RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427516.2

VTI1BP4-201, Transcript of vesicle transport through interaction with t-SNAREs 1B pseudogene 4, humanhuman

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Gene VTI1BP4, Length 527 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTI1BP4-201ENST00000427516 IFNB1P01574 187 aa5.65□□□□□ -1.5
VTI1BP4-201ENST00000427516 MPOP05164 745 aa5.65□□□□□ -1.5
VTI1BP4-201ENST00000427516 DUX4L2P0CJ85 424 aa5.65□□□□□ -1.5
VTI1BP4-201ENST00000427516 DUX4L3P0CJ86 424 aa5.65□□□□□ -1.5
VTI1BP4-201ENST00000427516 DUX4L4P0CJ87 422 aa5.65□□□□□ -1.5
VTI1BP4-201ENST00000427516 DUX4L5P0CJ88 424 aa5.65□□□□□ -1.5
VTI1BP4-201ENST00000427516 DUX4L6P0CJ89 424 aa5.65□□□□□ -1.5
VTI1BP4-201ENST00000427516 DUX4L7P0CJ90 424 aa5.65□□□□□ -1.5
VTI1BP4-201ENST00000427516 CYP11B1P15538 503 aa5.65□□□□□ -1.5
VTI1BP4-201ENST00000427516 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
VTI1BP4-201ENST00000427516 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
VTI1BP4-201ENST00000427516 FGFR2P21802 821 aa5.65□□□□□ -1.5
VTI1BP4-201ENST00000427516 EPHA3P29320 983 aa5.65□□□□□ -1.5
VTI1BP4-201ENST00000427516 SSTR1P30872 391 aa5.65□□□□□ -1.5
VTI1BP4-201ENST00000427516 HTR7P34969 479 aa5.65□□□□□ -1.5
VTI1BP4-201ENST00000427516 UGT2B10P36537 528 aa5.65□□□□□ -1.5
VTI1BP4-201ENST00000427516 BMPR1AP36894 532 aa5.65□□□□□ -1.5
VTI1BP4-201ENST00000427516 ETFBP38117 255 aa5.65□□□□□ -1.5
VTI1BP4-201ENST00000427516 SLC26A3P40879 764 aa5.65□□□□□ -1.5
VTI1BP4-201ENST00000427516 ATP4BP51164 291 aa5.65□□□□□ -1.5
VTI1BP4-201ENST00000427516 VAMP7P51809 220 aa5.65□□□□□ -1.5
VTI1BP4-201ENST00000427516 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
VTI1BP4-201ENST00000427516 SLC12A3P55017 1021 aa5.65□□□□□ -1.5
VTI1BP4-201ENST00000427516 RAB14P61106 215 aa5.65□□□□□ -1.5
VTI1BP4-201ENST00000427516 PSME3P61289 254 aa5.65□□□□□ -1.5
VTI1BP4-201ENST00000427516 GSTO1P78417 241 aa5.65□□□□□ -1.5
VTI1BP4-201ENST00000427516 PURAQ00577 322 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
VTI1BP4-201ENST00000427516 CNTN2Q02246 1040 aa5.65□□□□□ -1.5
VTI1BP4-201ENST00000427516 RALGDSQ12967 914 aa5.65□□□□□ -1.5
VTI1BP4-201ENST00000427516 DNASE1L3Q13609 305 aa5.65□□□□□ -1.5
VTI1BP4-201ENST00000427516 GNA13Q14344 377 aa5.65□□□□□ -1.5
VTI1BP4-201ENST00000427516 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
VTI1BP4-201ENST00000427516 NFIXQ14938 502 aa5.65□□□□□ -1.5
VTI1BP4-201ENST00000427516 ATP6AP1Q15904 470 aa5.65□□□□□ -1.5
VTI1BP4-201ENST00000427516 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa5.65□□□□□ -1.5
VTI1BP4-201ENST00000427516 YIF1BQ5BJH7 314 aa5.65□□□□□ -1.5
VTI1BP4-201ENST00000427516 BRMS1LQ5PSV4 323 aa5.65□□□□□ -1.5
VTI1BP4-201ENST00000427516 ATAD3CQ5T2N8 411 aa5.65□□□□□ -1.5
VTI1BP4-201ENST00000427516 GRTP1Q5TC63 336 aa5.65□□□□□ -1.5
VTI1BP4-201ENST00000427516 GARNL3Q5VVW2 1013 aa5.65□□□□□ -1.5
VTI1BP4-201ENST00000427516 FAM205BPQ63HN1 556 aa5.65□□□□□ -1.5
VTI1BP4-201ENST00000427516 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa5.65□□□□□ -1.5
VTI1BP4-201ENST00000427516 LETMD1Q6P1Q0 360 aa5.65□□□□□ -1.5
VTI1BP4-201ENST00000427516 NAPRTQ6XQN6 538 aa5.65□□□□□ -1.5
VTI1BP4-201ENST00000427516 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa5.65□□□□□ -1.5
VTI1BP4-201ENST00000427516 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
VTI1BP4-201ENST00000427516 ATG14Q6ZNE5 492 aa5.65□□□□□ -1.5
VTI1BP4-201ENST00000427516 SH2D5Q6ZV89 423 aa5.65□□□□□ -1.5
