RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467613.5

UBP1-208, Transcript of upstream binding protein 1, human

TSL 5

Gene UBP1, Length 659 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UBP1-208	ENST00000467613	GABRG3	Q99928	467 aa		6.58	□□□□□ -1.36
UBP1-208	ENST00000467613	C19orf43	Q9BQ61	176 aa		6.58	□□□□□ -1.36
UBP1-208	ENST00000467613	HINFP	Q9BQA5	517 aa		6.58	□□□□□ -1.36
UBP1-208	ENST00000467613	WDR83	Q9BRX9	315 aa	Known RBP	6.58	□□□□□ -1.36
UBP1-208	ENST00000467613	TDRD1	Q9BXT4	1180 aa	Known RBP	6.58	□□□□□ -1.36
UBP1-208	ENST00000467613	FUT8	Q9BYC5	575 aa		6.58	□□□□□ -1.36
UBP1-208	ENST00000467613	XAB2	Q9HCS7	855 aa	Known RBP	6.58	□□□□□ -1.36
UBP1-208	ENST00000467613	PRDM9	Q9NQV7	894 aa		6.58	□□□□□ -1.36
UBP1-208	ENST00000467613	HEBP1	Q9NRV9	189 aa		6.58	□□□□□ -1.36
UBP1-208	ENST00000467613	GOLGA6A	Q9NYA3	693 aa		6.58	□□□□□ -1.36
UBP1-208	ENST00000467613	WNT16	Q9UBV4	365 aa		6.58	□□□□□ -1.36
UBP1-208	ENST00000467613	PLA2G4C	Q9UP65	541 aa		6.58	□□□□□ -1.36
UBP1-208	ENST00000467613	SORCS3	Q9UPU3	1222 aa		6.58	□□□□□ -1.36
UBP1-208	ENST00000467613	TEX264	Q9Y6I9	313 aa		6.58	□□□□□ -1.36
UBP1-208	ENST00000467613	TECTA	O75443	2155 aa		6.58	□□□□□ -1.36
UBP1-208	ENST00000467613	PIEZO1	Q92508	2521 aa		6.57	□□□□□ -1.36
UBP1-208	ENST00000467613	WDFY4	Q6ZS81	3184 aa		6.57	□□□□□ -1.36
UBP1-208	ENST00000467613	VPS13A	Q96RL7	3174 aa		6.57	□□□□□ -1.36
UBP1-208	ENST00000467613	EDDM13	A0A1B0GTR0	161 aa		6.57	□□□□□ -1.36
UBP1-208	ENST00000467613		A0A1W2PQ67	120 aa		6.57	□□□□□ -1.36
UBP1-208	ENST00000467613	TBC1D3B	A6NDS4	549 aa		6.57	□□□□□ -1.36
UBP1-208	ENST00000467613	TTC34	A8MYJ7	566 aa		6.57	□□□□□ -1.36
UBP1-208	ENST00000467613	MAN2B1	O00754	1011 aa		6.57	□□□□□ -1.36
UBP1-208	ENST00000467613	DYNC1I1	O14576	645 aa		6.57	□□□□□ -1.36
UBP1-208	ENST00000467613	POP4	O95707	220 aa	Known RBP	6.57	□□□□□ -1.36
UBP1-208	ENST00000467613	IGSF6	O95976	241 aa		6.57	□□□□□ -1.36
UBP1-208	ENST00000467613	FAM153B	P0C7A2	387 aa		6.57	□□□□□ -1.36
UBP1-208	ENST00000467613	ALAD	P13716	330 aa		6.57	□□□□□ -1.36
UBP1-208	ENST00000467613	TSHR	P16473	764 aa		6.57	□□□□□ -1.36
UBP1-208	ENST00000467613	HLA-DPA1	P20036	260 aa		6.57	□□□□□ -1.36
UBP1-208	ENST00000467613	NNMT	P40261	264 aa		6.57	□□□□□ -1.36
UBP1-208	ENST00000467613	GRIA1	P42261	906 aa		6.57	□□□□□ -1.36
