RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393537.4

ANKRD39-201, Transcript of ankyrin repeat domain 39, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ANKRD39, Length 976 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39-201ENST00000393537 TM7SF2O76062 418 aa20.42■□□□□ 0.86
ANKRD39-201ENST00000393537 PEX11BO96011 259 aa20.42■□□□□ 0.86
ANKRD39-201ENST00000393537 KRT7P08729 469 aa20.42■□□□□ 0.86
ANKRD39-201ENST00000393537 MAN1A1P33908 653 aa20.42■□□□□ 0.86
ANKRD39-201ENST00000393537 SCNN1BP51168 640 aa20.42■□□□□ 0.86
ANKRD39-201ENST00000393537 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP20.42■□□□□ 0.86
ANKRD39-201ENST00000393537 ZNF235Q14590 738 aa20.42■□□□□ 0.86
ANKRD39-201ENST00000393537 MESDQ14696 234 aa20.42■□□□□ 0.86
ANKRD39-201ENST00000393537 TMEM52BQ4KMG9 183 aa20.42■□□□□ 0.86
ANKRD39-201ENST00000393537 CCDC157Q569K6 752 aa20.42■□□□□ 0.86
ANKRD39-201ENST00000393537 BRAT1Q6PJG6 821 aa20.42■□□□□ 0.86
ANKRD39-201ENST00000393537 PAF1Q8N7H5 531 aa20.42■□□□□ 0.86
ANKRD39-201ENST00000393537 DENND6BQ8NEG7 585 aa20.42■□□□□ 0.86
ANKRD39-201ENST00000393537 SLC35G2Q8TBE7 412 aa20.42■□□□□ 0.86
ANKRD39-201ENST00000393537 CNDP2Q96KP4 475 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
ANKRD39-201ENST00000393537 GPR27Q9NS67 375 aa20.42■□□□□ 0.86
ANKRD39-201ENST00000393537 PTPRBP23467 1997 aa20.42■□□□□ 0.86
ANKRD39-201ENST00000393537 MFSD11O43934 449 aa20.41■□□□□ 0.86
ANKRD39-201ENST00000393537 MAFKO60675 156 aa20.41■□□□□ 0.86
ANKRD39-201ENST00000393537 LDOC1O95751 146 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
ANKRD39-201ENST00000393537 PRKCGP05129 697 aa20.41■□□□□ 0.86
ANKRD39-201ENST00000393537 RABIFP47224 123 aa20.41■□□□□ 0.86
ANKRD39-201ENST00000393537 AP1S1P61966 158 aa20.41■□□□□ 0.86
ANKRD39-201ENST00000393537 SEMG2Q02383 582 aa20.41■□□□□ 0.86
ANKRD39-201ENST00000393537 BCL2L1Q07817 233 aa20.41■□□□□ 0.86
ANKRD39-201ENST00000393537 PDK2Q15119 407 aa20.41■□□□□ 0.86
ANKRD39-201ENST00000393537 ZNF542PQ5EBM4 170 aa20.41■□□□□ 0.86
ANKRD39-201ENST00000393537 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa20.41■□□□□ 0.86
ANKRD39-201ENST00000393537 KDM7AQ6ZMT4 941 aa20.41■□□□□ 0.86
ANKRD39-201ENST00000393537 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
ANKRD39-201ENST00000393537 PCDH19Q8TAB3 1148 aa20.41■□□□□ 0.86
ANKRD39-201ENST00000393537 CENPTQ96BT3 561 aa20.41■□□□□ 0.86
ANKRD39-201ENST00000393537 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa20.41■□□□□ 0.86
ANKRD39-201ENST00000393537 CAAP1Q9H8G2 361 aa20.41■□□□□ 0.86
ANKRD39-201ENST00000393537 MSRB2Q9Y3D2 182 aa20.41■□□□□ 0.86
ANKRD39-201ENST00000393537 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
ANKRD39-201ENST00000393537 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
ANKRD39-201ENST00000393537 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa20.4■□□□□ 0.86
ANKRD39-201ENST00000393537 ENC1O14682 589 aa20.4■□□□□ 0.86
ANKRD39-201ENST00000393537 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
ANKRD39-201ENST00000393537 DKK1O94907 266 aa20.4■□□□□ 0.86
ANKRD39-201ENST00000393537 C1QTNF9P0C862 333 aa20.4■□□□□ 0.86
ANKRD39-201ENST00000393537 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
ANKRD39-201ENST00000393537 FZD2Q14332 565 aa20.4■□□□□ 0.86
ANKRD39-201ENST00000393537 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa20.4■□□□□ 0.86
ANKRD39-201ENST00000393537 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa20.4■□□□□ 0.86
ANKRD39-201ENST00000393537 ERAP2Q6P179 960 aa20.4■□□□□ 0.86
