RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473406.5

RABGGTB-209, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 721 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-209ENST00000473406 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
RABGGTB-209ENST00000473406 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
RABGGTB-209ENST00000473406 ODF2LQ9ULJ1 636 aa6.23□□□□□ -1.41
RABGGTB-209ENST00000473406 PLAGL1Q9UM63 463 aa6.23□□□□□ -1.41
RABGGTB-209ENST00000473406 UTYO14607 1347 aa6.23□□□□□ -1.41
RABGGTB-209ENST00000473406 CCDC151A5D8V7 595 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGGTB-209ENST00000473406 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
RABGGTB-209ENST00000473406 CLIC1O00299 241 aa6.22□□□□□ -1.41
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RABGGTB-209ENST00000473406 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
RABGGTB-209ENST00000473406 PTPN2P17706 415 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGGTB-209ENST00000473406 SP100P23497 879 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
RABGGTB-209ENST00000473406 CNR2P34972 360 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGGTB-209ENST00000473406 CYP2J2P51589 502 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGGTB-209ENST00000473406 CLCN3P51790 818 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGGTB-209ENST00000473406 CLDN2P57739 230 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGGTB-209ENST00000473406 SCN1BQ07699 218 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGGTB-209ENST00000473406 COASYQ13057 564 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGGTB-209ENST00000473406 TP53BP2Q13625 1128 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGGTB-209ENST00000473406 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
RABGGTB-209ENST00000473406 MCTP1Q6DN14 999 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGGTB-209ENST00000473406 DHRS13Q6UX07 377 aa6.22□□□□□ -1.41
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RABGGTB-209ENST00000473406 SEPT14Q6ZU15 432 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGGTB-209ENST00000473406 HSCBQ8IWL3 235 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGGTB-209ENST00000473406 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
RABGGTB-209ENST00000473406 DPP10Q8N608 796 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGGTB-209ENST00000473406 C10orf53Q8N6V4 93 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGGTB-209ENST00000473406 TMEM217Q8N7C4 229 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGGTB-209ENST00000473406 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
RABGGTB-209ENST00000473406 FEZF2Q8TBJ5 459 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGGTB-209ENST00000473406 IP6K1Q92551 441 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGGTB-209ENST00000473406 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
RABGGTB-209ENST00000473406 MR1Q95460 341 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGGTB-209ENST00000473406 EXOC4Q96A65 974 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGGTB-209ENST00000473406 CABS1Q96KC9 395 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGGTB-209ENST00000473406 SYT17Q9BSW7 474 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGGTB-209ENST00000473406 PI4K2AQ9BTU6 479 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGGTB-209ENST00000473406 ACAT2Q9BWD1 397 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGGTB-209ENST00000473406 FUT8Q9BYC5 575 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGGTB-209ENST00000473406 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
RABGGTB-209ENST00000473406 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
RABGGTB-209ENST00000473406 DKK2Q9UBU2 259 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGGTB-209ENST00000473406 CARD8Q9Y2G2 431 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGGTB-209ENST00000473406 KLHL20Q9Y2M5 609 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGGTB-209ENST00000473406 DUSP10Q9Y6W6 482 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGGTB-209ENST00000473406 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGGTB-209ENST00000473406 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGGTB-209ENST00000473406 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGGTB-209ENST00000473406 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa6.21□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 H0YIZ8 118 aa6.21□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 MPPED1O15442 326 aa6.21□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP6.21□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 PEX1O43933 1283 aa6.21□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 MMP9P14780 707 aa6.21□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 NDUFB7P17568 137 aa6.21□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 ITGAXP20702 1163 aa6.21□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 PTGER1P34995 402 aa6.21□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 RAB28P51157 221 aa6.21□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 GUCY1B3Q02153 619 aa6.21□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 PTK6Q13882 451 aa6.21□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 KCNC3Q14003 757 aa6.21□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 KCNB1Q14721 858 aa6.21□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 PKN1Q16512 942 aa6.21□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 C10orf76Q5T2E6 689 aa6.21□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 TMEM63BQ5T3F8 832 aa6.21□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa6.21□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 LAIR1Q6GTX8 287 aa6.21□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 ANKRD16Q6P6B7 361 aa6.21□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 CNSTQ6PJW8 725 aa6.21□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 CAMKMTQ7Z624 323 aa6.21□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 RFX6Q8HWS3 928 aa6.21□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa6.21□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 OR52N4Q8NGI2 321 aa6.21□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 FAR1Q8WVX9 515 aa6.21□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 TFAP2BQ92481 460 aa6.21□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 HDAC11Q96DB2 347 aa6.21□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 SIN3AQ96ST3 1273 aa6.21□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 AGAP2Q99490 1192 aa6.21□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 CIPCQ9C0C6 399 aa6.21□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 XYLT2Q9H1B5 865 aa6.21□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 ZFP64Q9NPA5 681 aa6.21□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 EXO1Q9UQ84 846 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 ABCC9O60706 1549 aa6.2□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 A0A1B0GVM2 712 aa6.2□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 A0A1W2PR77 199 aa6.2□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 A4D1N5 150 aa6.2□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 SLC22A3O75751 556 aa6.2□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 SLCO2B1O94956 709 aa6.2□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 MT-CO3P00414 261 aa6.2□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 ACTN1P12814 892 aa6.2□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 LAG3P18627 525 aa6.2□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 HLA-DPA1P20036 260 aa6.2□□□□□ -1.42
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