RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409093.1

LRRTM4-202, Transcript of leucine rich repeat transmembrane neuronal 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene LRRTM4, Length 2,247 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM4-202ENST00000409093 ATP6V1G2O95670 118 aa10.09□□□□□ -0.79
LRRTM4-202ENST00000409093 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
LRRTM4-202ENST00000409093 MMP2P08253 660 aa10.09□□□□□ -0.79
LRRTM4-202ENST00000409093 CNPP09543 421 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
LRRTM4-202ENST00000409093 CTSAP10619 480 aa10.09□□□□□ -0.79
LRRTM4-202ENST00000409093 IDO1P14902 403 aa10.09□□□□□ -0.79
LRRTM4-202ENST00000409093 FOSL1P15407 271 aa10.09□□□□□ -0.79
LRRTM4-202ENST00000409093 BGNP21810 368 aa10.09□□□□□ -0.79
LRRTM4-202ENST00000409093 TYK2P29597 1187 aa10.09□□□□□ -0.79
LRRTM4-202ENST00000409093 SGSHP51688 502 aa10.09□□□□□ -0.79
LRRTM4-202ENST00000409093 LBX1P52954 281 aa10.09□□□□□ -0.79
LRRTM4-202ENST00000409093 POLE2P56282 527 aa10.09□□□□□ -0.79
LRRTM4-202ENST00000409093 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
LRRTM4-202ENST00000409093 TNK2Q07912 1038 aa10.09□□□□□ -0.79
LRRTM4-202ENST00000409093 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP10.09□□□□□ -0.79
LRRTM4-202ENST00000409093 LRP8Q14114 963 aa10.09□□□□□ -0.79
LRRTM4-202ENST00000409093 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP10.09□□□□□ -0.79
LRRTM4-202ENST00000409093 FYB2Q5VWT5 728 aa10.09□□□□□ -0.79
LRRTM4-202ENST00000409093 C16orf59Q7L2K0 433 aa10.09□□□□□ -0.79
LRRTM4-202ENST00000409093 OTOAQ7RTW8 1153 aa10.09□□□□□ -0.79
LRRTM4-202ENST00000409093 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa10.09□□□□□ -0.79
LRRTM4-202ENST00000409093 HERC6Q8IVU3 1022 aa10.09□□□□□ -0.79
LRRTM4-202ENST00000409093 GPR65Q8IYL9 337 aa10.09□□□□□ -0.79
LRRTM4-202ENST00000409093 BBS5Q8N3I7 341 aa10.09□□□□□ -0.79
LRRTM4-202ENST00000409093 CCT6BQ92526 530 aa10.09□□□□□ -0.79
LRRTM4-202ENST00000409093 PTPRN2Q92932 1015 aa10.09□□□□□ -0.79
LRRTM4-202ENST00000409093 WBP2Q969T9 261 aa10.09□□□□□ -0.79
LRRTM4-202ENST00000409093 SEMA3CQ99985 751 aa10.09□□□□□ -0.79
LRRTM4-202ENST00000409093 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
LRRTM4-202ENST00000409093 FAM167BQ9BTA0 163 aa10.09□□□□□ -0.79
LRRTM4-202ENST00000409093 SPON2Q9BUD6 331 aa10.09□□□□□ -0.79
LRRTM4-202ENST00000409093 PDFQ9HBH1 243 aa10.09□□□□□ -0.79
LRRTM4-202ENST00000409093 RXFP1Q9HBX9 757 aa10.09□□□□□ -0.79
LRRTM4-202ENST00000409093 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
LRRTM4-202ENST00000409093 ABCF3Q9NUQ8 709 aa10.09□□□□□ -0.79
LRRTM4-202ENST00000409093 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa10.09□□□□□ -0.79
LRRTM4-202ENST00000409093 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa10.09□□□□□ -0.79
LRRTM4-202ENST00000409093 H3BNC9 293 aa10.09□□□□□ -0.79
LRRTM4-202ENST00000409093 LILRB3O75022 631 aa10.09□□□□□ -0.79
LRRTM4-202ENST00000409093 GLRA3O75311 464 aa10.09□□□□□ -0.79
LRRTM4-202ENST00000409093 VAPBO95292 243 aa10.09□□□□□ -0.79
LRRTM4-202ENST00000409093 FGBP02675 491 aa10.09□□□□□ -0.79
LRRTM4-202ENST00000409093 F11P03951 625 aa10.09□□□□□ -0.79
LRRTM4-202ENST00000409093 RHOCP08134 193 aa10.09□□□□□ -0.79
LRRTM4-202ENST00000409093 MSL3P1P0C860 447 aa10.09□□□□□ -0.79
LRRTM4-202ENST00000409093 CCDC166P0CW27 439 aa10.09□□□□□ -0.79
LRRTM4-202ENST00000409093 PAMP19021 973 aa10.09□□□□□ -0.79
LRRTM4-202ENST00000409093 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP10.09□□□□□ -0.79
LRRTM4-202ENST00000409093 ABCG1P45844 678 aa10.09□□□□□ -0.79
LRRTM4-202ENST00000409093 SERPINB8P50452 374 aa10.09□□□□□ -0.79
