RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504294.5

SH3BP2-208, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 557 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-208ENST00000504294 KCNF1Q9H3M0 494 aa14.68□□□□□ -0.06
SH3BP2-208ENST00000504294 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
SH3BP2-208ENST00000504294 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa14.68□□□□□ -0.06
SH3BP2-208ENST00000504294 SEPT10Q9P0V9 454 aa14.68□□□□□ -0.06
SH3BP2-208ENST00000504294 SERGEFQ9UGK8 458 aa14.68□□□□□ -0.06
SH3BP2-208ENST00000504294 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
SH3BP2-208ENST00000504294 KCNK1O00180 336 aa14.67□□□□□ -0.06
SH3BP2-208ENST00000504294 TOR1BO14657 336 aa14.67□□□□□ -0.06
SH3BP2-208ENST00000504294 DFNA5O60443 496 aa14.67□□□□□ -0.06
SH3BP2-208ENST00000504294 PIGNO95427 931 aa14.67□□□□□ -0.06
SH3BP2-208ENST00000504294 CPP00450 1065 aa14.67□□□□□ -0.06
SH3BP2-208ENST00000504294 RBP3P10745 1247 aa14.67□□□□□ -0.06
SH3BP2-208ENST00000504294 ITPKAP23677 461 aa14.67□□□□□ -0.06
SH3BP2-208ENST00000504294 ACTN2P35609 894 aa14.67□□□□□ -0.06
SH3BP2-208ENST00000504294 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
SH3BP2-208ENST00000504294 RACK1P63244 317 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
SH3BP2-208ENST00000504294 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
SH3BP2-208ENST00000504294 PRPSAP1Q14558 356 aa14.67□□□□□ -0.06
SH3BP2-208ENST00000504294 ZNF569Q5MCW4 686 aa14.67□□□□□ -0.06
SH3BP2-208ENST00000504294 USP45Q70EL2 814 aa14.67□□□□□ -0.06
SH3BP2-208ENST00000504294 ARMCX6Q7L4S7 300 aa14.67□□□□□ -0.06
SH3BP2-208ENST00000504294 PID1Q7Z2X4 250 aa14.67□□□□□ -0.06
SH3BP2-208ENST00000504294 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
SH3BP2-208ENST00000504294 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
SH3BP2-208ENST00000504294 IQCHQ86VS3 1027 aa14.67□□□□□ -0.06
SH3BP2-208ENST00000504294 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
SH3BP2-208ENST00000504294 CAMK1DQ8IU85 385 aa14.67□□□□□ -0.06
SH3BP2-208ENST00000504294 REXO1L1PQ8IX06 675 aa14.67□□□□□ -0.06
SH3BP2-208ENST00000504294 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
SH3BP2-208ENST00000504294 ACTL9Q8TC94 416 aa14.67□□□□□ -0.06
SH3BP2-208ENST00000504294 TEKT5Q96M29 485 aa14.67□□□□□ -0.06
SH3BP2-208ENST00000504294 SLC25A51Q9H1U9 297 aa14.67□□□□□ -0.06
SH3BP2-208ENST00000504294 NOD2Q9HC29 1040 aa14.67□□□□□ -0.06
SH3BP2-208ENST00000504294 CD93Q9NPY3 652 aa14.67□□□□□ -0.06
SH3BP2-208ENST00000504294 SEMA4GQ9NTN9 838 aa14.67□□□□□ -0.06
SH3BP2-208ENST00000504294 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
SH3BP2-208ENST00000504294 A0A1W2PQU0 124 aa14.66□□□□□ -0.06
SH3BP2-208ENST00000504294 CES2O00748 559 aa14.66□□□□□ -0.06
SH3BP2-208ENST00000504294 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
SH3BP2-208ENST00000504294 ANXA9O76027 345 aa14.66□□□□□ -0.06
SH3BP2-208ENST00000504294 TIMP2P16035 220 aa14.66□□□□□ -0.06
SH3BP2-208ENST00000504294 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
SH3BP2-208ENST00000504294 GKP32189 559 aa14.66□□□□□ -0.06
SH3BP2-208ENST00000504294 RGRP47804 291 aa14.66□□□□□ -0.06
SH3BP2-208ENST00000504294 GRIA4P48058 902 aa14.66□□□□□ -0.06
SH3BP2-208ENST00000504294 MAXP61244 160 aa14.66□□□□□ -0.06
SH3BP2-208ENST00000504294 SPEM2Q0P670 501 aa14.66□□□□□ -0.06
SH3BP2-208ENST00000504294 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
SH3BP2-208ENST00000504294 STAT4Q14765 748 aa14.66□□□□□ -0.06
SH3BP2-208ENST00000504294 TMEM52BQ4KMG9 183 aa14.66□□□□□ -0.06
