RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478490.5

MITF-215, Transcript of melanogenesis associated transcription factor, humanhuman

TSL 5

Gene MITF, Length 1,642 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MITF-215ENST00000478490 PPIL6Q8IXY8 311 aa6.37□□□□□ -1.39
MITF-215ENST00000478490 LINC00528Q8N1L1 170 aa6.37□□□□□ -1.39
MITF-215ENST00000478490 CPXM2Q8N436 756 aa6.37□□□□□ -1.39
MITF-215ENST00000478490 CARNMT1Q8N4J0 409 aa6.37□□□□□ -1.39
MITF-215ENST00000478490 MEIOBQ8N635 442 aa6.37□□□□□ -1.39
MITF-215ENST00000478490 ANKS4BQ8N8V4 417 aa6.37□□□□□ -1.39
MITF-215ENST00000478490 DEFB124Q8NES8 71 aa6.37□□□□□ -1.39
MITF-215ENST00000478490 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
MITF-215ENST00000478490 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
MITF-215ENST00000478490 RAPGEF5Q92565 580 aa6.37□□□□□ -1.39
MITF-215ENST00000478490 HAUS1Q96CS2 278 aa6.37□□□□□ -1.39
MITF-215ENST00000478490 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
MITF-215ENST00000478490 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
MITF-215ENST00000478490 MRGPRX1Q96LB2 322 aa6.37□□□□□ -1.39
MITF-215ENST00000478490 HSFY1Q96LI6 401 aa6.37□□□□□ -1.39
MITF-215ENST00000478490 HSPA12BQ96MM6 686 aa6.37□□□□□ -1.39
MITF-215ENST00000478490 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP6.37□□□□□ -1.39
MITF-215ENST00000478490 SELENOSQ9BQE4 189 aa6.37□□□□□ -1.39
MITF-215ENST00000478490 HERPUD2Q9BSE4 406 aa6.37□□□□□ -1.39
MITF-215ENST00000478490 GPR174Q9BXC1 333 aa6.37□□□□□ -1.39
MITF-215ENST00000478490 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
MITF-215ENST00000478490 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
MITF-215ENST00000478490 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
MITF-215ENST00000478490 NINJ2Q9NZG7 142 aa6.37□□□□□ -1.39
MITF-215ENST00000478490 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
MITF-215ENST00000478490 PILRBQ9UKJ0 227 aa6.37□□□□□ -1.39
MITF-215ENST00000478490 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa6.37□□□□□ -1.39
MITF-215ENST00000478490 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa6.37□□□□□ -1.39
MITF-215ENST00000478490 DSPP15924 2871 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
MITF-215ENST00000478490 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
MITF-215ENST00000478490 CAPN9O14815 690 aa6.36□□□□□ -1.39
MITF-215ENST00000478490 ALOX15BO15296 676 aa6.36□□□□□ -1.39
MITF-215ENST00000478490 TP73O15350 636 aa6.36□□□□□ -1.39
MITF-215ENST00000478490 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
MITF-215ENST00000478490 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
MITF-215ENST00000478490 CST8O60676 142 aa6.36□□□□□ -1.39
MITF-215ENST00000478490 SPAG6O75602 509 aa6.36□□□□□ -1.39
MITF-215ENST00000478490 GJB6O95452 261 aa6.36□□□□□ -1.39
MITF-215ENST00000478490 ACSL3O95573 720 aa6.36□□□□□ -1.39
MITF-215ENST00000478490 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
MITF-215ENST00000478490 ADRB1P08588 477 aa6.36□□□□□ -1.39
MITF-215ENST00000478490 KRT10P13645 584 aa6.36□□□□□ -1.39
MITF-215ENST00000478490 CHN1P15882 459 aa6.36□□□□□ -1.39
MITF-215ENST00000478490 PDGFRAP16234 1089 aa6.36□□□□□ -1.39
MITF-215ENST00000478490 ENGP17813 658 aa6.36□□□□□ -1.39
MITF-215ENST00000478490 SPINK2P20155 84 aa6.36□□□□□ -1.39
MITF-215ENST00000478490 SDC4P31431 198 aa6.36□□□□□ -1.39
MITF-215ENST00000478490 PTPN9P43378 593 aa6.36□□□□□ -1.39
MITF-215ENST00000478490 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
