RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465902.1

USP19-210, Transcript of ubiquitin specific peptidase 19, human

TSL 3

Gene USP19, Length 617 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP19-210	ENST00000465902	DKK3	Q9UBP4	350 aa		17.93	■□□□□ 0.46
USP19-210	ENST00000465902	PCDH15	Q96QU1	1955 aa		17.93	■□□□□ 0.46
USP19-210	ENST00000465902	LRRK1	Q38SD2	2015 aa		17.93	■□□□□ 0.46
USP19-210	ENST00000465902	LOC107983988	A0A1B0GUW6	1196 aa	Predicted RBP	17.92	■□□□□ 0.46
USP19-210	ENST00000465902	TM4SF5	O14894	197 aa		17.92	■□□□□ 0.46
USP19-210	ENST00000465902	TSPAN6	O43657	245 aa		17.92	■□□□□ 0.46
USP19-210	ENST00000465902	AP1G1	O43747	822 aa		17.92	■□□□□ 0.46
USP19-210	ENST00000465902	FTCD	O95954	541 aa		17.92	■□□□□ 0.46
USP19-210	ENST00000465902	PTMA	P06454	111 aa	Known RBP	17.92	■□□□□ 0.46
USP19-210	ENST00000465902	ITIH2	P19823	946 aa		17.92	■□□□□ 0.46
USP19-210	ENST00000465902	CTNNA2	P26232	953 aa		17.92	■□□□□ 0.46
USP19-210	ENST00000465902	NUDT1	P36639	197 aa		17.92	■□□□□ 0.46
USP19-210	ENST00000465902	CETN2	P41208	172 aa		17.92	■□□□□ 0.46
USP19-210	ENST00000465902	RWDD2B	P57060	319 aa		17.92	■□□□□ 0.46
USP19-210	ENST00000465902	C21orf59	P57076	290 aa		17.92	■□□□□ 0.46
USP19-210	ENST00000465902	RPS21	P63220	83 aa	Known RBP	17.92	■□□□□ 0.46
USP19-210	ENST00000465902	GRIK2	Q13002	908 aa		17.92	■□□□□ 0.46
USP19-210	ENST00000465902	SGCG	Q13326	291 aa		17.92	■□□□□ 0.46
USP19-210	ENST00000465902	STAT4	Q14765	748 aa		17.92	■□□□□ 0.46
USP19-210	ENST00000465902	SLC45A4	Q5BKX6	768 aa		17.92	■□□□□ 0.46
USP19-210	ENST00000465902	KIAA1161	Q6NSJ0	714 aa		17.92	■□□□□ 0.46
USP19-210	ENST00000465902	B4GALNT4	Q76KP1	1039 aa		17.92	■□□□□ 0.46
USP19-210	ENST00000465902	BZW1	Q7L1Q6	419 aa	Known RBP	17.92	■□□□□ 0.46
USP19-210	ENST00000465902	NT5DC3	Q86UY8	548 aa		17.92	■□□□□ 0.46
USP19-210	ENST00000465902	TEX26	Q8N6G2	289 aa		17.92	■□□□□ 0.46
USP19-210	ENST00000465902	UBL4B	Q8N7F7	174 aa		17.92	■□□□□ 0.46
USP19-210	ENST00000465902	OR2I1P	Q8NGU4	316 aa		17.92	■□□□□ 0.46
USP19-210	ENST00000465902	P3H4	Q92791	437 aa		17.92	■□□□□ 0.46
USP19-210	ENST00000465902	SKA1	Q96BD8	255 aa		17.92	■□□□□ 0.46
USP19-210	ENST00000465902	HAUS1	Q96CS2	278 aa		17.92	■□□□□ 0.46
USP19-210	ENST00000465902	NUDCD1	Q96RS6	583 aa		17.92	■□□□□ 0.46
USP19-210	ENST00000465902	SEMA3C	Q99985	751 aa		17.92	■□□□□ 0.46
