RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496246.5

TTLL3-231, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

TSL 4

Gene TTLL3, Length 507 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-231	ENST00000496246	WRAP53	Q9BUR4	548 aa	Known RBP	11.44	□□□□□ -0.58
TTLL3-231	ENST00000496246	DUSP23	Q9BVJ7	150 aa		11.44	□□□□□ -0.58
TTLL3-231	ENST00000496246	PACSIN1	Q9BY11	444 aa		11.44	□□□□□ -0.58
TTLL3-231	ENST00000496246	KLC2	Q9H0B6	622 aa		11.44	□□□□□ -0.58
TTLL3-231	ENST00000496246	EBF2	Q9HAK2	575 aa		11.44	□□□□□ -0.58
TTLL3-231	ENST00000496246	FZD3	Q9NPG1	666 aa		11.44	□□□□□ -0.58
TTLL3-231	ENST00000496246	DNAJC28	Q9NX36	388 aa		11.44	□□□□□ -0.58
TTLL3-231	ENST00000496246	NCKIPSD	Q9NZQ3	722 aa		11.44	□□□□□ -0.58
TTLL3-231	ENST00000496246	LHX3	Q9UBR4	397 aa		11.44	□□□□□ -0.58
TTLL3-231	ENST00000496246	AMACR	Q9UHK6	382 aa		11.44	□□□□□ -0.58
TTLL3-231	ENST00000496246	DNPEP	Q9ULA0	475 aa		11.44	□□□□□ -0.58
TTLL3-231	ENST00000496246	DOLK	Q9UPQ8	538 aa		11.44	□□□□□ -0.58
TTLL3-231	ENST00000496246	ATP8A1	Q9Y2Q0	1164 aa		11.44	□□□□□ -0.58
TTLL3-231	ENST00000496246	PLXNA2	O75051	1894 aa		11.43	□□□□□ -0.58
TTLL3-231	ENST00000496246	APOL1	O14791	398 aa		11.43	□□□□□ -0.58
TTLL3-231	ENST00000496246	INSIG1	O15503	277 aa		11.43	□□□□□ -0.58
TTLL3-231	ENST00000496246	NRDC	O43847	1150 aa		11.43	□□□□□ -0.58
TTLL3-231	ENST00000496246	MMP20	O60882	483 aa		11.43	□□□□□ -0.58
TTLL3-231	ENST00000496246	MTA2	O94776	668 aa		11.43	□□□□□ -0.58
TTLL3-231	ENST00000496246	KRT1	P04264	644 aa		11.43	□□□□□ -0.58
TTLL3-231	ENST00000496246	WNT1	P04628	370 aa		11.43	□□□□□ -0.58
TTLL3-231	ENST00000496246	PTMA	P06454	111 aa	Known RBP	11.43	□□□□□ -0.58
TTLL3-231	ENST00000496246	C1S	P09871	688 aa		11.43	□□□□□ -0.58
TTLL3-231	ENST00000496246	TNNT1	P13805	278 aa		11.43	□□□□□ -0.58
TTLL3-231	ENST00000496246	TIMP2	P16035	220 aa		11.43	□□□□□ -0.58
TTLL3-231	ENST00000496246	KEL	P23276	732 aa		11.43	□□□□□ -0.58
TTLL3-231	ENST00000496246	CCNC	P24863	283 aa		11.43	□□□□□ -0.58
TTLL3-231	ENST00000496246	HNF1B	P35680	557 aa		11.43	□□□□□ -0.58
TTLL3-231	ENST00000496246	GARS	P41250	739 aa	Known RBP	11.43	□□□□□ -0.58
TTLL3-231	ENST00000496246	ABL2	P42684	1182 aa		11.43	□□□□□ -0.58
TTLL3-231	ENST00000496246	DUSP3	P51452	185 aa	Predicted RBP	11.43	□□□□□ -0.58
TTLL3-231	ENST00000496246	ZNF75D	P51815	510 aa		11.43	□□□□□ -0.58
TTLL3-231	ENST00000496246	BNC1	Q01954	994 aa		11.43	□□□□□ -0.58
TTLL3-231	ENST00000496246	TBX2	Q13207	712 aa	Predicted RBP	11.43	□□□□□ -0.58
TTLL3-231	ENST00000496246	PDE1C	Q14123	709 aa	Predicted RBP	11.43	□□□□□ -0.58
TTLL3-231	ENST00000496246	TFDP2	Q14188	446 aa		11.43	□□□□□ -0.58
TTLL3-231	ENST00000496246	PAFAH1B3	Q15102	231 aa	Known RBP	11.43	□□□□□ -0.58
TTLL3-231	ENST00000496246	PDK1	Q15118	436 aa		11.43	□□□□□ -0.58
TTLL3-231	ENST00000496246	ASTE1	Q2TB18	679 aa	Predicted RBP	11.43	□□□□□ -0.58
TTLL3-231	ENST00000496246	TMEM52B	Q4KMG9	183 aa		11.43	□□□□□ -0.58
TTLL3-231	ENST00000496246	CCDC157	Q569K6	752 aa		11.43	□□□□□ -0.58
TTLL3-231	ENST00000496246	PRAMEF14	Q5SWL7	426 aa		11.43	□□□□□ -0.58
TTLL3-231	ENST00000496246	ARMC12	Q5T9G4	340 aa		11.43	□□□□□ -0.58
TTLL3-231	ENST00000496246	LRRC38	Q5VT99	294 aa		11.43	□□□□□ -0.58
TTLL3-231	ENST00000496246	DBX2	Q6ZNG2	339 aa		11.43	□□□□□ -0.58
TTLL3-231	ENST00000496246	CYP4V2	Q6ZWL3	525 aa	Predicted RBP	11.43	□□□□□ -0.58
TTLL3-231	ENST00000496246	USP45	Q70EL2	814 aa		11.43	□□□□□ -0.58
TTLL3-231	ENST00000496246	ABI3BP	Q7Z7G0	1075 aa		11.43	□□□□□ -0.58
TTLL3-231	ENST00000496246	VSIG1	Q86XK7	387 aa		11.43	□□□□□ -0.58
TTLL3-231	ENST00000496246	RFX6	Q8HWS3	928 aa		11.43	□□□□□ -0.58
TTLL3-231	ENST00000496246	CAMK1D	Q8IU85	385 aa		11.43	□□□□□ -0.58
TTLL3-231	ENST00000496246	ARHGAP12	Q8IWW6	846 aa		11.43	□□□□□ -0.58
TTLL3-231	ENST00000496246	NPW	Q8N729	165 aa		11.43	□□□□□ -0.58
TTLL3-231	ENST00000496246	SCG3	Q8WXD2	468 aa	Known RBP	11.43	□□□□□ -0.58
TTLL3-231	ENST00000496246	CAMK1G	Q96NX5	476 aa		11.43	□□□□□ -0.58
TTLL3-231	ENST00000496246	PANX2	Q96RD6	677 aa		11.43	□□□□□ -0.58
TTLL3-231	ENST00000496246	NUDCD1	Q96RS6	583 aa		11.43	□□□□□ -0.58
