RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462363.6

PTPRC-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 926 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-210ENST00000462363 CEP97Q8IW35 865 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 DENND6AQ8IWF6 608 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 LGI2Q8N0V4 545 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 OR7D4Q8NG98 312 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 RDH11Q8TC12 318 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 INPP5DQ92835 1189 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 ERP27Q96DN0 273 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 ABHD8Q96I13 439 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 UBXN10Q96LJ8 280 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP5.7□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 MIPEPQ99797 713 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 SIKE1Q9BRV8 207 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 FAM167BQ9BTA0 163 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 TRIM55Q9BYV6 548 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 MFSD1Q9H3U5 465 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 ECT2Q9H8V3 914 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 NT5MQ9NPB1 228 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 TMEM39AQ9NV64 488 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 THAP1Q9NVV9 213 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 LHX3Q9UBR4 397 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 FBXO5Q9UKT4 447 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 TRIM33Q9UPN9 1127 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP5.7□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP5.7□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP5.7□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 GOLGA8TH3BQL2 631 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 TEX28O15482 410 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 FZD6O60353 706 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 UPP2O95045 317 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 VAPBO95292 243 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 PAPLNO95428 1278 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 NDST3O95803 873 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 KRT16P08779 473 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 CTSAP10619 480 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 MYL2P10916 166 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 CPA3P15088 417 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 NQO1P15559 274 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 HLA-DPA1P20036 260 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 GLDCP23378 1020 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 TYK2P29597 1187 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 OR1E1P30953 314 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 PPM1AP35813 382 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 SLC26A3P40879 764 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 SLC11A2P49281 568 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 CLCN5P51795 746 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 EPHA5P54756 1037 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 SLC7A9P82251 487 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 ARF5P84085 180 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 MPP1Q00013 466 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 CTBP1Q13363 440 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 UGP2Q16851 508 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 TYSND1Q2T9J0 566 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF789Q5FWF6 425 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 FYB2Q5VWT5 728 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 NEPROQ6NW34 567 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF549Q6P9A3 640 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 CYB5D1Q6P9G0 228 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 TREML4Q6UXN2 200 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 GAREM2Q75VX8 874 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 TTC7BQ86TV6 843 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 TREML1Q86YW5 311 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 NUDCD3Q8IVD9 361 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 C10orf107Q8IVU9 208 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 LMNTD2Q8IXW0 634 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 LSMEM2Q8N112 164 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 CFAP52Q8N1V2 620 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 TTC30BQ8N4P2 665 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 SH3RF2Q8TEC5 729 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 AUTS2Q8WXX7 1259 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 TMEM169Q96HH4 297 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 LRRC37BQ96QE4 947 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 OLFM1Q99784 485 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 OMDQ99983 421 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 SEMA3CQ99985 751 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 MCOLN1Q9GZU1 580 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 ATXN3LQ9H3M9 355 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF385DQ9H6B1 395 aa5.69□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.2 ms