USP19-210	ENST00000465902	MGME1	Q9BQP7	344 aa		17.92	■□□□□ 0.46
USP19-210	ENST00000465902	ORAI3	Q9BRQ5	295 aa		17.92	■□□□□ 0.46
USP19-210	ENST00000465902	POLR1E	Q9GZS1	481 aa	Known RBP	17.92	■□□□□ 0.46
USP19-210	ENST00000465902	NOD2	Q9HC29	1040 aa		17.92	■□□□□ 0.46
USP19-210	ENST00000465902	LZTFL1	Q9NQ48	299 aa		17.92	■□□□□ 0.46
USP19-210	ENST00000465902	GGT7	Q9UJ14	662 aa		17.92	■□□□□ 0.46
USP19-210	ENST00000465902	DMTF1	Q9Y222	760 aa		17.92	■□□□□ 0.46
USP19-210	ENST00000465902	PCDHGC4	Q9Y5F7	938 aa		17.92	■□□□□ 0.46
USP19-210	ENST00000465902	hCG_1818297	A0A087WSY0	165 aa		17.91	■□□□□ 0.46
USP19-210	ENST00000465902	UPK3BL1	B0FP48	263 aa		17.91	■□□□□ 0.46
USP19-210	ENST00000465902	UPK3BL2	E5RIL1	263 aa		17.91	■□□□□ 0.46
USP19-210	ENST00000465902	KCNK1	O00180	336 aa		17.91	■□□□□ 0.46
USP19-210	ENST00000465902	JCHAIN	P01591	159 aa		17.91	■□□□□ 0.46
USP19-210	ENST00000465902	CD38	P28907	300 aa		17.91	■□□□□ 0.46
USP19-210	ENST00000465902	GRIA4	P48058	902 aa		17.91	■□□□□ 0.46
USP19-210	ENST00000465902	NR2C2	P49116	596 aa		17.91	■□□□□ 0.46
USP19-210	ENST00000465902	CCZ1B	P86790	482 aa		17.91	■□□□□ 0.46
USP19-210	ENST00000465902	CCZ1	P86791	482 aa	Predicted RBP	17.91	■□□□□ 0.46
USP19-210	ENST00000465902	PPID	Q08752	370 aa	Known RBP	17.91	■□□□□ 0.46
USP19-210	ENST00000465902	TAZ	Q16635	292 aa		17.91	■□□□□ 0.46
USP19-210	ENST00000465902	UGP2	Q16851	508 aa		17.91	■□□□□ 0.46
USP19-210	ENST00000465902	ZNF284	Q2VY69	593 aa		17.91	■□□□□ 0.46
USP19-210	ENST00000465902	NAPEPLD	Q6IQ20	393 aa		17.91	■□□□□ 0.46
USP19-210	ENST00000465902	ERAP2	Q6P179	960 aa		17.91	■□□□□ 0.46
USP19-210	ENST00000465902	BRAT1	Q6PJG6	821 aa		17.91	■□□□□ 0.46
USP19-210	ENST00000465902	MINDY1	Q8N5J2	469 aa		17.91	■□□□□ 0.46
USP19-210	ENST00000465902	RNF10	Q8N5U6	811 aa	Known RBP	17.91	■□□□□ 0.46
USP19-210	ENST00000465902	HCAR2	Q8TDS4	363 aa		17.91	■□□□□ 0.46
USP19-210	ENST00000465902	CXorf40A	Q8TE69	158 aa		17.91	■□□□□ 0.46
USP19-210	ENST00000465902	MAML1	Q92585	1016 aa		17.91	■□□□□ 0.46
USP19-210	ENST00000465902	WRAP53	Q9BUR4	548 aa	Known RBP	17.91	■□□□□ 0.46
USP19-210	ENST00000465902	SLC17A9	Q9BYT1	436 aa		17.91	■□□□□ 0.46
USP19-210	ENST00000465902	ZDHHC5	Q9C0B5	715 aa		17.91	■□□□□ 0.46
USP19-210	ENST00000465902	FZD3	Q9NPG1	666 aa		17.91	■□□□□ 0.46
