RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470197.5

GCFC2-205, Transcript of GC-rich sequence DNA-binding factor 2, human

TSL 1 (best)

Gene GCFC2, Length 3,648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GCFC2-205	ENST00000470197	IK	Q13123	557 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	C6orf163	Q5TEZ5	329 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	JADE1	Q6IE81	842 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	LRRC8E	Q6NSJ5	796 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	CNST	Q6PJW8	725 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	FAM83A	Q86UY5	434 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	WRNIP1	Q96S55	665 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	C1QTNF5	Q9BXJ0	243 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	TEX13A	Q9BXU3	409 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	NARF	Q9UHQ1	456 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	MTF2	Q9Y483	593 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	GOLGA6L10	A0A0M3HER8	536 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	TCRBV7S3A2	A0A539	114 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	GCNT3	O95395	438 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	GPANK1	O95872	356 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	MMP9	P14780	707 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	IGFBP2	P18065	325 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	RABIF	P47224	123 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	RABGGTB	P53611	331 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	CLDN2	P57739	230 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	HYAL4	Q2M3T9	481 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	DRICH1	Q6PGQ1	229 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	ALYREF	Q86V81	257 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	DDX51	Q8N8A6	666 aa	Known RBP eCLIP	4.96	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	C5orf34	Q96MH7	638 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	OR2A14	Q96R47	310 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	DPCD	Q9BVM2	203 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	PLA2G12B	Q9BX93	195 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	C12orf65	Q9H3J6	166 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	LIN28A	Q9H9Z2	209 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	SLC6A13	Q9NSD5	602 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	TMEM248	Q9NWD8	314 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	CRNN	Q9UBG3	495 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	NKX1-2	Q9UD57	310 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	ODF2L	Q9ULJ1	636 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	OSGIN2	Q9Y236	505 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	CHST2	Q9Y4C5	530 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	PRAMEF33	A0A0G2JMD5	474 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	TRIM64C	A6NLI5	447 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	PRAMEF10	O60809	474 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	PMPCB	O75439	489 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	NKX2-2	O95096	273 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	CSPG5	O95196	566 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	DDAH2	O95865	285 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	HSPA5	P11021	654 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	DNASE1	P24855	282 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	CTGF	P29279	349 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	CLK3	P49761	638 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	E2F1	Q01094	437 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	CYP2A13	Q16696	494 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	SPDYA	Q5MJ70	313 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	NBPF11	Q86T75	865 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	METTL23	Q86XA0	190 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	SNX19	Q92543	992 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	FAM136A	Q96C01	138 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	PPP1R13B	Q96KQ4	1090 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	LRRC37B	Q96QE4	947 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	ZNF768	Q9H5H4	540 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	PDZD7	Q9H5P4	517 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	COPS7B	Q9H9Q2	264 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	AKAP12	Q02952	1782 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	TOPAZ1	Q8N9V7	1692 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	KIAA1210	Q9ULL0	1709 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197		H3BQ06	376 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	PRY	O14603	147 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	ZNF213	O14771	459 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	DDN	O94850	711 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	PLAT	P00750	562 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	KLKB1	P03952	638 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	CHRM4	P08173	479 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	FMO4	P31512	558 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	TAP1	Q03518	808 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	ZMAT1	Q5H9K5	638 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	TREML2	Q5T2D2	321 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	LRIF1	Q5T3J3	769 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	PMS2CL	Q68D20	193 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	FBXO46	Q6PJ61	603 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	FAM160B2	Q86V87	743 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	MAPKAPK5	Q8IW41	473 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	ARL6IP6	Q8N6S5	226 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	PI4KAP1	Q8N8J0	262 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	SCAI	Q8N9R8	606 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	SOCS4	Q8WXH5	440 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	CCDC120	Q96HB5	630 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	FUT8	Q9BYC5	575 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	KIF9	Q9HAQ2	790 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	PDRG1	Q9NUG6	133 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	TMLHE	Q9NVH6	421 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	NCKIPSD	Q9NZQ3	722 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	BLOC1S6	Q9UL45	172 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	RNMT	O43148	476 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	VEGFD	O43915	354 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	STAT2	P52630	851 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	GPC5	P78333	572 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	TLE3	Q04726	772 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	FOXL1	Q12952	345 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	FZD5	Q13467	585 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	FBXO42	Q6P3S6	717 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	PRRT2	Q7Z6L0	340 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	TUSC5	Q8IXB3	177 aa		4.95	□□□□□ -1.62

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