RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464518.1

SLC13A3-208, Transcript of solute carrier family 13 member 3, human

TSL 5

Gene SLC13A3, Length 792 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SLC13A3-208	ENST00000464518	GPR156	Q8NFN8	814 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SLC13A3-208	ENST00000464518	PCDH19	Q8TAB3	1148 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SLC13A3-208	ENST00000464518	HTR3C	Q8WXA8	447 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SLC13A3-208	ENST00000464518	KREMEN1	Q96MU8	473 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SLC13A3-208	ENST00000464518	FOXP3	Q9BZS1	431 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SLC13A3-208	ENST00000464518	SIK2	Q9H0K1	926 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SLC13A3-208	ENST00000464518	EPN3	Q9H201	632 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SLC13A3-208	ENST00000464518	WDR70	Q9NW82	654 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SLC13A3-208	ENST00000464518	COX16	Q9P0S2	106 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SLC13A3-208	ENST00000464518	RABGEF1	Q9UJ41	708 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SLC13A3-208	ENST00000464518	THAP12	O43422	761 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SLC13A3-208	ENST00000464518	ZNF500	O60304	480 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
SLC13A3-208	ENST00000464518	RASGRP1	O95267	797 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SLC13A3-208	ENST00000464518	GSR	P00390	522 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SLC13A3-208	ENST00000464518	KRT5	P13647	590 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SLC13A3-208	ENST00000464518	CTSE	P14091	401 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SLC13A3-208	ENST00000464518	HGF	P14210	728 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SLC13A3-208	ENST00000464518	HTR1B	P28222	390 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SLC13A3-208	ENST00000464518	ABL2	P42684	1182 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SLC13A3-208	ENST00000464518	CXCR3	P49682	368 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SLC13A3-208	ENST00000464518	ATP1A2	P50993	1020 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SLC13A3-208	ENST00000464518	SUOX	P51687	545 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SLC13A3-208	ENST00000464518	PMS1	P54277	932 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
SLC13A3-208	ENST00000464518	ARF5	P84085	180 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SLC13A3-208	ENST00000464518	FANCC	Q00597	558 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SLC13A3-208	ENST00000464518	SRSF6	Q13247	344 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
SLC13A3-208	ENST00000464518	KCNAB2	Q13303	367 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SLC13A3-208	ENST00000464518	CLCA4	Q14CN2	919 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SLC13A3-208	ENST00000464518	CCNJL	Q8IV13	435 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SLC13A3-208	ENST00000464518	ARHGEF19	Q8IW93	802 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SLC13A3-208	ENST00000464518	TP53I13	Q8NBR0	393 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
SLC13A3-208	ENST00000464518	C1orf131	Q8NDD1	294 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
SLC13A3-208	ENST00000464518	EHBP1	Q8NDI1	1231 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SLC13A3-208	ENST00000464518	NT5C3B	Q969T7	300 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SLC13A3-208	ENST00000464518	PPP1R13B	Q96KQ4	1090 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SLC13A3-208	ENST00000464518	NPY6R	Q99463	290 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SLC13A3-208	ENST00000464518	SLC12A9	Q9BXP2	914 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SLC13A3-208	ENST00000464518	TKTL2	Q9H0I9	626 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SLC13A3-208	ENST00000464518	CDH19	Q9H159	772 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SLC13A3-208	ENST00000464518	ZDHHC6	Q9H6R6	413 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SLC13A3-208	ENST00000464518	ATP13A1	Q9HD20	1204 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SLC13A3-208	ENST00000464518	AKAP7	Q9P0M2	348 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
SLC13A3-208	ENST00000464518	IFNK	Q9P0W0	207 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SLC13A3-208	ENST00000464518	HECA	Q9UBI9	543 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
SLC13A3-208	ENST00000464518	GULP1	Q9UBP9	304 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SLC13A3-208	ENST00000464518	ZNF212	Q9UDV6	495 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SLC13A3-208	ENST00000464518	PCDHGC3	Q9UN70	934 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SLC13A3-208	ENST00000464518	GPR34	Q9UPC5	381 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SLC13A3-208	ENST00000464518	BOD1L1	Q8NFC6	3051 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SLC13A3-208	ENST00000464518	PPP1R3G	B7ZBB8	358 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SLC13A3-208	ENST00000464518	C9orf172	C9J069	976 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SLC13A3-208	ENST00000464518	HGS	O14964	777 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
