RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427110.6

PTPRC-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, human

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 264 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRC-208	ENST00000427110	NPIPB15	A6NHN6	443 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
PTPRC-208	ENST00000427110	CBY3	A6NI87	242 aa		2.55	□□□□□ -2
PTPRC-208	ENST00000427110	HSPB2	A8KAH6	182 aa		2.55	□□□□□ -2
PTPRC-208	ENST00000427110	KDM4E	B2RXH2	506 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
PTPRC-208	ENST00000427110	KLRF2	D3W0D1	207 aa		2.55	□□□□□ -2
PTPRC-208	ENST00000427110	EBAG9	O00559	213 aa		2.55	□□□□□ -2
PTPRC-208	ENST00000427110	AP3D1	O14617	1153 aa		2.55	□□□□□ -2
PTPRC-208	ENST00000427110	LDLRAD4	O15165	306 aa		2.55	□□□□□ -2
PTPRC-208	ENST00000427110	ATG13	O75143	517 aa		2.55	□□□□□ -2
PTPRC-208	ENST00000427110	SEC14L2	O76054	403 aa		2.55	□□□□□ -2
PTPRC-208	ENST00000427110	MTA2	O94776	668 aa		2.55	□□□□□ -2
PTPRC-208	ENST00000427110	SEC31A	O94979	1220 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
PTPRC-208	ENST00000427110	OAZ2	O95190	189 aa		2.55	□□□□□ -2
PTPRC-208	ENST00000427110	CYP1A2	P05177	515 aa		2.55	□□□□□ -2
PTPRC-208	ENST00000427110	CLEC3B	P05452	202 aa		2.55	□□□□□ -2
PTPRC-208	ENST00000427110	HOXB2	P14652	356 aa		2.55	□□□□□ -2
PTPRC-208	ENST00000427110	HOXB6	P17509	224 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
PTPRC-208	ENST00000427110	CAPN3	P20807	821 aa		2.55	□□□□□ -2
PTPRC-208	ENST00000427110	NFKBIA	P25963	317 aa		2.55	□□□□□ -2
PTPRC-208	ENST00000427110	HOXA11	P31270	313 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
PTPRC-208	ENST00000427110	CCKAR	P32238	428 aa		2.55	□□□□□ -2
PTPRC-208	ENST00000427110	CCKBR	P32239	447 aa		2.55	□□□□□ -2
PTPRC-208	ENST00000427110	BSG	P35613	385 aa		2.55	□□□□□ -2
PTPRC-208	ENST00000427110	CPOX	P36551	454 aa		2.55	□□□□□ -2
PTPRC-208	ENST00000427110	RGS2	P41220	211 aa		2.55	□□□□□ -2
PTPRC-208	ENST00000427110	CASP2	P42575	452 aa		2.55	□□□□□ -2
PTPRC-208	ENST00000427110	CDKN2A	P42771	156 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
PTPRC-208	ENST00000427110	RXRG	P48443	463 aa		2.55	□□□□□ -2
PTPRC-208	ENST00000427110	CENPA	P49450	140 aa		2.55	□□□□□ -2
PTPRC-208	ENST00000427110	THBS3	P49746	956 aa		2.55	□□□□□ -2
PTPRC-208	ENST00000427110	GNAQ	P50148	359 aa		2.55	□□□□□ -2
PTPRC-208	ENST00000427110	EFNA5	P52803	228 aa		2.55	□□□□□ -2
PTPRC-208	ENST00000427110	NAP1L1	P55209	391 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
PTPRC-208	ENST00000427110	P2RX3	P56373	397 aa		2.55	□□□□□ -2
PTPRC-208	ENST00000427110	RPS3A	P61247	264 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
PTPRC-208	ENST00000427110	RPL7A	P62424	266 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
PTPRC-208	ENST00000427110	TMEM115	Q12893	351 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
PTPRC-208	ENST00000427110	GRIK3	Q13003	919 aa		2.55	□□□□□ -2
PTPRC-208	ENST00000427110	MED22	Q15528	200 aa		2.55	□□□□□ -2
PTPRC-208	ENST00000427110	HSPB2	Q16082	182 aa		2.55	□□□□□ -2
PTPRC-208	ENST00000427110	GSTA3	Q16772	222 aa		2.55	□□□□□ -2
PTPRC-208	ENST00000427110	HIST2H2AC	Q16777	129 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
PTPRC-208	ENST00000427110	PLEKHO1	Q53GL0	409 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
PTPRC-208	ENST00000427110		Q5PR19	223 aa		2.55	□□□□□ -2
PTPRC-208	ENST00000427110	WASHC2D	Q5SRD0	308 aa		2.55	□□□□□ -2
PTPRC-208	ENST00000427110	PRAMEF19	Q5SWL8	479 aa		2.55	□□□□□ -2
PTPRC-208	ENST00000427110	GPATCH4	Q5T3I0	446 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
PTPRC-208	ENST00000427110	DAB2IP	Q5VWQ8	1189 aa		2.55	□□□□□ -2