USP19-210	ENST00000465902	PACSIN2	Q9UNF0	486 aa	Predicted RBP	17.91	■□□□□ 0.46
USP19-210	ENST00000465902	ZFR2	Q9UPR6	939 aa	Known RBP	17.91	■□□□□ 0.46
USP19-210	ENST00000465902	ANKRD6	Q9Y2G4	727 aa		17.91	■□□□□ 0.46
USP19-210	ENST00000465902	CAPN6	Q9Y6Q1	641 aa		17.91	■□□□□ 0.46
USP19-210	ENST00000465902	CNOT1	A5YKK6	2376 aa	Known RBP	17.91	■□□□□ 0.46
USP19-210	ENST00000465902	CABIN1	Q9Y6J0	2220 aa		17.91	■□□□□ 0.46
USP19-210	ENST00000465902	IGLON5	A6NGN9	336 aa		17.9	■□□□□ 0.46
USP19-210	ENST00000465902	PRAMEF26	H0Y7S4	382 aa		17.9	■□□□□ 0.46
USP19-210	ENST00000465902	CDX4	O14627	284 aa	Predicted RBP	17.9	■□□□□ 0.46
USP19-210	ENST00000465902	WNT9A	O14904	365 aa		17.9	■□□□□ 0.46
USP19-210	ENST00000465902	PAK4	O96013	591 aa	Predicted RBP	17.9	■□□□□ 0.46
USP19-210	ENST00000465902	PRKCG	P05129	697 aa		17.9	■□□□□ 0.46
USP19-210	ENST00000465902	PECAM1	P16284	738 aa	Predicted RBP	17.9	■□□□□ 0.46
USP19-210	ENST00000465902	TGM2	P21980	687 aa		17.9	■□□□□ 0.46
USP19-210	ENST00000465902	AKT2	P31751	481 aa		17.9	■□□□□ 0.46
USP19-210	ENST00000465902	COPS2	P61201	443 aa		17.9	■□□□□ 0.46
USP19-210	ENST00000465902	POLR2L	P62875	67 aa	Known RBP	17.9	■□□□□ 0.46
USP19-210	ENST00000465902	FAM193A	P78312	1265 aa		17.9	■□□□□ 0.46
USP19-210	ENST00000465902	SEMG2	Q02383	582 aa		17.9	■□□□□ 0.46
USP19-210	ENST00000465902	ADCY2	Q08462	1091 aa		17.9	■□□□□ 0.46
USP19-210	ENST00000465902	ELP6	Q0PNE2	266 aa		17.9	■□□□□ 0.46
USP19-210	ENST00000465902	ZC3H18	Q86VM9	953 aa	Known RBP	17.9	■□□□□ 0.46
USP19-210	ENST00000465902	FATE1	Q969F0	183 aa		17.9	■□□□□ 0.46
USP19-210	ENST00000465902	CEP41	Q9BYV8	373 aa		17.9	■□□□□ 0.46
USP19-210	ENST00000465902	PCDH12	Q9NPG4	1184 aa		17.9	■□□□□ 0.46
USP19-210	ENST00000465902	CA5B	Q9Y2D0	317 aa		17.9	■□□□□ 0.46
USP19-210	ENST00000465902	SNX11	Q9Y5W9	270 aa		17.9	■□□□□ 0.46
USP19-210	ENST00000465902	TDRD6	O60522	2096 aa	Known RBP	17.9	■□□□□ 0.46
USP19-210	ENST00000465902	MIF4GD	A9UHW6	222 aa	Known RBP	17.89	■□□□□ 0.45
USP19-210	ENST00000465902	AREL1	O15033	823 aa		17.89	■□□□□ 0.45
USP19-210	ENST00000465902	MMP20	O60882	483 aa		17.89	■□□□□ 0.45
USP19-210	ENST00000465902	OPHN1	O60890	802 aa		17.89	■□□□□ 0.45
USP19-210	ENST00000465902	HLA-DQB2	P05538	268 aa		17.89	■□□□□ 0.45
USP19-210	ENST00000465902	CR2	P20023	1033 aa		17.89	■□□□□ 0.45

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