH1Q04609 750 aa6.66□□□□□ -1.34
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 DEUP1Q05D60 604 aa6.66□□□□□ -1.34
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ZBTB17Q13105 803 aa6.66□□□□□ -1.34
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 PDK3Q15120 406 aa6.66□□□□□ -1.34
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa6.66□□□□□ -1.34
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 MMEL1Q495T6 779 aa6.66□□□□□ -1.34
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa6.66□□□□□ -1.34
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 AP1ARQ63HQ0 302 aa6.66□□□□□ -1.34
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ARHGAP17Q68EM7 881 aa6.66□□□□□ -1.34
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ZNF280DQ6N043 979 aa6.66□□□□□ -1.34
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 AAGABQ6PD74 315 aa6.66□□□□□ -1.34
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 KBTBD6Q86V97 674 aa6.66□□□□□ -1.34
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SNX32Q86XE0 403 aa6.66□□□□□ -1.34
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 C2orf69Q8N8R5 385 aa6.66□□□□□ -1.34
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 URGCPQ8TCY9 931 aa6.66□□□□□ -1.34
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 KLHL6Q8WZ60 621 aa6.66□□□□□ -1.34
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CMTM5Q96DZ9 223 aa6.66□□□□□ -1.34
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SNX27Q96L92 541 aa6.66□□□□□ -1.34
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CDRT15Q96T59 188 aa6.66□□□□□ -1.34
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 RBBP8Q99708 897 aa6.66□□□□□ -1.34
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 OMDQ99983 421 aa6.66□□□□□ -1.34
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 NUF2Q9BZD4 464 aa6.66□□□□□ -1.34
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 RAD18Q9NS91 495 aa6.66□□□□□ -1.34
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 UBAP1Q9NZ09 502 aa6.66□□□□□ -1.34
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CLIC5Q9NZA1 410 aa6.66□□□□□ -1.34
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 DNAJB4Q9UDY4 337 aa6.66□□□□□ -1.34
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa6.66□□□□□ -1.34
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa6.66□□□□□ -1.34
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SLC39A10Q9ULF5 831 aa6.66□□□□□ -1.34
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SORCS3Q9UPU3 1222 aa6.66□□□□□ -1.34
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa6.66□□□□□ -1.34
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 A0A1B0GTW7 788 aa6.66□□□□□ -1.34
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 TMEM233B4DJY2 109 aa6.66□□□□□ -1.34
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SHISA8B8ZZ34 492 aa6.66□□□□□ -1.34
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 TNFRSF10CO14798 259 aa6.66□□□□□ -1.34
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 FBXO21O94952 628 aa6.66□□□□□ -1.34
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 FYNP06241 537 aa6.66□□□□□ -1.34
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SETSIPP0DME0 302 aa6.66□□□□□ -1.34
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ERCC2P18074 760 aa6.66□□□□□ -1.34
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 GRK2P25098 689 aa6.66□□□□□ -1.34
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 PIK3R1P27986 724 aa6.66□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.1 ms