RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000388948.7

LRRK1-201, Transcript of leucine rich repeat kinase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene LRRK1, Length 7,671 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRK1-201ENST00000388948 ACP6Q9NPH0 428 aa14.95□□□□□ -0.02
LRRK1-201ENST00000388948 CHKBQ9Y259 395 aa14.95□□□□□ -0.02
LRRK1-201ENST00000388948 FASP25445 335 aa14.95□□□□□ -0.02
LRRK1-201ENST00000388948 TMEM164Q5U3C3 297 aa14.95□□□□□ -0.02
LRRK1-201ENST00000388948 CHSY3Q70JA7 882 aa14.95□□□□□ -0.02
LRRK1-201ENST00000388948 TIFAQ96CG3 184 aa14.95□□□□□ -0.02
LRRK1-201ENST00000388948 KLHL5Q96PQ7 755 aa14.95□□□□□ -0.02
LRRK1-201ENST00000388948 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa14.95□□□□□ -0.02
LRRK1-201ENST00000388948 ULK1O75385 1050 aa14.95□□□□□ -0.02
LRRK1-201ENST00000388948 RPL3P39023 403 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
LRRK1-201ENST00000388948 CXCR3P49682 368 aa14.95□□□□□ -0.02
LRRK1-201ENST00000388948 NAB1Q13506 487 aa14.95□□□□□ -0.02
LRRK1-201ENST00000388948 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
LRRK1-201ENST00000388948 ZNF354BQ96LW1 612 aa14.95□□□□□ -0.02
LRRK1-201ENST00000388948 TNKS2Q9H2K2 1166 aa14.95□□□□□ -0.02
LRRK1-201ENST00000388948 STMN3Q9NZ72 180 aa14.95□□□□□ -0.02
LRRK1-201ENST00000388948 TAGLN3Q9UI15 199 aa14.95□□□□□ -0.02
LRRK1-201ENST00000388948 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa14.95□□□□□ -0.02
LRRK1-201ENST00000388948 ARL5CA6NH57 179 aa14.95□□□□□ -0.02
LRRK1-201ENST00000388948 CYP3A7P24462 503 aa14.95□□□□□ -0.02
LRRK1-201ENST00000388948 XKR4Q5GH76 650 aa14.95□□□□□ -0.02
LRRK1-201ENST00000388948 SRLQ86TD4 932 aa14.95□□□□□ -0.02
LRRK1-201ENST00000388948 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
LRRK1-201ENST00000388948 ATG13O75143 517 aa14.95□□□□□ -0.02
LRRK1-201ENST00000388948 SSR2P43308 183 aa14.95□□□□□ -0.02
LRRK1-201ENST00000388948 RTP1P59025 263 aa14.95□□□□□ -0.02
LRRK1-201ENST00000388948 CAP1Q01518 475 aa14.95□□□□□ -0.02
LRRK1-201ENST00000388948 GAD2Q05329 585 aa14.95□□□□□ -0.02
LRRK1-201ENST00000388948 FNBP1LQ5T0N5 605 aa14.95□□□□□ -0.02
LRRK1-201ENST00000388948 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa14.95□□□□□ -0.02
LRRK1-201ENST00000388948 KATNAL2Q8IYT4 538 aa14.95□□□□□ -0.02
LRRK1-201ENST00000388948 DNAJC9Q8WXX5 260 aa14.95□□□□□ -0.02
LRRK1-201ENST00000388948 RNF145Q96MT1 663 aa14.95□□□□□ -0.02
LRRK1-201ENST00000388948 UGT2B28Q9BY64 529 aa14.95□□□□□ -0.02
LRRK1-201ENST00000388948 LACRTQ9GZZ8 138 aa14.95□□□□□ -0.02
LRRK1-201ENST00000388948 INSL6Q9Y581 213 aa14.95□□□□□ -0.02
LRRK1-201ENST00000388948 GPR25O00155 361 aa14.95□□□□□ -0.02
LRRK1-201ENST00000388948 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP14.95□□□□□ -0.02
LRRK1-201ENST00000388948 ANXA6P08133 673 aa14.95□□□□□ -0.02
LRRK1-201ENST00000388948 PTPN9P43378 593 aa14.95□□□□□ -0.02
LRRK1-201ENST00000388948 APLP1P51693 650 aa14.95□□□□□ -0.02
LRRK1-201ENST00000388948 NEK3P51956 506 aa14.95□□□□□ -0.02
LRRK1-201ENST00000388948 LPIN1Q14693 890 aa14.95□□□□□ -0.02
LRRK1-201ENST00000388948 RCN1Q15293 331 aa14.95□□□□□ -0.02
LRRK1-201ENST00000388948 DEFB107AQ8IZN7 70 aa14.95□□□□□ -0.02
LRRK1-201ENST00000388948 THAP1Q9NVV9 213 aa14.95□□□□□ -0.02
LRRK1-201ENST00000388948 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa14.94□□□□□ -0.02
LRRK1-201ENST00000388948 SLC5A3P53794 718 aa14.94□□□□□ -0.02
LRRK1-201ENST00000388948 TBC1D25Q3MII6 688 aa14.94□□□□□ -0.02