UBP1-208	ENST00000467613	IL12RB1	P42701	662 aa		6.57	□□□□□ -1.36
UBP1-208	ENST00000467613	NPY2R	P49146	381 aa		6.57	□□□□□ -1.36
UBP1-208	ENST00000467613	SCNN1B	P51168	640 aa		6.57	□□□□□ -1.36
UBP1-208	ENST00000467613	CCNH	P51946	323 aa	Predicted RBP	6.57	□□□□□ -1.36
UBP1-208	ENST00000467613	WNT3A	P56704	352 aa		6.57	□□□□□ -1.36
UBP1-208	ENST00000467613	RPL26	P61254	145 aa	Known RBP	6.57	□□□□□ -1.36
UBP1-208	ENST00000467613	MRPS21	P82921	87 aa	Known RBP	6.57	□□□□□ -1.36
UBP1-208	ENST00000467613	SARNP	P82979	210 aa	Known RBP	6.57	□□□□□ -1.36
UBP1-208	ENST00000467613	KDSR	Q06136	332 aa		6.57	□□□□□ -1.36
UBP1-208	ENST00000467613	CDK18	Q07002	472 aa		6.57	□□□□□ -1.36
UBP1-208	ENST00000467613	CDH17	Q12864	832 aa		6.57	□□□□□ -1.36
UBP1-208	ENST00000467613	TRAF2	Q12933	501 aa		6.57	□□□□□ -1.36
UBP1-208	ENST00000467613	FZD5	Q13467	585 aa		6.57	□□□□□ -1.36
UBP1-208	ENST00000467613	CAMK2G	Q13555	558 aa	Predicted RBP	6.57	□□□□□ -1.36
UBP1-208	ENST00000467613	FRG1	Q14331	258 aa	Known RBP	6.57	□□□□□ -1.36
UBP1-208	ENST00000467613	NUMA1	Q14980	2115 aa		6.57	□□□□□ -1.36
UBP1-208	ENST00000467613	SLMAP	Q14BN4	828 aa		6.57	□□□□□ -1.36
UBP1-208	ENST00000467613	SLC1A5	Q15758	541 aa		6.57	□□□□□ -1.36
UBP1-208	ENST00000467613	MLF2	Q15773	248 aa	Predicted RBP	6.57	□□□□□ -1.36
UBP1-208	ENST00000467613	HIF1A	Q16665	826 aa		6.57	□□□□□ -1.36
UBP1-208	ENST00000467613	MYLK3	Q32MK0	819 aa		6.57	□□□□□ -1.36
UBP1-208	ENST00000467613	FAM153C	Q494X1	144 aa		6.57	□□□□□ -1.36
UBP1-208	ENST00000467613	MAP9	Q49MG5	647 aa		6.57	□□□□□ -1.36
UBP1-208	ENST00000467613	HSF5	Q4G112	596 aa	Predicted RBP	6.57	□□□□□ -1.36
UBP1-208	ENST00000467613	FBXO43	Q4G163	708 aa		6.57	□□□□□ -1.36
UBP1-208	ENST00000467613	MSS51	Q4VC12	460 aa		6.57	□□□□□ -1.36
UBP1-208	ENST00000467613	FNBP1L	Q5T0N5	605 aa		6.57	□□□□□ -1.36
UBP1-208	ENST00000467613	ATXN7L2	Q5T6C5	722 aa	Predicted RBP	6.57	□□□□□ -1.36
UBP1-208	ENST00000467613	TREML4	Q6UXN2	200 aa		6.57	□□□□□ -1.36
UBP1-208	ENST00000467613	DPY19L3	Q6ZPD9	716 aa		6.57	□□□□□ -1.36
UBP1-208	ENST00000467613	CEP128	Q6ZU80	1094 aa		6.57	□□□□□ -1.36
UBP1-208	ENST00000467613		Q6ZVU0	165 aa		6.57	□□□□□ -1.36
UBP1-208	ENST00000467613	CYS1	Q717R9	158 aa		6.57	□□□□□ -1.36
UBP1-208	ENST00000467613	UBALD2	Q8IYN6	164 aa		6.57	□□□□□ -1.36