SH3BP2-208ENST00000504294 TRIM61Q5EBN2 209 aa14.66□□□□□ -0.06
SH3BP2-208ENST00000504294 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa14.66□□□□□ -0.06
SH3BP2-208ENST00000504294 C4orf22Q6V702 233 aa14.66□□□□□ -0.06
SH3BP2-208ENST00000504294 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
SH3BP2-208ENST00000504294 PGBD5Q8N414 524 aa14.66□□□□□ -0.06
SH3BP2-208ENST00000504294 DEFB119Q8N690 84 aa14.66□□□□□ -0.06
SH3BP2-208ENST00000504294 DENND6BQ8NEG7 585 aa14.66□□□□□ -0.06
SH3BP2-208ENST00000504294 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
SH3BP2-208ENST00000504294 AGAP3Q96P47 875 aa14.66□□□□□ -0.06
SH3BP2-208ENST00000504294 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
SH3BP2-208ENST00000504294 PHOX2BQ99453 314 aa14.66□□□□□ -0.06
SH3BP2-208ENST00000504294 GLOD4Q9HC38 313 aa14.66□□□□□ -0.06
SH3BP2-208ENST00000504294 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
SH3BP2-208ENST00000504294 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
SH3BP2-208ENST00000504294 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
SH3BP2-208ENST00000504294 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
SH3BP2-208ENST00000504294 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa14.66□□□□□ -0.06
SH3BP2-208ENST00000504294 RAI2Q9Y5P3 530 aa14.66□□□□□ -0.06
SH3BP2-208ENST00000504294 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
SH3BP2-208ENST00000504294 AREL1O15033 823 aa14.65□□□□□ -0.06
SH3BP2-208ENST00000504294 MUSKO15146 869 aa14.65□□□□□ -0.06
SH3BP2-208ENST00000504294 PSMD3O43242 534 aa14.65□□□□□ -0.06
SH3BP2-208ENST00000504294 OPHN1O60890 802 aa14.65□□□□□ -0.06
SH3BP2-208ENST00000504294 TM7SF2O76062 418 aa14.65□□□□□ -0.06
SH3BP2-208ENST00000504294 PGLSO95336 258 aa14.65□□□□□ -0.06
SH3BP2-208ENST00000504294 CFIP05156 583 aa14.65□□□□□ -0.06
SH3BP2-208ENST00000504294 HLA-DQB2P05538 268 aa14.65□□□□□ -0.06
SH3BP2-208ENST00000504294 IGHV4-34P06331 123 aa14.65□□□□□ -0.06
SH3BP2-208ENST00000504294 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
SH3BP2-208ENST00000504294 PTPN3P26045 913 aa14.65□□□□□ -0.06
SH3BP2-208ENST00000504294 C21orf59P57076 290 aa14.65□□□□□ -0.06
SH3BP2-208ENST00000504294 TAS2R38P59533 333 aa14.65□□□□□ -0.06
SH3BP2-208ENST00000504294 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
SH3BP2-208ENST00000504294 LLGL1Q15334 1064 aa14.65□□□□□ -0.06
SH3BP2-208ENST00000504294 IFT43Q96FT9 208 aa14.65□□□□□ -0.06
SH3BP2-208ENST00000504294 SCRN2Q96FV2 425 aa14.65□□□□□ -0.06
SH3BP2-208ENST00000504294 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
SH3BP2-208ENST00000504294 SERAC1Q96JX3 654 aa14.65□□□□□ -0.06
SH3BP2-208ENST00000504294 FCRL5Q96RD9 977 aa14.65□□□□□ -0.06
SH3BP2-208ENST00000504294 TLR10Q9BXR5 811 aa14.65□□□□□ -0.06
SH3BP2-208ENST00000504294 SLC17A9Q9BYT1 436 aa14.65□□□□□ -0.06
SH3BP2-208ENST00000504294 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa14.65□□□□□ -0.06
SH3BP2-208ENST00000504294 KCND1Q9NSA2 647 aa14.65□□□□□ -0.06
SH3BP2-208ENST00000504294 FAM153AQ9UHL3 310 aa14.65□□□□□ -0.06
SH3BP2-208ENST00000504294 PPIL1Q9Y3C6 166 aa14.65□□□□□ -0.06
SH3BP2-208ENST00000504294 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa14.65□□□□□ -0.06
SH3BP2-208ENST00000504294 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa14.65□□□□□ -0.06
SH3BP2-208ENST00000504294 SPAG17Q6Q759 2223 aa14.64□□□□□ -0.07
SH3BP2-208ENST00000504294 C10orf142B7Z368 130 aa14.64□□□□□ -0.07
SH3BP2-208ENST00000504294 PSMD11O00231 422 aa14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.7 ms