ANKRD39-201ENST00000393537 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa20.4■□□□□ 0.86
ANKRD39-201ENST00000393537 MAP7D3Q8IWC1 876 aa20.4■□□□□ 0.86
ANKRD39-201ENST00000393537 BBS5Q8N3I7 341 aa20.4■□□□□ 0.86
ANKRD39-201ENST00000393537 PGBD5Q8N414 524 aa20.4■□□□□ 0.86
ANKRD39-201ENST00000393537 NSMCE1Q8WV22 266 aa20.4■□□□□ 0.86
ANKRD39-201ENST00000393537 ECHDC3Q96DC8 303 aa20.4■□□□□ 0.86
ANKRD39-201ENST00000393537 NSMCE3Q96MG7 304 aa20.4■□□□□ 0.86
ANKRD39-201ENST00000393537 ZNF670Q9BS34 389 aa20.4■□□□□ 0.86
ANKRD39-201ENST00000393537 RBSNQ9H1K0 784 aa20.4■□□□□ 0.86
ANKRD39-201ENST00000393537 DNAJC28Q9NX36 388 aa20.4■□□□□ 0.86
ANKRD39-201ENST00000393537 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa20.4■□□□□ 0.86
ANKRD39-201ENST00000393537 COQ6Q9Y2Z9 468 aa20.4■□□□□ 0.86
ANKRD39-201ENST00000393537 DGKAP23743 735 aa20.39■□□□□ 0.85
ANKRD39-201ENST00000393537 IGFALSP35858 605 aa20.39■□□□□ 0.85
ANKRD39-201ENST00000393537 MMP12P39900 470 aa20.39■□□□□ 0.85
ANKRD39-201ENST00000393537 PFN3P60673 137 aa20.39■□□□□ 0.85
ANKRD39-201ENST00000393537 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
ANKRD39-201ENST00000393537 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
ANKRD39-201ENST00000393537 RHOT2Q8IXI1 618 aa20.39■□□□□ 0.85
ANKRD39-201ENST00000393537 SLC25A45Q8N413 288 aa20.39■□□□□ 0.85
ANKRD39-201ENST00000393537 TC2NQ8N9U0 490 aa20.39■□□□□ 0.85
ANKRD39-201ENST00000393537 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
ANKRD39-201ENST00000393537 RFFLQ8WZ73 363 aa20.39■□□□□ 0.85
ANKRD39-201ENST00000393537 IFT43Q96FT9 208 aa20.39■□□□□ 0.85
ANKRD39-201ENST00000393537 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
ANKRD39-201ENST00000393537 UCKL1Q9NWZ5 548 aa20.39■□□□□ 0.85
ANKRD39-201ENST00000393537 CHD8Q9HCK8 2581 aa20.38■□□□□ 0.85
ANKRD39-201ENST00000393537 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa20.38■□□□□ 0.85
ANKRD39-201ENST00000393537 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa20.38■□□□□ 0.85
ANKRD39-201ENST00000393537 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
ANKRD39-201ENST00000393537 FAM221BA6H8Z2 402 aa20.38■□□□□ 0.85
ANKRD39-201ENST00000393537 PIAS2O75928 621 aa20.38■□□□□ 0.85
ANKRD39-201ENST00000393537 MTA2O94776 668 aa20.38■□□□□ 0.85
ANKRD39-201ENST00000393537 MAP3K6O95382 1288 aa20.38■□□□□ 0.85
ANKRD39-201ENST00000393537 C6P13671 934 aa20.38■□□□□ 0.85
ANKRD39-201ENST00000393537 CR2P20023 1033 aa20.38■□□□□ 0.85
ANKRD39-201ENST00000393537 ARHGAP25P42331 645 aa20.38■□□□□ 0.85
ANKRD39-201ENST00000393537 MMP13P45452 471 aa20.38■□□□□ 0.85
ANKRD39-201ENST00000393537 LIG3P49916 1009 aa20.38■□□□□ 0.85
ANKRD39-201ENST00000393537 MAXP61244 160 aa20.38■□□□□ 0.85
ANKRD39-201ENST00000393537 GALNT2Q10471 571 aa20.38■□□□□ 0.85
ANKRD39-201ENST00000393537 DNAJC3Q13217 504 aa20.38■□□□□ 0.85
ANKRD39-201ENST00000393537 TPRG1LQ5T0D9 272 aa20.38■□□□□ 0.85
ANKRD39-201ENST00000393537 MARC1Q5VT66 337 aa20.38■□□□□ 0.85
ANKRD39-201ENST00000393537 PARGQ86W56 976 aa20.38■□□□□ 0.85
ANKRD39-201ENST00000393537 LRRC49Q8IUZ0 686 aa20.38■□□□□ 0.85
ANKRD39-201ENST00000393537 RAPGEF5Q92565 580 aa20.38■□□□□ 0.85
ANKRD39-201ENST00000393537 GATA6Q92908 595 aa20.38■□□□□ 0.85
ANKRD39-201ENST00000393537 FAF2Q96CS3 445 aa20.38■□□□□ 0.85
ANKRD39-201ENST00000393537 NUDCD1Q96RS6 583 aa20.38■□□□□ 0.85
ANKRD39-201ENST00000393537 MGME1Q9BQP7 344 aa20.38■□□□□ 0.85
ANKRD39-201ENST00000393537 SCUBE2Q9NQ36 999 aa20.38■□□□□ 0.85
ANKRD39-201ENST00000393537 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.9 ms