RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489352.5

HDAC6-233, Transcript of histone deacetylase 6, human

TSL 4

Gene HDAC6, Length 585 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDAC6-233	ENST00000489352	AHCYL2	Q96HN2	611 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
HDAC6-233	ENST00000489352	RPRD1A	Q96P16	312 aa	Predicted RBP	11.66	□□□□□ -0.54
HDAC6-233	ENST00000489352	LRRC27	Q9C0I9	530 aa		11.66	□□□□□ -0.54
HDAC6-233	ENST00000489352	MBNL1	Q9NR56	388 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
HDAC6-233	ENST00000489352	XPO7	Q9UIA9	1087 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
HDAC6-233	ENST00000489352	TSPAN16	Q9UKR8	245 aa		11.66	□□□□□ -0.54
HDAC6-233	ENST00000489352	PCDHGB7	Q9Y5F8	929 aa		11.66	□□□□□ -0.54
HDAC6-233	ENST00000489352	ANKRD36	A6QL64	1941 aa		11.66	□□□□□ -0.54
HDAC6-233	ENST00000489352	FER1L5	A0AVI2	2057 aa		11.65	□□□□□ -0.54
HDAC6-233	ENST00000489352	ZSCAN5C	A6NGD5	496 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
HDAC6-233	ENST00000489352	C16orf96	A6NNT2	1141 aa		11.65	□□□□□ -0.54
HDAC6-233	ENST00000489352		H3BQV1	296 aa		11.65	□□□□□ -0.54
HDAC6-233	ENST00000489352	PIK3R2	O00459	728 aa		11.65	□□□□□ -0.54
HDAC6-233	ENST00000489352	SMAD6	O43541	496 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
HDAC6-233	ENST00000489352	MMP20	O60882	483 aa		11.65	□□□□□ -0.54
HDAC6-233	ENST00000489352	CREG1	O75629	220 aa		11.65	□□□□□ -0.54
HDAC6-233	ENST00000489352	CCNYL3	P0C7X3	344 aa		11.65	□□□□□ -0.54
HDAC6-233	ENST00000489352	CD99	P14209	185 aa		11.65	□□□□□ -0.54
HDAC6-233	ENST00000489352	CAPN3	P20807	821 aa		11.65	□□□□□ -0.54
HDAC6-233	ENST00000489352	NFKBIA	P25963	317 aa		11.65	□□□□□ -0.54
HDAC6-233	ENST00000489352	MAZ	P56270	477 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
HDAC6-233	ENST00000489352	DLG4	P78352	724 aa		11.65	□□□□□ -0.54
HDAC6-233	ENST00000489352	LRRC14	Q15048	493 aa		11.65	□□□□□ -0.54
HDAC6-233	ENST00000489352	KLHL40	Q2TBA0	621 aa		11.65	□□□□□ -0.54
HDAC6-233	ENST00000489352	ZC3H12A	Q5D1E8	599 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
HDAC6-233	ENST00000489352	SLC6A19	Q695T7	634 aa		11.65	□□□□□ -0.54
HDAC6-233	ENST00000489352	C22orf39	Q6P5X5	142 aa		11.65	□□□□□ -0.54
HDAC6-233	ENST00000489352	C6orf15	Q6UXA7	325 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
HDAC6-233	ENST00000489352	CENPQ	Q7L2Z9	268 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
HDAC6-233	ENST00000489352	TAOK1	Q7L7X3	1001 aa		11.65	□□□□□ -0.54
HDAC6-233	ENST00000489352	CDH24	Q86UP0	819 aa		11.65	□□□□□ -0.54
HDAC6-233	ENST00000489352	SFTPA2	Q8IWL1	248 aa		11.65	□□□□□ -0.54
HDAC6-233	ENST00000489352	CISD2	Q8N5K1	135 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
HDAC6-233	ENST00000489352		Q8NA96	180 aa		11.65	□□□□□ -0.54
HDAC6-233	ENST00000489352	SLC4A11	Q8NBS3	891 aa		11.65	□□□□□ -0.54
HDAC6-233	ENST00000489352	DQX1	Q8TE96	717 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
HDAC6-233	ENST00000489352	SEC14L1	Q92503	715 aa		11.65	□□□□□ -0.54
HDAC6-233	ENST00000489352	ALG14	Q96F25	216 aa		11.65	□□□□□ -0.54
HDAC6-233	ENST00000489352	STAMBPL1	Q96FJ0	436 aa		11.65	□□□□□ -0.54
HDAC6-233	ENST00000489352	WDR92	Q96MX6	357 aa		11.65	□□□□□ -0.54
HDAC6-233	ENST00000489352	ULBP3	Q9BZM4	244 aa		11.65	□□□□□ -0.54
HDAC6-233	ENST00000489352	ZDHHC6	Q9H6R6	413 aa		11.65	□□□□□ -0.54
HDAC6-233	ENST00000489352	CHST11	Q9NPF2	352 aa		11.65	□□□□□ -0.54
HDAC6-233	ENST00000489352	FBXO8	Q9NRD0	319 aa		11.65	□□□□□ -0.54
HDAC6-233	ENST00000489352	MOSPD1	Q9UJG1	213 aa		11.65	□□□□□ -0.54
HDAC6-233	ENST00000489352	ITM2B	Q9Y287	266 aa		11.65	□□□□□ -0.54
HDAC6-233	ENST00000489352	WASF2	Q9Y6W5	498 aa		11.65	□□□□□ -0.54
HDAC6-233	ENST00000489352	POLE	Q07864	2286 aa		11.64	□□□□□ -0.55
HDAC6-233	ENST00000489352	KCNU1	A8MYU2	1149 aa		11.64	□□□□□ -0.55
HDAC6-233	ENST00000489352	IKBKB	O14920	756 aa		11.64	□□□□□ -0.55
HDAC6-233	ENST00000489352	RECK	O95980	971 aa		11.64	□□□□□ -0.55
HDAC6-233	ENST00000489352	SETSIP	P0DME0	302 aa		11.64	□□□□□ -0.55
HDAC6-233	ENST00000489352	BPI	P17213	487 aa		11.64	□□□□□ -0.55