TTLL3-231	ENST00000496246	C1QTNF2	Q9BXJ5	285 aa		11.43	□□□□□ -0.58
TTLL3-231	ENST00000496246	SLC13A1	Q9BZW2	595 aa		11.43	□□□□□ -0.58
TTLL3-231	ENST00000496246	PHTF1	Q9UMS5	762 aa		11.43	□□□□□ -0.58
TTLL3-231	ENST00000496246	ZFR2	Q9UPR6	939 aa	Known RBP	11.43	□□□□□ -0.58
TTLL3-231	ENST00000496246	NEUROG3	Q9Y4Z2	214 aa		11.43	□□□□□ -0.58
TTLL3-231	ENST00000496246	TSPAN11	A1L157	253 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TTLL3-231	ENST00000496246	ZNF487	B1APH4	448 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TTLL3-231	ENST00000496246	CACNB4	O00305	520 aa	Predicted RBP	11.42	□□□□□ -0.58
TTLL3-231	ENST00000496246	PDE2A	O00408	941 aa	Predicted RBP	11.42	□□□□□ -0.58
TTLL3-231	ENST00000496246	ENC1	O14682	589 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TTLL3-231	ENST00000496246	AREL1	O15033	823 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TTLL3-231	ENST00000496246	CP	P00450	1065 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TTLL3-231	ENST00000496246	CTSE	P14091	401 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TTLL3-231	ENST00000496246	TCF4	P15884	667 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TTLL3-231	ENST00000496246	KDELR1	P24390	212 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TTLL3-231	ENST00000496246	PEX5	P50542	639 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TTLL3-231	ENST00000496246	CLDN2	P57739	230 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TTLL3-231	ENST00000496246	SLC10A7	Q0GE19	358 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TTLL3-231	ENST00000496246	GALNT2	Q10471	571 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TTLL3-231	ENST00000496246	MMRN1	Q13201	1228 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TTLL3-231	ENST00000496246	ILK	Q13418	452 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TTLL3-231	ENST00000496246	ACOX1	Q15067	660 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TTLL3-231	ENST00000496246	CCDC181	Q5TID7	509 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TTLL3-231	ENST00000496246	CCDC70	Q6NSX1	233 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TTLL3-231	ENST00000496246	KIAA1328	Q86T90	577 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TTLL3-231	ENST00000496246	GATAD2A	Q86YP4	633 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TTLL3-231	ENST00000496246	CCDC50	Q8IVM0	306 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TTLL3-231	ENST00000496246	CCDC13	Q8IYE1	715 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TTLL3-231	ENST00000496246	EID2	Q8N6I1	236 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TTLL3-231	ENST00000496246	NETO2	Q8NC67	525 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TTLL3-231	ENST00000496246	OR13H1	Q8NG92	308 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TTLL3-231	ENST00000496246	FAM71B	Q8TC56	605 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TTLL3-231	ENST00000496246	SAP25	Q8TEE9	199 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TTLL3-231	ENST00000496246	ADAMTS14	Q8WXS8	1223 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TTLL3-231	ENST00000496246	IL12RB2	Q99665	862 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TTLL3-231	ENST00000496246	MGME1	Q9BQP7	344 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TTLL3-231	ENST00000496246	BRD8	Q9H0E9	1235 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TTLL3-231	ENST00000496246	NT5M	Q9NPB1	228 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TTLL3-231	ENST00000496246	PCDH12	Q9NPG4	1184 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TTLL3-231	ENST00000496246	SPAST	Q9UBP0	616 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TTLL3-231	ENST00000496246	NENF	Q9UMX5	172 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TTLL3-231	ENST00000496246	PCDHGA1	Q9Y5H4	931 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TTLL3-231	ENST00000496246	PCDHA13	Q9Y5I0	950 aa		11.42	□□□□□ -0.58

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.1 ms