RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428458.1

PYGB-202, Transcript of glycogen phosphorylase B, humanhuman

TSL 3

Gene PYGB, Length 734 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PYGB-202ENST00000428458 VASH2Q86V25 355 aa11.5□□□□□ -0.57
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PYGB-202ENST00000428458 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP11.47□□□□□ -0.57
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PYGB-202ENST00000428458 CYTH1Q15438 398 aa11.47□□□□□ -0.57
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