HDAC6-233	ENST00000489352	RAD23B	P54727	409 aa		11.64	□□□□□ -0.55
HDAC6-233	ENST00000489352	IRF4	Q15306	451 aa		11.64	□□□□□ -0.55
HDAC6-233	ENST00000489352	VWA2	Q5GFL6	755 aa		11.64	□□□□□ -0.55
HDAC6-233	ENST00000489352	TMEM71	Q6P5X7	295 aa		11.64	□□□□□ -0.55
HDAC6-233	ENST00000489352	LINGO4	Q6UY18	593 aa		11.64	□□□□□ -0.55
HDAC6-233	ENST00000489352	RYBP	Q8N488	228 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
HDAC6-233	ENST00000489352	BMPER	Q8N8U9	685 aa		11.64	□□□□□ -0.55
HDAC6-233	ENST00000489352	GLIS1	Q8NBF1	620 aa		11.64	□□□□□ -0.55
HDAC6-233	ENST00000489352	GOLGA5	Q8TBA6	731 aa		11.64	□□□□□ -0.55
HDAC6-233	ENST00000489352	THAP4	Q8WY91	577 aa		11.64	□□□□□ -0.55
HDAC6-233	ENST00000489352	FAM149B1	Q96BN6	582 aa		11.64	□□□□□ -0.55
HDAC6-233	ENST00000489352	SLC39A13	Q96H72	371 aa		11.64	□□□□□ -0.55
HDAC6-233	ENST00000489352	APOO	Q9BUR5	198 aa		11.64	□□□□□ -0.55
HDAC6-233	ENST00000489352	PANK2	Q9BZ23	570 aa		11.64	□□□□□ -0.55
HDAC6-233	ENST00000489352	APOBEC3G	Q9HC16	384 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
HDAC6-233	ENST00000489352	CISH	Q9NSE2	258 aa		11.64	□□□□□ -0.55
HDAC6-233	ENST00000489352	OR1A2	Q9Y585	309 aa		11.64	□□□□□ -0.55
HDAC6-233	ENST00000489352	MDC1	Q14676	2089 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
HDAC6-233	ENST00000489352	SNAP91	O60641	907 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HDAC6-233	ENST00000489352	CLDN11	O75508	207 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HDAC6-233	ENST00000489352	DLGAP3	O95886	979 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HDAC6-233	ENST00000489352	RHOC	P08134	193 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HDAC6-233	ENST00000489352	CD19	P15391	556 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HDAC6-233	ENST00000489352	RGS7	P49802	495 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HDAC6-233	ENST00000489352	CHAF1B	Q13112	559 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HDAC6-233	ENST00000489352	INPP5A	Q14642	412 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HDAC6-233	ENST00000489352	FAM26F	Q5R3K3	315 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HDAC6-233	ENST00000489352	EPM2AIP1	Q7L775	607 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
HDAC6-233	ENST00000489352	TTC7B	Q86TV6	843 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HDAC6-233	ENST00000489352	C12orf56	Q8IXR9	622 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HDAC6-233	ENST00000489352	TP53I13	Q8NBR0	393 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
HDAC6-233	ENST00000489352	ZDHHC1	Q8WTX9	485 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HDAC6-233	ENST00000489352	PDXP	Q96GD0	296 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HDAC6-233	ENST00000489352	RANBP9	Q96S59	729 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HDAC6-233	ENST00000489352	MIS12	Q9H081	205 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HDAC6-233	ENST00000489352	TMEM168	Q9H0V1	697 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HDAC6-233	ENST00000489352	ING2	Q9H160	280 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HDAC6-233	ENST00000489352	APMAP	Q9HDC9	416 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HDAC6-233	ENST00000489352	MLXIPL	Q9NP71	852 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HDAC6-233	ENST00000489352	AGPAT4	Q9NRZ5	378 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HDAC6-233	ENST00000489352	VPS51	Q9UID3	782 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HDAC6-233	ENST00000489352	OSGIN2	Q9Y236	505 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HDAC6-233	ENST00000489352	OR51B4	Q9Y5P0	310 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HDAC6-233	ENST00000489352	COPG1	Q9Y678	874 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
HDAC6-233	ENST00000489352	DGKB	Q9Y6T7	804 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HDAC6-233	ENST00000489352	ZGRF1	Q86YA3	2104 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HDAC6-233	ENST00000489352	ARGFX	A6NJG6	315 aa		11.62	□□□□□ -0.55

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