RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000430445.1

RAB17-208, Transcript of RAB17, member RAS oncogene family, human

TSL 5

Gene RAB17, Length 421 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RAB17-208	ENST00000430445	ANKRD36	A6QL64	1941 aa		13.92	□□□□□ -0.18
RAB17-208	ENST00000430445	RASGRP1	O95267	797 aa		13.92	□□□□□ -0.18
RAB17-208	ENST00000430445	CYP11B1	P15538	503 aa		13.92	□□□□□ -0.18
RAB17-208	ENST00000430445	RHOQ	P17081	205 aa		13.92	□□□□□ -0.18
RAB17-208	ENST00000430445	ITIH1	P19827	911 aa		13.92	□□□□□ -0.18
RAB17-208	ENST00000430445	PEX5	P50542	639 aa		13.92	□□□□□ -0.18
RAB17-208	ENST00000430445	ATP11A	P98196	1134 aa		13.92	□□□□□ -0.18
RAB17-208	ENST00000430445	NRG1	Q02297	640 aa	Predicted RBP	13.92	□□□□□ -0.18
RAB17-208	ENST00000430445	ALG11	Q2TAA5	492 aa		13.92	□□□□□ -0.18
RAB17-208	ENST00000430445	RAB6C	Q53S08	254 aa		13.92	□□□□□ -0.18
RAB17-208	ENST00000430445	RWDD4	Q6NW29	188 aa	Known RBP	13.92	□□□□□ -0.18
RAB17-208	ENST00000430445	ATG14	Q6ZNE5	492 aa		13.92	□□□□□ -0.18
RAB17-208	ENST00000430445	NYAP1	Q6ZVC0	841 aa		13.92	□□□□□ -0.18
RAB17-208	ENST00000430445	RD3	Q7Z3Z2	195 aa		13.92	□□□□□ -0.18
RAB17-208	ENST00000430445	GKN2	Q86XP6	184 aa		13.92	□□□□□ -0.18
RAB17-208	ENST00000430445	IRF2BP1	Q8IU81	584 aa		13.92	□□□□□ -0.18
RAB17-208	ENST00000430445	EMC1	Q8N766	993 aa		13.92	□□□□□ -0.18
RAB17-208	ENST00000430445	OR6C4	Q8NGE1	309 aa		13.92	□□□□□ -0.18
RAB17-208	ENST00000430445	GDAP1L1	Q96MZ0	367 aa		13.92	□□□□□ -0.18
RAB17-208	ENST00000430445	TTYH3	Q9C0H2	523 aa		13.92	□□□□□ -0.18
RAB17-208	ENST00000430445	RAB6C	Q9H0N0	254 aa		13.92	□□□□□ -0.18
RAB17-208	ENST00000430445	MAGEH1	Q9H213	219 aa		13.92	□□□□□ -0.18
RAB17-208	ENST00000430445	TMEM248	Q9NWD8	314 aa		13.92	□□□□□ -0.18
RAB17-208	ENST00000430445	OR12D3	Q9UGF7	316 aa		13.92	□□□□□ -0.18
RAB17-208	ENST00000430445	RWDD2A	Q9UIY3	292 aa		13.92	□□□□□ -0.18
RAB17-208	ENST00000430445	COQ6	Q9Y2Z9	468 aa		13.92	□□□□□ -0.18
RAB17-208	ENST00000430445	LOXL2	Q9Y4K0	774 aa		13.92	□□□□□ -0.18
RAB17-208	ENST00000430445	TMEM110-MUSTN1	A8MSY1	372 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RAB17-208	ENST00000430445	FAM72C	H0Y354	149 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RAB17-208	ENST00000430445	SUV39H1	O43463	412 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RAB17-208	ENST00000430445	RAMP2	O60895	175 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RAB17-208	ENST00000430445	TMCC1	O94876	653 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RAB17-208	ENST00000430445	IGSF6	O95976	241 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RAB17-208	ENST00000430445	FAM87A	P0C7U9	286 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RAB17-208	ENST00000430445	TIMP2	P16035	220 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RAB17-208	ENST00000430445	ADRA1B	P35368	520 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RAB17-208	ENST00000430445	MTIF2	P46199	727 aa	Known RBP	13.91	□□□□□ -0.18
RAB17-208	ENST00000430445	RAD51	Q06609	339 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RAB17-208	ENST00000430445	SRSF1	Q07955	248 aa	Known RBP eCLIP	13.91	□□□□□ -0.18	1e-8	■□□□□ 9.1
RAB17-208	ENST00000430445	NFATC4	Q14934	902 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RAB17-208	ENST00000430445	LRRC14	Q15048	493 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RAB17-208	ENST00000430445	CDO1	Q16878	200 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RAB17-208	ENST00000430445	WSCD2	Q2TBF2	565 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RAB17-208	ENST00000430445	TMEM52B	Q4KMG9	183 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RAB17-208	ENST00000430445	MANEA	Q5SRI9	462 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RAB17-208	ENST00000430445	FAM72A	Q5TYM5	149 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RAB17-208	ENST00000430445	TAF3	Q5VWG9	929 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RAB17-208	ENST00000430445	FAM72D	Q6L9T8	149 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RAB17-208	ENST00000430445	ENPP7	Q6UWV6	458 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RAB17-208	ENST00000430445	ARC	Q7LC44	396 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RAB17-208	ENST00000430445	VASH2	Q86V25	355 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RAB17-208	ENST00000430445	FAM72B	Q86X60	149 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RAB17-208	ENST00000430445	NETO2	Q8NC67	525 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RAB17-208	ENST00000430445	APOO	Q9BUR5	198 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RAB17-208	ENST00000430445	RETREG1	Q9H6L5	497 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RAB17-208	ENST00000430445	SEPT10	Q9P0V9	454 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RAB17-208	ENST00000430445	DKK3	Q9UBP4	350 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RAB17-208	ENST00000430445	NEU3	Q9UQ49	428 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RAB17-208	ENST00000430445	PRAMEF33	A0A0G2JMD5	474 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RAB17-208	ENST00000430445	ZSCAN5C	A6NGD5	496 aa	Predicted RBP	13.9	□□□□□ -0.18