MITF-215ENST00000478490 COPAP53621 1224 aa6.36□□□□□ -1.39
MITF-215ENST00000478490 LIMK1P53667 647 aa6.36□□□□□ -1.39
MITF-215ENST00000478490 SLC18A1P54219 525 aa6.36□□□□□ -1.39
MITF-215ENST00000478490 ARL4CP56559 192 aa6.36□□□□□ -1.39
MITF-215ENST00000478490 RPS24P62847 133 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
MITF-215ENST00000478490 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
MITF-215ENST00000478490 SLC6A3Q01959 620 aa6.36□□□□□ -1.39
MITF-215ENST00000478490 ZNF33AQ06730 810 aa6.36□□□□□ -1.39
MITF-215ENST00000478490 GPS1Q13098 491 aa6.36□□□□□ -1.39
MITF-215ENST00000478490 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa6.36□□□□□ -1.39
MITF-215ENST00000478490 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
MITF-215ENST00000478490 ADGRF1Q5T601 910 aa6.36□□□□□ -1.39
MITF-215ENST00000478490 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
MITF-215ENST00000478490 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa6.36□□□□□ -1.39
MITF-215ENST00000478490 PIK3R6Q5UE93 754 aa6.36□□□□□ -1.39
MITF-215ENST00000478490 RAP1GAP2Q684P5 730 aa6.36□□□□□ -1.39
MITF-215ENST00000478490 MBLAC2Q68D91 279 aa6.36□□□□□ -1.39
MITF-215ENST00000478490 MSANTD2Q6P1R3 559 aa6.36□□□□□ -1.39
MITF-215ENST00000478490 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa6.36□□□□□ -1.39
MITF-215ENST00000478490 SLC36A4Q6YBV0 504 aa6.36□□□□□ -1.39
MITF-215ENST00000478490 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa6.36□□□□□ -1.39
MITF-215ENST00000478490 CPLX4Q7Z7G2 160 aa6.36□□□□□ -1.39
MITF-215ENST00000478490 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
MITF-215ENST00000478490 RFX6Q8HWS3 928 aa6.36□□□□□ -1.39
MITF-215ENST00000478490 TMPRSS6Q8IU80 811 aa6.36□□□□□ -1.39
MITF-215ENST00000478490 SYT12Q8IV01 421 aa6.36□□□□□ -1.39
MITF-215ENST00000478490 FAM217AQ8IXS0 508 aa6.36□□□□□ -1.39
MITF-215ENST00000478490 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa6.36□□□□□ -1.39
MITF-215ENST00000478490 LGI2Q8N0V4 545 aa6.36□□□□□ -1.39
MITF-215ENST00000478490 JOSD2Q8TAC2 188 aa6.36□□□□□ -1.39
MITF-215ENST00000478490 ACTL9Q8TC94 416 aa6.36□□□□□ -1.39
MITF-215ENST00000478490 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
MITF-215ENST00000478490 UCMAQ8WVF2 138 aa6.36□□□□□ -1.39
MITF-215ENST00000478490 RXFP2Q8WXD0 754 aa6.36□□□□□ -1.39
MITF-215ENST00000478490 IRGQQ8WZA9 623 aa6.36□□□□□ -1.39
MITF-215ENST00000478490 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
MITF-215ENST00000478490 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
MITF-215ENST00000478490 SGSM3Q96HU1 749 aa6.36□□□□□ -1.39
MITF-215ENST00000478490 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
MITF-215ENST00000478490 ZNF670Q9BS34 389 aa6.36□□□□□ -1.39
MITF-215ENST00000478490 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
MITF-215ENST00000478490 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa6.36□□□□□ -1.39
MITF-215ENST00000478490 ZWILCHQ9H900 591 aa6.36□□□□□ -1.39
MITF-215ENST00000478490 SAMD15Q9P1V8 674 aa6.36□□□□□ -1.39
MITF-215ENST00000478490 SLC24A2Q9UI40 661 aa6.36□□□□□ -1.39
MITF-215ENST00000478490 GPSM3Q9Y4H4 160 aa6.36□□□□□ -1.39
MITF-215ENST00000478490 FAM169AQ9Y6X4 670 aa6.36□□□□□ -1.39
MITF-215ENST00000478490 ANKRD36A6QL64 1941 aa6.36□□□□□ -1.39
MITF-215ENST00000478490 MYLKQ15746 1914 aa6.36□□□□□ -1.39
MITF-215ENST00000478490 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa6.36□□□□□ -1.39
MITF-215ENST00000478490 IGF2RP11717 2491 aa6.36□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.4 ms