RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395788.3

C6orf48-208, Transcript of chromosome 6 open reading frame 48, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene C6orf48, Length 815 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf48-208ENST00000395788 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 RANBP10Q6VN20 620 aa6.11□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 ZNF783Q6ZMS7 281 aa6.11□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 RGS9BPQ6ZS82 235 aa6.11□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 CAPN12Q6ZSI9 719 aa6.11□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 CCDC149Q6ZUS6 474 aa6.11□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 OTOP3Q7RTS5 596 aa6.11□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 LINC00523Q86TU6 105 aa6.11□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
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C6orf48-208ENST00000395788 CHSY1Q86X52 802 aa6.11□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 OR52K1Q8NGK4 314 aa6.11□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 ARRDC2Q8TBH0 407 aa6.11□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 SPPL3Q8TCT6 385 aa6.11□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 CKAP2Q8WWK9 683 aa6.11□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 WBP2Q969T9 261 aa6.11□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 ISL2Q96A47 359 aa6.11□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 CFAP36Q96G28 342 aa6.11□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 SGSM3Q96HU1 749 aa6.11□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 MCMBPQ9BTE3 642 aa6.11□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 KIFC1Q9BW19 673 aa6.11□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 MCOLN1Q9GZU1 580 aa6.11□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 IL22Q9GZX6 179 aa6.11□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 MAGEH1Q9H213 219 aa6.11□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 TRABDQ9H4I3 376 aa6.11□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa6.11□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 VPS45Q9NRW7 570 aa6.11□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP6.11□□□□□ -1.434e-7■■■□□ 16.7
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C6orf48-208ENST00000395788 MKS1Q9NXB0 559 aa6.11□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 SOX13Q9UN79 622 aa6.11□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa6.11□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 RWDD3Q9Y3V2 267 aa6.11□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 FAM169AQ9Y6X4 670 aa6.11□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 ALPK3Q96L96 1907 aa6.11□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 CHD5Q8TDI0 1954 aa6.1□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa6.1□□□□□ -1.43
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C6orf48-208ENST00000395788 DHRS4L1P0CG22 281 aa6.1□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 DRD4P21917 467 aa6.1□□□□□ -1.43
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C6orf48-208ENST00000395788 HOXA9P31269 272 aa6.1□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 MAGEA12P43365 314 aa6.1□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 NEK3P51956 506 aa6.1□□□□□ -1.43
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C6orf48-208ENST00000395788 ERVFC1P60507 584 aa6.1□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 ZXDBP98169 803 aa6.1□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 GNA12Q03113 381 aa6.1□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 SLC10A7Q0GE19 358 aa6.1□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 CAMK1Q14012 370 aa6.1□□□□□ -1.43
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C6orf48-208ENST00000395788 IHHQ14623 411 aa6.1□□□□□ -1.43
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C6orf48-208ENST00000395788 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa6.1□□□□□ -1.43
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C6orf48-208ENST00000395788 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP6.1□□□□□ -1.43
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C6orf48-208ENST00000395788 HTR3DQ70Z44 454 aa6.1□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 GAREM2Q75VX8 874 aa6.1□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa6.1□□□□□ -1.43
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C6orf48-208ENST00000395788 KREMEN2Q8NCW0 462 aa6.1□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP6.1□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 SPATA22Q8NHS9 363 aa6.1□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 BCAS4Q8TDM0 211 aa6.1□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 MTBPQ96DY7 904 aa6.1□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP6.1□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 SLC22A12Q96S37 553 aa6.1□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 RANBP9Q96S59 729 aa6.1□□□□□ -1.43
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