RAB17-208	ENST00000430445	AGRP	O00253	132 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RAB17-208	ENST00000430445	BUB1	O43683	1085 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RAB17-208	ENST00000430445	KDELR3	O43731	214 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RAB17-208	ENST00000430445	PRAMEF10	O60809	474 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RAB17-208	ENST00000430445	LRIG2	O94898	1065 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RAB17-208	ENST00000430445	SFTPC	P11686	197 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RAB17-208	ENST00000430445	HTR1B	P28222	390 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RAB17-208	ENST00000430445	ETV5	P41161	510 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RAB17-208	ENST00000430445	SRP54	P61011	504 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
RAB17-208	ENST00000430445	RHOA	P61586	193 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RAB17-208	ENST00000430445	ZFP36L1	Q07352	338 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
RAB17-208	ENST00000430445	C15orf59	Q2T9L4	293 aa	Predicted RBP	13.9	□□□□□ -0.18
RAB17-208	ENST00000430445	DPY19L2P1	Q6NXN4	242 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RAB17-208	ENST00000430445	ZFAND4	Q86XD8	727 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RAB17-208	ENST00000430445	CCNJL	Q8IV13	435 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RAB17-208	ENST00000430445		Q8N9G6	341 aa	Predicted RBP	13.9	□□□□□ -0.18
RAB17-208	ENST00000430445	MSANTD4	Q8NCY6	345 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RAB17-208	ENST00000430445	GPR156	Q8NFN8	814 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RAB17-208	ENST00000430445	RBM15	Q96T37	977 aa	Known RBP eCLIP	13.9	□□□□□ -0.18	3e-6	■■□□□ 11.9
RAB17-208	ENST00000430445	SEMA3C	Q99985	751 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RAB17-208	ENST00000430445	MAGEB5	Q9BZ81	275 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RAB17-208	ENST00000430445	METTL5	Q9NRN9	209 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
RAB17-208	ENST00000430445	KL	Q9UEF7	1012 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RAB17-208	ENST00000430445	APPL1	Q9UKG1	709 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RAB17-208	ENST00000430445	MFHAS1	Q9Y4C4	1052 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RAB17-208	ENST00000430445	PCDHGA4	Q9Y5G9	962 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RAB17-208	ENST00000430445	LSM8	O95777	96 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
RAB17-208	ENST00000430445	TNF	P01375	233 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RAB17-208	ENST00000430445	GLB1	P16278	677 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RAB17-208	ENST00000430445	WT1	P19544	449 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
RAB17-208	ENST00000430445	XPA	P23025	273 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
RAB17-208	ENST00000430445	MAPK10	P53779	464 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RAB17-208	ENST00000430445	NOMO3	P69849	1222 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RAB17-208	ENST00000430445	ELP6	Q0PNE2	266 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RAB17-208	ENST00000430445	RAPGEF1	Q13905	1077 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RAB17-208	ENST00000430445	INPP5A	Q14642	412 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RAB17-208	ENST00000430445	TBR1	Q16650	682 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RAB17-208	ENST00000430445	COLEC12	Q5KU26	742 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RAB17-208	ENST00000430445	KCTD16	Q68DU8	428 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RAB17-208	ENST00000430445	DTX1	Q86Y01	620 aa		13.89	□□□□□ -0.19

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