LRRK1-201ENST00000388948 UNC5AQ6ZN44 842 aa14.94□□□□□ -0.02
LRRK1-201ENST00000388948 OR4L1Q8NH43 312 aa14.94□□□□□ -0.02
LRRK1-201ENST00000388948 TCP10LQ8TDR4 215 aa14.94□□□□□ -0.02
LRRK1-201ENST00000388948 HAS1Q92839 578 aa14.94□□□□□ -0.02
LRRK1-201ENST00000388948 HDHD2Q9H0R4 259 aa14.94□□□□□ -0.02
LRRK1-201ENST00000388948 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
LRRK1-201ENST00000388948 KIF1AQ12756 1690 aa14.94□□□□□ -0.02
LRRK1-201ENST00000388948 TPP1O14773 563 aa14.94□□□□□ -0.02
LRRK1-201ENST00000388948 SCAMP1O15126 338 aa14.94□□□□□ -0.02
LRRK1-201ENST00000388948 TSNQ15631 228 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
LRRK1-201ENST00000388948 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa14.94□□□□□ -0.02
LRRK1-201ENST00000388948 RFWD3Q6PCD5 774 aa14.94□□□□□ -0.02
LRRK1-201ENST00000388948 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa14.94□□□□□ -0.02
LRRK1-201ENST00000388948 IZUMO1Q8IYV9 350 aa14.94□□□□□ -0.02
LRRK1-201ENST00000388948 SYN3O14994 580 aa14.94□□□□□ -0.02
LRRK1-201ENST00000388948 MATN4O95460 622 aa14.94□□□□□ -0.02
LRRK1-201ENST00000388948 CDK16Q00536 496 aa14.94□□□□□ -0.02
LRRK1-201ENST00000388948 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
LRRK1-201ENST00000388948 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
LRRK1-201ENST00000388948 AMZ1Q400G9 498 aa14.94□□□□□ -0.02
LRRK1-201ENST00000388948 HYIQ5T013 277 aa14.94□□□□□ -0.02
LRRK1-201ENST00000388948 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
LRRK1-201ENST00000388948 POMZP3Q6PJE2 187 aa14.94□□□□□ -0.02
LRRK1-201ENST00000388948 FAM220AQ7Z4H9 259 aa14.94□□□□□ -0.02
LRRK1-201ENST00000388948 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
LRRK1-201ENST00000388948 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
LRRK1-201ENST00000388948 FGF1P05230 155 aa14.94□□□□□ -0.02
LRRK1-201ENST00000388948 CLCN5P51795 746 aa14.94□□□□□ -0.02
LRRK1-201ENST00000388948 ASZ1Q8WWH4 475 aa14.94□□□□□ -0.02
LRRK1-201ENST00000388948 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
LRRK1-201ENST00000388948 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa14.94□□□□□ -0.02
LRRK1-201ENST00000388948 CLUHO75153 1309 aa14.94□□□□□ -0.02
LRRK1-201ENST00000388948 IRS2Q9Y4H2 1338 aa14.94□□□□□ -0.02
LRRK1-201ENST00000388948 MLYCDO95822 493 aa14.94□□□□□ -0.02
LRRK1-201ENST00000388948 PRLRP16471 622 aa14.94□□□□□ -0.02
LRRK1-201ENST00000388948 ACLYP53396 1101 aa14.94□□□□□ -0.02
LRRK1-201ENST00000388948 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP14.94□□□□□ -0.02
LRRK1-201ENST00000388948 HDAC10Q969S8 669 aa14.94□□□□□ -0.02
LRRK1-201ENST00000388948 KCNN2Q9H2S1 579 aa14.94□□□□□ -0.02
LRRK1-201ENST00000388948 EPS8L2Q9H6S3 715 aa14.94□□□□□ -0.02
LRRK1-201ENST00000388948 TBC1D23Q9NUY8 699 aa14.94□□□□□ -0.02
LRRK1-201ENST00000388948 TMEM216Q9P0N5 145 aa14.94□□□□□ -0.02
LRRK1-201ENST00000388948 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
LRRK1-201ENST00000388948 SAC3D1A6NKF1 404 aa14.94□□□□□ -0.02
LRRK1-201ENST00000388948 ADRA1DP25100 572 aa14.94□□□□□ -0.02
LRRK1-201ENST00000388948 CYP4F2P78329 520 aa14.94□□□□□ -0.02
LRRK1-201ENST00000388948 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
LRRK1-201ENST00000388948 ABHD15Q6UXT9 468 aa14.94□□□□□ -0.02
LRRK1-201ENST00000388948 EPS8L1Q8TE68 723 aa14.94□□□□□ -0.02
LRRK1-201ENST00000388948 INAQ16352 499 aa14.93□□□□□ -0.02
LRRK1-201ENST00000388948 CRY2Q49AN0 593 aa14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.9 ms