SLC13A3-208	ENST00000464518	CAPN5	O15484	640 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
SLC13A3-208	ENST00000464518	NUDT21	O43809	227 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
SLC13A3-208	ENST00000464518	SERPINC1	P01008	464 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SLC13A3-208	ENST00000464518	CALCA	P01258	141 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SLC13A3-208	ENST00000464518	ITIH1	P19827	911 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SLC13A3-208	ENST00000464518	SCNN1A	P37088	669 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SLC13A3-208	ENST00000464518	GGCX	P38435	758 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SLC13A3-208	ENST00000464518	POLE2	P56282	527 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SLC13A3-208	ENST00000464518	SNRPD1	P62314	119 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
SLC13A3-208	ENST00000464518	STIM1	Q13586	685 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SLC13A3-208	ENST00000464518	AGER	Q15109	404 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SLC13A3-208	ENST00000464518	CERCAM	Q5T4B2	595 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SLC13A3-208	ENST00000464518	OGFOD3	Q6PK18	319 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SLC13A3-208	ENST00000464518	SLITRK4	Q8IW52	837 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SLC13A3-208	ENST00000464518	OR2AP1	Q8NGE2	309 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SLC13A3-208	ENST00000464518	CXorf40A	Q8TE69	158 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SLC13A3-208	ENST00000464518	ZNF830	Q96NB3	372 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
SLC13A3-208	ENST00000464518	PSMG3-AS1	Q96PY0	264 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SLC13A3-208	ENST00000464518	HAPLN3	Q96S86	360 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SLC13A3-208	ENST00000464518	CPXM1	Q96SM3	734 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SLC13A3-208	ENST00000464518	RBM15	Q96T37	977 aa	Known RBP eCLIP	12.79	□□□□□ -0.36
SLC13A3-208	ENST00000464518	HSD3B7	Q9H2F3	369 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SLC13A3-208	ENST00000464518	PIGV	Q9NUD9	493 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SLC13A3-208	ENST00000464518	FANCL	Q9NW38	375 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SLC13A3-208	ENST00000464518	FOXJ2	Q9P0K8	574 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SLC13A3-208	ENST00000464518	IMPACT	Q9P2X3	320 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SLC13A3-208	ENST00000464518	PPARGC1A	Q9UBK2	798 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
SLC13A3-208	ENST00000464518	MAN2B2	Q9Y2E5	1009 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SLC13A3-208	ENST00000464518	DGKB	Q9Y6T7	804 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SLC13A3-208	ENST00000464518	AHCTF1	Q8WYP5	2266 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SLC13A3-208	ENST00000464518	DOPEY2	Q9Y3R5	2298 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SLC13A3-208	ENST00000464518	LRP4	O75096	1905 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SLC13A3-208	ENST00000464518	DOCK4	Q8N1I0	1966 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SLC13A3-208	ENST00000464518	PSMA7	O14818	248 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SLC13A3-208	ENST00000464518	CASC3	O15234	703 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
SLC13A3-208	ENST00000464518	ZW10	O43264	779 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SLC13A3-208	ENST00000464518	POP4	O95707	220 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
SLC13A3-208	ENST00000464518	WT1	P19544	449 aa	Predicted RBP	12.78	□□□□□ -0.36
SLC13A3-208	ENST00000464518	MARS	P56192	900 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
SLC13A3-208	ENST00000464518	SLC6A3	Q01959	620 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SLC13A3-208	ENST00000464518	GNA12	Q03113	381 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SLC13A3-208	ENST00000464518	POLD3	Q15054	466 aa	Predicted RBP	12.78	□□□□□ -0.36
SLC13A3-208	ENST00000464518	CCDC40	Q4G0X9	1142 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SLC13A3-208	ENST00000464518	OTUD1	Q5VV17	481 aa	Predicted RBP	12.78	□□□□□ -0.36
SLC13A3-208	ENST00000464518	FAM183BP	Q6ZVS7	135 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SLC13A3-208	ENST00000464518	TFAP2D	Q7Z6R9	452 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SLC13A3-208	ENST00000464518	VASH2	Q86V25	355 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SLC13A3-208	ENST00000464518	VPS36	Q86VN1	386 aa		12.78	□□□□□ -0.36

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