PTPRC-208	ENST00000427110	CDC73	Q6P1J9	531 aa		2.55	□□□□□ -2
PTPRC-208	ENST00000427110	KLHL24	Q6TFL4	600 aa		2.55	□□□□□ -2
PTPRC-208	ENST00000427110	LCTL	Q6UWM7	567 aa		2.55	□□□□□ -2
PTPRC-208	ENST00000427110	CRELD2	Q6UXH1	353 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
PTPRC-208	ENST00000427110	FAM83H	Q6ZRV2	1179 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
PTPRC-208	ENST00000427110	SLC16A12	Q6ZSM3	486 aa		2.55	□□□□□ -2
PTPRC-208	ENST00000427110	MEPCE	Q7L2J0	689 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
PTPRC-208	ENST00000427110	DENND6A	Q8IWF6	608 aa		2.55	□□□□□ -2
PTPRC-208	ENST00000427110	ZDHHC23	Q8IYP9	409 aa		2.55	□□□□□ -2
PTPRC-208	ENST00000427110	ADGRF5	Q8IZF2	1346 aa		2.55	□□□□□ -2
PTPRC-208	ENST00000427110	PARP16	Q8N5Y8	322 aa		2.55	□□□□□ -2
PTPRC-208	ENST00000427110	FRMD1	Q8N878	549 aa		2.55	□□□□□ -2
PTPRC-208	ENST00000427110	MIGA1	Q8NAN2	632 aa		2.55	□□□□□ -2
PTPRC-208	ENST00000427110	ANKRD52	Q8NB46	1076 aa		2.55	□□□□□ -2
PTPRC-208	ENST00000427110	KDM1B	Q8NB78	822 aa		2.55	□□□□□ -2
PTPRC-208	ENST00000427110	GJC3	Q8NFK1	279 aa		2.55	□□□□□ -2
PTPRC-208	ENST00000427110	GABPB2	Q8TAK5	448 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
PTPRC-208	ENST00000427110	GTF3C6	Q969F1	213 aa		2.55	□□□□□ -2
PTPRC-208	ENST00000427110	INTS12	Q96CB8	462 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
PTPRC-208	ENST00000427110	BARD1	Q99728	777 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
PTPRC-208	ENST00000427110	MXRA8	Q9BRK3	442 aa		2.55	□□□□□ -2
PTPRC-208	ENST00000427110	CHCHD6	Q9BRQ6	235 aa		2.55	□□□□□ -2
PTPRC-208	ENST00000427110	KRTAP1-5	Q9BYS1	174 aa		2.55	□□□□□ -2
PTPRC-208	ENST00000427110	ISCU	Q9H1K1	167 aa		2.55	□□□□□ -2
PTPRC-208	ENST00000427110	HIPK2	Q9H2X6	1198 aa		2.55	□□□□□ -2
PTPRC-208	ENST00000427110	MVB12B	Q9H7P6	319 aa		2.55	□□□□□ -2
PTPRC-208	ENST00000427110	MRPL44	Q9H9J2	332 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
PTPRC-208	ENST00000427110	BRF2	Q9HAW0	419 aa		2.55	□□□□□ -2
PTPRC-208	ENST00000427110	BPIFA1	Q9NP55	256 aa		2.55	□□□□□ -2
PTPRC-208	ENST00000427110	EIF2B3	Q9NR50	452 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
PTPRC-208	ENST00000427110	BLOC1S4	Q9NUP1	217 aa		2.55	□□□□□ -2
PTPRC-208	ENST00000427110	LIMA1	Q9UHB6	759 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
PTPRC-208	ENST00000427110	A4GNT	Q9UNA3	340 aa		2.55	□□□□□ -2
PTPRC-208	ENST00000427110	KDM3A	Q9Y4C1	1321 aa		2.55	□□□□□ -2
PTPRC-208	ENST00000427110	LRP12	Q9Y561	859 aa		2.55	□□□□□ -2
PTPRC-208	ENST00000427110	SRPRB	Q9Y5M8	271 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
PTPRC-208	ENST00000427110	INSL5	Q9Y5Q6	135 aa		2.55	□□□□□ -2
PTPRC-208	ENST00000427110	KCNE2	Q9Y6J6	123 aa		2.55	□□□□□ -2
PTPRC-208	ENST00000427110	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	2.54	□□□□□ -2
PTPRC-208	ENST00000427110	PI4KAP2	A4QPH2	592 aa		2.54	□□□□□ -2
PTPRC-208	ENST00000427110		F5H0A9	414 aa	Predicted RBP	2.54	□□□□□ -2
PTPRC-208	ENST00000427110	MS4A18	H0YCH9	400 aa		2.54	□□□□□ -2
PTPRC-208	ENST00000427110	GTPBP1	O00178	669 aa	Known RBP	2.54	□□□□□ -2
PTPRC-208	ENST00000427110	CHL1	O00533	1208 aa		2.54	□□□□□ -2
PTPRC-208	ENST00000427110	TGFB1I1	O43294	461 aa		2.54	□□□□□ -2
PTPRC-208	ENST00000427110	SMAD6	O43541	496 aa	Known RBP	2.54	□□□□□ -2
PTPRC-208	ENST00000427110	LIAS	O43766	372 aa		2.54	□□□□□ -2
PTPRC-208	ENST00000427110	USO1	O60763	962 aa	Known RBP	2.54	□□□□□ -2
PTPRC-208	ENST00000427110	RNASEH2A	O75792	299 aa	Known RBP	2.54	□□□□□ -2
PTPRC-208	ENST00000427110	RGS11	O94810	467 aa		2.54	□□□□□ -2
PTPRC-208	ENST00000427110	DDX58	O95786	925 aa	Known RBP	2.54	□□□□□ -2
PTPRC-208	ENST00000427110	SCGB1D1	O95968	90 aa		2.54	□□□□□ -2

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