LRRTM4-202ENST00000409093 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
LRRTM4-202ENST00000409093 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
LRRTM4-202ENST00000409093 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP10.09□□□□□ -0.79
LRRTM4-202ENST00000409093 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP10.09□□□□□ -0.79
LRRTM4-202ENST00000409093 TXNDC8Q6A555 127 aa10.09□□□□□ -0.79
LRRTM4-202ENST00000409093 FSTL4Q6MZW2 842 aa10.09□□□□□ -0.79
LRRTM4-202ENST00000409093 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
LRRTM4-202ENST00000409093 CHST9Q7L1S5 443 aa10.09□□□□□ -0.79
LRRTM4-202ENST00000409093 CMC1Q7Z7K0 106 aa10.09□□□□□ -0.79
LRRTM4-202ENST00000409093 DCLK2Q8N568 766 aa10.09□□□□□ -0.79
LRRTM4-202ENST00000409093 OR52K2Q8NGK3 314 aa10.09□□□□□ -0.79
LRRTM4-202ENST00000409093 ARRDC2Q8TBH0 407 aa10.09□□□□□ -0.79
LRRTM4-202ENST00000409093 ZNF599Q96NL3 588 aa10.09□□□□□ -0.79
LRRTM4-202ENST00000409093 SLC22A12Q96S37 553 aa10.09□□□□□ -0.79
LRRTM4-202ENST00000409093 CYP2S1Q96SQ9 504 aa10.09□□□□□ -0.79
LRRTM4-202ENST00000409093 MECRQ9BV79 373 aa10.09□□□□□ -0.79
LRRTM4-202ENST00000409093 TSSK1BQ9BXA7 367 aa10.09□□□□□ -0.79
LRRTM4-202ENST00000409093 PRKD2Q9BZL6 878 aa10.09□□□□□ -0.79
LRRTM4-202ENST00000409093 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP10.09□□□□□ -0.79
LRRTM4-202ENST00000409093 ARNT2Q9HBZ2 717 aa10.09□□□□□ -0.79
LRRTM4-202ENST00000409093 ATP13A1Q9HD20 1204 aa10.09□□□□□ -0.79
LRRTM4-202ENST00000409093 SNX15Q9NRS6 342 aa10.09□□□□□ -0.79
LRRTM4-202ENST00000409093 PRKAG3Q9UGI9 489 aa10.09□□□□□ -0.79
LRRTM4-202ENST00000409093 HEATR9A2RTY3 570 aa10.08□□□□□ -0.8
LRRTM4-202ENST00000409093 HTR3EA5X5Y0 456 aa10.08□□□□□ -0.8
LRRTM4-202ENST00000409093 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP10.08□□□□□ -0.8
LRRTM4-202ENST00000409093 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP10.08□□□□□ -0.8
LRRTM4-202ENST00000409093 CSPG5O95196 566 aa10.08□□□□□ -0.8
LRRTM4-202ENST00000409093 LRG1P02750 347 aa10.08□□□□□ -0.8
LRRTM4-202ENST00000409093 NFKBIAP25963 317 aa10.08□□□□□ -0.8
LRRTM4-202ENST00000409093 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP10.08□□□□□ -0.8
LRRTM4-202ENST00000409093 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP10.08□□□□□ -0.8
LRRTM4-202ENST00000409093 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP10.08□□□□□ -0.8
LRRTM4-202ENST00000409093 TMC7Q7Z402 723 aa10.08□□□□□ -0.8
LRRTM4-202ENST00000409093 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP10.08□□□□□ -0.8
LRRTM4-202ENST00000409093 TTC16Q8NEE8 873 aa10.08□□□□□ -0.8
LRRTM4-202ENST00000409093 VPS39Q96JC1 886 aa10.08□□□□□ -0.8
LRRTM4-202ENST00000409093 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP10.08□□□□□ -0.8
LRRTM4-202ENST00000409093 IL21Q9HBE4 155 aa10.08□□□□□ -0.8
LRRTM4-202ENST00000409093 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP10.08□□□□□ -0.8
LRRTM4-202ENST00000409093 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa10.08□□□□□ -0.8
LRRTM4-202ENST00000409093 DCDC2Q9UHG0 476 aa10.08□□□□□ -0.8
LRRTM4-202ENST00000409093 GGT7Q9UJ14 662 aa10.08□□□□□ -0.8
LRRTM4-202ENST00000409093 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa10.07□□□□□ -0.8
LRRTM4-202ENST00000409093 ILVBLA1L0T0 632 aa10.07□□□□□ -0.8
LRRTM4-202ENST00000409093 MUSKO15146 869 aa10.07□□□□□ -0.8
LRRTM4-202ENST00000409093 GJB3O75712 270 aa10.07□□□□□ -0.8
LRRTM4-202ENST00000409093 ADH1AP07327 375 aa10.07□□□□□ -0.8
LRRTM4-202ENST00000409093 LINC00271P0C7V0 271 aa10.07□□□□□ -0.8
LRRTM4-202ENST00000409093 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP10.07□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.9 ms