VTI1BP4-201ENST00000427516 SPATC1Q76KD6 591 aa5.65□□□□□ -1.5
VTI1BP4-201ENST00000427516 OTOP3Q7RTS5 596 aa5.65□□□□□ -1.5
VTI1BP4-201ENST00000427516 SPRED1Q7Z699 444 aa5.65□□□□□ -1.5
VTI1BP4-201ENST00000427516 THAP5Q7Z6K1 395 aa5.65□□□□□ -1.5
VTI1BP4-201ENST00000427516 NOXA1Q86UR1 476 aa5.65□□□□□ -1.5
VTI1BP4-201ENST00000427516 P2RY8Q86VZ1 359 aa5.65□□□□□ -1.5
VTI1BP4-201ENST00000427516 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
VTI1BP4-201ENST00000427516 LYSMD2Q8IV50 215 aa5.65□□□□□ -1.5
VTI1BP4-201ENST00000427516 MCOLN2Q8IZK6 566 aa5.65□□□□□ -1.5
VTI1BP4-201ENST00000427516 SLC38A6Q8IZM9 456 aa5.65□□□□□ -1.5
VTI1BP4-201ENST00000427516 RBFAQ8N0V3 343 aa5.65□□□□□ -1.5
VTI1BP4-201ENST00000427516 LILRA2Q8N149 483 aa5.65□□□□□ -1.5
VTI1BP4-201ENST00000427516 MFSD4AQ8N468 514 aa5.65□□□□□ -1.5
VTI1BP4-201ENST00000427516 PPM1NQ8N819 430 aa5.65□□□□□ -1.5
VTI1BP4-201ENST00000427516 ZNF781Q8N8C0 355 aa5.65□□□□□ -1.5
VTI1BP4-201ENST00000427516 FNDC5Q8NAU1 212 aa5.65□□□□□ -1.5
VTI1BP4-201ENST00000427516 MCUQ8NE86 351 aa5.65□□□□□ -1.5
VTI1BP4-201ENST00000427516 FLAD1Q8NFF5 587 aa5.65□□□□□ -1.5
VTI1BP4-201ENST00000427516 OR5T2Q8NGG2 359 aa5.65□□□□□ -1.5
VTI1BP4-201ENST00000427516 OR5H6Q8NGV6 325 aa5.65□□□□□ -1.5
VTI1BP4-201ENST00000427516 OR6F1Q8NGZ6 308 aa5.65□□□□□ -1.5
VTI1BP4-201ENST00000427516 OR8K5Q8NH50 307 aa5.65□□□□□ -1.5
VTI1BP4-201ENST00000427516 MCFD2Q8NI22 146 aa5.65□□□□□ -1.5
VTI1BP4-201ENST00000427516 PSMA8Q8TAA3 256 aa5.65□□□□□ -1.5
VTI1BP4-201ENST00000427516 ZFAND1Q8TCF1 268 aa5.65□□□□□ -1.5
VTI1BP4-201ENST00000427516 BRSK1Q8TDC3 778 aa5.65□□□□□ -1.5
VTI1BP4-201ENST00000427516 RASGRP4Q8TDF6 673 aa5.65□□□□□ -1.5
VTI1BP4-201ENST00000427516 FIG4Q92562 907 aa5.65□□□□□ -1.5
VTI1BP4-201ENST00000427516 RORBQ92753 470 aa5.65□□□□□ -1.5
VTI1BP4-201ENST00000427516 MUL1Q969V5 352 aa5.65□□□□□ -1.5
VTI1BP4-201ENST00000427516 ATP6V1E2Q96A05 226 aa5.65□□□□□ -1.5
VTI1BP4-201ENST00000427516 TMEM80Q96HE8 168 aa5.65□□□□□ -1.5
VTI1BP4-201ENST00000427516 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
VTI1BP4-201ENST00000427516 SERAC1Q96JX3 654 aa5.65□□□□□ -1.5
VTI1BP4-201ENST00000427516 KLHL32Q96NJ5 620 aa5.65□□□□□ -1.5
VTI1BP4-201ENST00000427516 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP5.65□□□□□ -1.5
VTI1BP4-201ENST00000427516 SLITRK1Q96PX8 696 aa5.65□□□□□ -1.5
VTI1BP4-201ENST00000427516 SECISBP2Q96T21 854 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
VTI1BP4-201ENST00000427516 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
VTI1BP4-201ENST00000427516 B3GNT4Q9C0J1 378 aa5.65□□□□□ -1.5
VTI1BP4-201ENST00000427516 GPR88Q9GZN0 384 aa5.65□□□□□ -1.5
VTI1BP4-201ENST00000427516 ZBTB26Q9HCK0 441 aa5.65□□□□□ -1.5
VTI1BP4-201ENST00000427516 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
VTI1BP4-201ENST00000427516 C1orf112Q9NSG2 853 aa5.65□□□□□ -1.5
VTI1BP4-201ENST00000427516 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
VTI1BP4-201ENST00000427516 TBC1D13Q9NVG8 400 aa5.65□□□□□ -1.5
VTI1BP4-201ENST00000427516 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP5.65□□□□□ -1.5
VTI1BP4-201ENST00000427516 SMOXQ9NWM0 555 aa5.65□□□□□ -1.5
VTI1BP4-201ENST00000427516 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa5.65□□□□□ -1.5
VTI1BP4-201ENST00000427516 SCN3BQ9NY72 215 aa5.65□□□□□ -1.5
VTI1BP4-201ENST00000427516 USE1Q9NZ43 259 aa5.65□□□□□ -1.5
VTI1BP4-201ENST00000427516 DUX4Q9UBX2 424 aa5.65□□□□□ -1.5
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