RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000390606.3

IGHV3-20-201, Transcript of immunoglobulin heavy variable 3-20, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene IGHV3-20, Length 415 nt, Biotype IG V gene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-20-201ENST00000390606 IGLON5A6NGN9 336 aa22.22■■□□□ 1.15
IGHV3-20-201ENST00000390606 NEMP1O14524 444 aa22.22■■□□□ 1.15
IGHV3-20-201ENST00000390606 KCNK3O14649 394 aa22.22■■□□□ 1.15
IGHV3-20-201ENST00000390606 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
IGHV3-20-201ENST00000390606 KRT10P13645 584 aa22.22■■□□□ 1.15
IGHV3-20-201ENST00000390606 CD59P13987 128 aa22.22■■□□□ 1.15
IGHV3-20-201ENST00000390606 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
IGHV3-20-201ENST00000390606 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
IGHV3-20-201ENST00000390606 C21orf59P57076 290 aa22.22■■□□□ 1.15
IGHV3-20-201ENST00000390606 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
IGHV3-20-201ENST00000390606 STAT4Q14765 748 aa22.22■■□□□ 1.15
IGHV3-20-201ENST00000390606 RALGPS1Q5JS13 557 aa22.22■■□□□ 1.15
IGHV3-20-201ENST00000390606 ALG1LQ6GMV1 187 aa22.22■■□□□ 1.15
IGHV3-20-201ENST00000390606 IQCHQ86VS3 1027 aa22.22■■□□□ 1.15
IGHV3-20-201ENST00000390606 CCDC13Q8IYE1 715 aa22.22■■□□□ 1.15
IGHV3-20-201ENST00000390606 RCOR2Q8IZ40 523 aa22.22■■□□□ 1.15
IGHV3-20-201ENST00000390606 SPOCK2Q92563 424 aa22.22■■□□□ 1.15
IGHV3-20-201ENST00000390606 LGMNQ99538 433 aa22.22■■□□□ 1.15
IGHV3-20-201ENST00000390606 MYOCQ99972 504 aa22.22■■□□□ 1.15
IGHV3-20-201ENST00000390606 NT5MQ9NPB1 228 aa22.22■■□□□ 1.15
IGHV3-20-201ENST00000390606 PCDH12Q9NPG4 1184 aa22.22■■□□□ 1.15
IGHV3-20-201ENST00000390606 SCUBE2Q9NQ36 999 aa22.22■■□□□ 1.15
IGHV3-20-201ENST00000390606 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
IGHV3-20-201ENST00000390606 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa22.21■■□□□ 1.15
IGHV3-20-201ENST00000390606 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
IGHV3-20-201ENST00000390606 TLR4O00206 839 aa22.21■■□□□ 1.15
IGHV3-20-201ENST00000390606 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
IGHV3-20-201ENST00000390606 RAD51BO15315 384 aa22.21■■□□□ 1.15
IGHV3-20-201ENST00000390606 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP22.21■■□□□ 1.15
IGHV3-20-201ENST00000390606 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
IGHV3-20-201ENST00000390606 ZNF883P0CG24 379 aa22.21■■□□□ 1.15
IGHV3-20-201ENST00000390606 CCNB1P14635 433 aa22.21■■□□□ 1.15
IGHV3-20-201ENST00000390606 NXPH1P58417 271 aa22.21■■□□□ 1.15
IGHV3-20-201ENST00000390606 DYNLT1P63172 113 aa22.21■■□□□ 1.15
IGHV3-20-201ENST00000390606 ADCY2Q08462 1091 aa22.21■■□□□ 1.15
IGHV3-20-201ENST00000390606 KIF5AQ12840 1032 aa22.21■■□□□ 1.15
IGHV3-20-201ENST00000390606 LLGL1Q15334 1064 aa22.21■■□□□ 1.15
IGHV3-20-201ENST00000390606 ZNF423Q2M1K9 1284 aa22.21■■□□□ 1.15
IGHV3-20-201ENST00000390606 TMEM52BQ4KMG9 183 aa22.21■■□□□ 1.15
IGHV3-20-201ENST00000390606 SLC45A4Q5BKX6 768 aa22.21■■□□□ 1.15
IGHV3-20-201ENST00000390606 CFAP58Q5T655 872 aa22.21■■□□□ 1.15
IGHV3-20-201ENST00000390606 PIP4P1Q86T03 277 aa22.21■■□□□ 1.15
IGHV3-20-201ENST00000390606 EXD1Q8NHP7 514 aa22.21■■□□□ 1.15
IGHV3-20-201ENST00000390606 KIAA1524Q8TCG1 905 aa22.21■■□□□ 1.15
IGHV3-20-201ENST00000390606 ASB12Q8WXK4 309 aa22.21■■□□□ 1.15
IGHV3-20-201ENST00000390606 SKA1Q96BD8 255 aa22.21■■□□□ 1.15
IGHV3-20-201ENST00000390606 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
IGHV3-20-201ENST00000390606 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
IGHV3-20-201ENST00000390606 GRPEL1Q9HAV7 217 aa22.21■■□□□ 1.15
