RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498428.5

ROBO1-211, Transcript of roundabout guidance receptor 1, humanhuman

TSL 2

Gene ROBO1, Length 3,566 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROBO1-211ENST00000498428 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
ROBO1-211ENST00000498428 BOLA3Q53S33 107 aa7.3□□□□□ -1.24
ROBO1-211ENST00000498428 RTP2Q5QGT7 225 aa7.3□□□□□ -1.24
ROBO1-211ENST00000498428 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
ROBO1-211ENST00000498428 AAGABQ6PD74 315 aa7.3□□□□□ -1.24
ROBO1-211ENST00000498428 DEPDC4Q8N2C3 294 aa7.3□□□□□ -1.24
ROBO1-211ENST00000498428 PRELID2Q8N945 189 aa7.3□□□□□ -1.24
ROBO1-211ENST00000498428 SGF29Q96ES7 293 aa7.3□□□□□ -1.24
ROBO1-211ENST00000498428 DCUN1D1Q96GG9 259 aa7.3□□□□□ -1.24
ROBO1-211ENST00000498428 CCDC138Q96M89 665 aa7.3□□□□□ -1.24
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ROBO1-211ENST00000498428 NMUR2Q9GZQ4 415 aa7.3□□□□□ -1.24
ROBO1-211ENST00000498428 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa7.3□□□□□ -1.24
ROBO1-211ENST00000498428 POM121CA8CG34 1229 aa7.3□□□□□ -1.24
ROBO1-211ENST00000498428 F5H423 210 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
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ROBO1-211ENST00000498428 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
ROBO1-211ENST00000498428 BMXP51813 675 aa7.3□□□□□ -1.24
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ROBO1-211ENST00000498428 PLD1Q13393 1074 aa7.3□□□□□ -1.24
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ROBO1-211ENST00000498428 FAM182AQ5T1J6 154 aa7.3□□□□□ -1.24
ROBO1-211ENST00000498428 CLIP4Q8N3C7 705 aa7.3□□□□□ -1.24
ROBO1-211ENST00000498428 TTC9BQ8N6N2 239 aa7.3□□□□□ -1.24
ROBO1-211ENST00000498428 PPM1NQ8N819 430 aa7.3□□□□□ -1.24
ROBO1-211ENST00000498428 SLC7A14Q8TBB6 771 aa7.3□□□□□ -1.24
ROBO1-211ENST00000498428 ZNF398Q8TD17 642 aa7.3□□□□□ -1.24
ROBO1-211ENST00000498428 CLEC4CQ8WTT0 213 aa7.3□□□□□ -1.24
ROBO1-211ENST00000498428 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
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ROBO1-211ENST00000498428 THAP11Q96EK4 314 aa7.3□□□□□ -1.24
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ROBO1-211ENST00000498428 ULBP1Q9BZM6 244 aa7.3□□□□□ -1.24
ROBO1-211ENST00000498428 ADNPQ9H2P0 1102 aa7.3□□□□□ -1.24
ROBO1-211ENST00000498428 TP63Q9H3D4 680 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
ROBO1-211ENST00000498428 KCNK13Q9HB14 408 aa7.3□□□□□ -1.24
ROBO1-211ENST00000498428 COQ4Q9Y3A0 265 aa7.3□□□□□ -1.24
ROBO1-211ENST00000498428 AP4B1Q9Y6B7 739 aa7.3□□□□□ -1.24
ROBO1-211ENST00000498428 ATP8B3O60423 1300 aa7.3□□□□□ -1.24
ROBO1-211ENST00000498428 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
ROBO1-211ENST00000498428 FGF18O76093 207 aa7.3□□□□□ -1.24
ROBO1-211ENST00000498428 MYO1DO94832 1006 aa7.3□□□□□ -1.24
ROBO1-211ENST00000498428 LRG1P02750 347 aa7.3□□□□□ -1.24
ROBO1-211ENST00000498428 FAM58BPP0C7Q3 252 aa7.3□□□□□ -1.24
ROBO1-211ENST00000498428 GJA1P17302 382 aa7.3□□□□□ -1.24
ROBO1-211ENST00000498428 CD247P20963 164 aa7.3□□□□□ -1.24
ROBO1-211ENST00000498428 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
