RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415409.5

HDAC8-211, Transcript of histone deacetylase 8, humanhuman

TSL 5

Gene HDAC8, Length 913 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC8-211ENST00000415409 POU6F1Q14863 301 aa6.7□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 SLC1A5Q15758 541 aa6.7□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 TMEM259Q4ZIN3 620 aa6.7□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 RALGPS1Q5JS13 557 aa6.7□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 STXBP5Q5T5C0 1151 aa6.7□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 GRTP1Q5TC63 336 aa6.7□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 HHATQ5VTY9 493 aa6.7□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 ALG1LQ6GMV1 187 aa6.7□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 CES3Q6UWW8 571 aa6.7□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 PACS1Q6VY07 963 aa6.7□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 TIFABQ6ZNK6 161 aa6.7□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 KDELC2Q7Z4H8 507 aa6.7□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 KCNMB4Q86W47 210 aa6.7□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 BBS7Q8IWZ6 715 aa6.7□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 C4orf33Q8N1A6 199 aa6.7□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 PGBD5Q8N414 524 aa6.7□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 SLC25A41Q8N5S1 370 aa6.7□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 DCAF4L2Q8NA75 395 aa6.7□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 MGARPQ8TDB4 240 aa6.7□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 TADA1Q96BN2 335 aa6.7□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 TCEAL4Q96EI5 215 aa6.7□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 CHMP6Q96FZ7 201 aa6.7□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 RANBP9Q96S59 729 aa6.7□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 CPNE1Q99829 537 aa6.7□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 MGME1Q9BQP7 344 aa6.7□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 FEM1AQ9BSK4 669 aa6.7□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 CHRAC1Q9NRG0 131 aa6.7□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 SMYD2Q9NRG4 433 aa6.7□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 ENAMQ9NRM1 1142 aa6.7□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 TDP1Q9NUW8 608 aa6.7□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 DZANK1Q9NVP4 752 aa6.7□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 TCAF1Q9Y4C2 921 aa6.7□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa6.7□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 MICAL3Q7RTP6 2002 aa6.69□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 NLRC5Q86WI3 1866 aa6.69□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa6.69□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa6.69□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 FOXO6A8MYZ6 492 aa6.69□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 NDUFAB1O14561 156 aa6.69□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 COPEO14579 308 aa6.69□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 CLGNO14967 610 aa6.69□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 MUSKO15146 869 aa6.69□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 TM9SF1O15321 606 aa6.69□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 TIMM44O43615 452 aa6.69□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 TYROBPO43914 113 aa6.69□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 MOSPD3O75425 235 aa6.69□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 ZMPSTE24O75844 475 aa6.69□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 FAM155BO75949 473 aa6.69□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 TMCC1O94876 653 aa6.69□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 NDST3O95803 873 aa6.69□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 ERVK-10P10266 1014 aa6.69□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 TCF3P15923 654 aa6.69□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 CREB1P16220 341 aa6.69□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 GLDCP23378 1020 aa6.69□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 NMBRP28336 390 aa6.69□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 HADHAP40939 763 aa6.69□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 MAPK8P45983 427 aa6.69□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 NRIP1P48552 1158 aa6.69□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 SCNN1BP51168 640 aa6.69□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 RHOAP61586 193 aa6.69□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 NTHL1P78549 312 aa6.69□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 PDE1BQ01064 536 aa6.69□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 SLC18A2Q05940 514 aa6.69□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP6.69□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 BMPR2Q13873 1038 aa6.69□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 LRRC14Q15048 493 aa6.69□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 CYTH1Q15438 398 aa6.69□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 DUSP6Q16828 381 aa6.69□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 UGP2Q16851 508 aa6.69□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa6.69□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 FSCBQ5H9T9 825 aa6.69□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 SIRPB2Q5JXA9 342 aa6.69□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 PRSS36Q5K4E3 855 aa6.69□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 TSTD2Q5T7W7 516 aa6.69□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa6.69□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 MROH9Q5TGP6 573 aa6.69□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 FYB2Q5VWT5 728 aa6.69□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 LYPD4Q6UWN0 246 aa6.69□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 TPGS1Q6ZTW0 290 aa6.69□□□□□ -1.34
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