UBP1-208	ENST00000467613	CYP4X1	Q8N118	509 aa		6.57	□□□□□ -1.36
UBP1-208	ENST00000467613	SYNPO	Q8N3V7	929 aa		6.57	□□□□□ -1.36
UBP1-208	ENST00000467613	TMIE	Q8NEW7	156 aa		6.57	□□□□□ -1.36
UBP1-208	ENST00000467613	TTC8	Q8TAM2	541 aa		6.57	□□□□□ -1.36
UBP1-208	ENST00000467613	CYB5D2	Q8WUJ1	264 aa		6.57	□□□□□ -1.36
UBP1-208	ENST00000467613	UCMA	Q8WVF2	138 aa		6.57	□□□□□ -1.36
UBP1-208	ENST00000467613	PIH1D2	Q8WWB5	315 aa		6.57	□□□□□ -1.36
UBP1-208	ENST00000467613	IFT81	Q8WYA0	676 aa		6.57	□□□□□ -1.36
UBP1-208	ENST00000467613	PEX13	Q92968	403 aa		6.57	□□□□□ -1.36
UBP1-208	ENST00000467613	EXOC2	Q96KP1	924 aa		6.57	□□□□□ -1.36
UBP1-208	ENST00000467613	ZNF641	Q96N77	438 aa	Predicted RBP	6.57	□□□□□ -1.36
UBP1-208	ENST00000467613	RANBP9	Q96S59	729 aa		6.57	□□□□□ -1.36
UBP1-208	ENST00000467613	LYSMD1	Q96S90	227 aa		6.57	□□□□□ -1.36
UBP1-208	ENST00000467613	TBL1Y	Q9BQ87	522 aa		6.57	□□□□□ -1.36
UBP1-208	ENST00000467613	OSBPL1A	Q9BXW6	950 aa		6.57	□□□□□ -1.36
UBP1-208	ENST00000467613	CIPC	Q9C0C6	399 aa		6.57	□□□□□ -1.36
UBP1-208	ENST00000467613	EPB41L4B	Q9H329	900 aa		6.57	□□□□□ -1.36
UBP1-208	ENST00000467613	MRM3	Q9HC36	420 aa	Known RBP	6.57	□□□□□ -1.36
UBP1-208	ENST00000467613	DKK3	Q9UBP4	350 aa		6.57	□□□□□ -1.36
UBP1-208	ENST00000467613	MTRF1L	Q9UGC7	380 aa	Known RBP	6.57	□□□□□ -1.36
UBP1-208	ENST00000467613	RIMKLB	Q9ULI2	386 aa		6.57	□□□□□ -1.36
UBP1-208	ENST00000467613	RPL26L1	Q9UNX3	145 aa	Known RBP	6.57	□□□□□ -1.36
UBP1-208	ENST00000467613	WASF2	Q9Y6W5	498 aa		6.57	□□□□□ -1.36
UBP1-208	ENST00000467613	FRYL	O94915	3013 aa		6.56	□□□□□ -1.36
UBP1-208	ENST00000467613	TTC24	A2A3L6	582 aa	Predicted RBP	6.56	□□□□□ -1.36
UBP1-208	ENST00000467613	ANTXRL	A6NF34	631 aa		6.56	□□□□□ -1.36
UBP1-208	ENST00000467613	MROH6	A6NGR9	719 aa		6.56	□□□□□ -1.36
UBP1-208	ENST00000467613	CHURC1-FNTB	B4DL54	471 aa		6.56	□□□□□ -1.36
UBP1-208	ENST00000467613	ANKRD66	B4E2M5	251 aa		6.56	□□□□□ -1.36
UBP1-208	ENST00000467613		E7EVH7	732 aa		6.56	□□□□□ -1.36
UBP1-208	ENST00000467613	ADAM23	O75077	832 aa		6.56	□□□□□ -1.36
UBP1-208	ENST00000467613	AVIL	O75366	819 aa		6.56	□□□□□ -1.36
UBP1-208	ENST00000467613	PMPCB	O75439	489 aa		6.56	□□□□□ -1.36
UBP1-208	ENST00000467613	NEBL	O76041	1014 aa		6.56	□□□□□ -1.36

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