ROBO1-211ENST00000498428 PBX2P40425 430 aa7.3□□□□□ -1.24
ROBO1-211ENST00000498428 KCNJ1P48048 391 aa7.3□□□□□ -1.24
ROBO1-211ENST00000498428 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
ROBO1-211ENST00000498428 BCAT1P54687 386 aa7.3□□□□□ -1.24
ROBO1-211ENST00000498428 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
ROBO1-211ENST00000498428 CDK16Q00536 496 aa7.3□□□□□ -1.24
ROBO1-211ENST00000498428 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
ROBO1-211ENST00000498428 CCNIQ14094 377 aa7.3□□□□□ -1.24
ROBO1-211ENST00000498428 DSC3Q14574 896 aa7.3□□□□□ -1.24
ROBO1-211ENST00000498428 C6orf52Q5T4I8 152 aa7.3□□□□□ -1.24
ROBO1-211ENST00000498428 ACAD10Q6JQN1 1059 aa7.3□□□□□ -1.24
ROBO1-211ENST00000498428 LVRNQ6Q4G3 990 aa7.3□□□□□ -1.24
ROBO1-211ENST00000498428 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
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ROBO1-211ENST00000498428 JAZF1Q86VZ6 243 aa7.3□□□□□ -1.24
ROBO1-211ENST00000498428 FAM131BQ86XD5 332 aa7.3□□□□□ -1.24
ROBO1-211ENST00000498428 HERC6Q8IVU3 1022 aa7.3□□□□□ -1.24
ROBO1-211ENST00000498428 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
ROBO1-211ENST00000498428 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP7.3□□□□□ -1.24
ROBO1-211ENST00000498428 SCAMP5Q8TAC9 235 aa7.3□□□□□ -1.24
ROBO1-211ENST00000498428 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
ROBO1-211ENST00000498428 MAML1Q92585 1016 aa7.3□□□□□ -1.24
ROBO1-211ENST00000498428 FBXO32Q969P5 355 aa7.3□□□□□ -1.24
ROBO1-211ENST00000498428 TOP1MTQ969P6 601 aa7.3□□□□□ -1.24
ROBO1-211ENST00000498428 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
ROBO1-211ENST00000498428 CPXM1Q96SM3 734 aa7.3□□□□□ -1.24
ROBO1-211ENST00000498428 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
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ROBO1-211ENST00000498428 ERGIC3Q9Y282 383 aa7.3□□□□□ -1.24
ROBO1-211ENST00000498428 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa7.3□□□□□ -1.24
ROBO1-211ENST00000498428 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa7.3□□□□□ -1.24
ROBO1-211ENST00000498428 LCTP09848 1927 aa7.29□□□□□ -1.24
ROBO1-211ENST00000498428 MDM4O15151 490 aa7.29□□□□□ -1.24
ROBO1-211ENST00000498428 CDH16O75309 829 aa7.29□□□□□ -1.24
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ROBO1-211ENST00000498428 ZNF23P17027 643 aa7.29□□□□□ -1.24
ROBO1-211ENST00000498428 PRKCAP17252 672 aa7.29□□□□□ -1.24
ROBO1-211ENST00000498428 LAG3P18627 525 aa7.29□□□□□ -1.24
ROBO1-211ENST00000498428 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
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ROBO1-211ENST00000498428 TPTEP56180 551 aa7.29□□□□□ -1.24
ROBO1-211ENST00000498428 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
ROBO1-211ENST00000498428 C10orf120Q5SQS8 335 aa7.29□□□□□ -1.24
ROBO1-211ENST00000498428 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
ROBO1-211ENST00000498428 GSTA5Q7RTV2 222 aa7.29□□□□□ -1.24
ROBO1-211ENST00000498428 PCGF5Q86SE9 256 aa7.29□□□□□ -1.24
ROBO1-211ENST00000498428 FAM35AQ86V20 835 aa7.29□□□□□ -1.24
ROBO1-211ENST00000498428 NETO2Q8NC67 525 aa7.29□□□□□ -1.24
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