RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462125.5

C9orf3-210, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 3

Gene C9orf3, Length 961 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-210ENST00000462125 CSPG4P5Q96PW8 444 aa13.35□□□□□ -0.27
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C9orf3-210ENST00000462125 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa13.33□□□□□ -0.28
C9orf3-210ENST00000462125 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP13.33□□□□□ -0.28
C9orf3-210ENST00000462125 CXorf40AQ8TE69 158 aa13.33□□□□□ -0.28
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C9orf3-210ENST00000462125 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa13.33□□□□□ -0.28
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C9orf3-210ENST00000462125 PCDH12Q9NPG4 1184 aa13.33□□□□□ -0.28
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C9orf3-210ENST00000462125 AP1S1P61966 158 aa13.32□□□□□ -0.28
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C9orf3-210ENST00000462125 BCL2L1Q07817 233 aa13.32□□□□□ -0.28
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C9orf3-210ENST00000462125 FAM181AQ8N9Y4 354 aa13.32□□□□□ -0.28
C9orf3-210ENST00000462125 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP13.32□□□□□ -0.28
C9orf3-210ENST00000462125 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP13.32□□□□□ -0.28
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C9orf3-210ENST00000462125 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP13.32□□□□□ -0.28
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C9orf3-210ENST00000462125 NLGN3Q9NZ94 848 aa13.32□□□□□ -0.28
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