IGHV3-20-201ENST00000390606 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP22.21■■□□□ 1.15
IGHV3-20-201ENST00000390606 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa22.21■■□□□ 1.15
IGHV3-20-201ENST00000390606 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP22.21■■□□□ 1.15
IGHV3-20-201ENST00000390606 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa22.21■■□□□ 1.15
IGHV3-20-201ENST00000390606 ADGRG1Q9Y653 693 aa22.21■■□□□ 1.15
IGHV3-20-201ENST00000390606 DNAH14Q0VDD8 3507 aa22.2■■□□□ 1.15
IGHV3-20-201ENST00000390606 ANKRD36A6QL64 1941 aa22.2■■□□□ 1.14
IGHV3-20-201ENST00000390606 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa22.2■■□□□ 1.14
IGHV3-20-201ENST00000390606 MACROD2A1Z1Q3 448 aa22.2■■□□□ 1.14
IGHV3-20-201ENST00000390606 H0Y8X5 98 aa22.2■■□□□ 1.14
IGHV3-20-201ENST00000390606 CST8O60676 142 aa22.2■■□□□ 1.14
IGHV3-20-201ENST00000390606 SOCS5O75159 536 aa22.2■■□□□ 1.14
IGHV3-20-201ENST00000390606 PRKCGP05129 697 aa22.2■■□□□ 1.14
IGHV3-20-201ENST00000390606 XPAP23025 273 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
IGHV3-20-201ENST00000390606 CTNNA2P26232 953 aa22.2■■□□□ 1.14
IGHV3-20-201ENST00000390606 AKT2P31751 481 aa22.2■■□□□ 1.14
IGHV3-20-201ENST00000390606 ELP6Q0PNE2 266 aa22.2■■□□□ 1.14
IGHV3-20-201ENST00000390606 OVGP1Q12889 678 aa22.2■■□□□ 1.14
IGHV3-20-201ENST00000390606 TRAF2Q12933 501 aa22.2■■□□□ 1.14
IGHV3-20-201ENST00000390606 SLC14A1Q13336 389 aa22.2■■□□□ 1.14
IGHV3-20-201ENST00000390606 TFDP2Q14188 446 aa22.2■■□□□ 1.14
IGHV3-20-201ENST00000390606 IHHQ14623 411 aa22.2■■□□□ 1.14
IGHV3-20-201ENST00000390606 TFDP3Q5H9I0 405 aa22.2■■□□□ 1.14
IGHV3-20-201ENST00000390606 GCNT7Q6ZNI0 430 aa22.2■■□□□ 1.14
IGHV3-20-201ENST00000390606 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
IGHV3-20-201ENST00000390606 TXLNBQ8N3L3 684 aa22.2■■□□□ 1.14
IGHV3-20-201ENST00000390606 CCNYQ8ND76 341 aa22.2■■□□□ 1.14
IGHV3-20-201ENST00000390606 TM7SF3Q9NS93 570 aa22.2■■□□□ 1.14
IGHV3-20-201ENST00000390606 AMACRQ9UHK6 382 aa22.2■■□□□ 1.14
IGHV3-20-201ENST00000390606 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa22.2■■□□□ 1.14
IGHV3-20-201ENST00000390606 ARHGAP6O43182 974 aa22.19■■□□□ 1.14
IGHV3-20-201ENST00000390606 MMP20O60882 483 aa22.19■■□□□ 1.14
IGHV3-20-201ENST00000390606 HLA-DQB2P05538 268 aa22.19■■□□□ 1.14
IGHV3-20-201ENST00000390606 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
IGHV3-20-201ENST00000390606 CSRP1P21291 193 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
IGHV3-20-201ENST00000390606 MMP12P39900 470 aa22.19■■□□□ 1.14
IGHV3-20-201ENST00000390606 PEX5P50542 639 aa22.19■■□□□ 1.14
IGHV3-20-201ENST00000390606 CLDN2P57739 230 aa22.19■■□□□ 1.14
IGHV3-20-201ENST00000390606 PDK1Q15118 436 aa22.19■■□□□ 1.14
IGHV3-20-201ENST00000390606 PPP2R5EQ16537 467 aa22.19■■□□□ 1.14
IGHV3-20-201ENST00000390606 KAZNQ674X7 775 aa22.19■■□□□ 1.14
IGHV3-20-201ENST00000390606 ERMP1Q7Z2K6 904 aa22.19■■□□□ 1.14
IGHV3-20-201ENST00000390606 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa22.19■■□□□ 1.14
IGHV3-20-201ENST00000390606 NT5DC3Q86UY8 548 aa22.19■■□□□ 1.14
IGHV3-20-201ENST00000390606 CCDC112Q8NEF3 446 aa22.19■■□□□ 1.14
IGHV3-20-201ENST00000390606 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
IGHV3-20-201ENST00000390606 BMFQ96LC9 184 aa22.19■■□□□ 1.14
IGHV3-20-201ENST00000390606 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
IGHV3-20-201ENST00000390606 IL12RB2Q99665 862 aa22.19■■□□□ 1.14
IGHV3-20-201ENST00000390606 SEMA3CQ99985 751 aa22.19■■□□□ 1.14
IGHV3-20-201ENST00000390606 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
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