RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000372616.1

CTPS1-201, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CTPS1, Length 2,037 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-201ENST00000372616 CARM1Q86X55 608 aa7.27□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 BRSK2Q8IWQ3 736 aa7.27□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 DEPTORQ8TB45 409 aa7.27□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 AFG1LQ8WV93 481 aa7.27□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 MCRS1Q96EZ8 462 aa7.27□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 PLPPR2Q96GM1 343 aa7.27□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 FAR2Q96K12 515 aa7.27□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 SIGLEC10Q96LC7 697 aa7.27□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 PCYT2Q99447 389 aa7.27□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 SORT1Q99523 831 aa7.27□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 TUBA1CQ9BQE3 449 aa7.27□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 TRIM15Q9C019 465 aa7.27□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 C20orf27Q9GZN8 174 aa7.27□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 AP5M1Q9H0R1 490 aa7.27□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 COG4Q9H9E3 785 aa7.27□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa7.27□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 SAGE1Q9NXZ1 904 aa7.27□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 RAP2CQ9Y3L5 183 aa7.27□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 LOC100653049A0A140TA62 436 aa7.27□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 TRPC5OSA6NMA1 111 aa7.27□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 H3BSA7 217 aa7.27□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 AP3B1O00203 1094 aa7.27□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF195O14628 629 aa7.27□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 MDM4O15151 490 aa7.27□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 TIMM44O43615 452 aa7.27□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 KPNA6O60684 536 aa7.27□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 TRIM13O60858 407 aa7.27□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 KRT34O76011 436 aa7.27□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 ERBB2P04626 1255 aa7.27□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 LGALS2P05162 132 aa7.27□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 POLBP06746 335 aa7.27□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 P4HA1P13674 534 aa7.27□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 AKR1A1P14550 325 aa7.27□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 PIK3R1P27986 724 aa7.27□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 TYK2P29597 1187 aa7.27□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 SPRP35270 261 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 SERPINB5P36952 375 aa7.27□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 EFNA5P52803 228 aa7.27□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 PRMT2P55345 433 aa7.27□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 PRKAA1Q13131 559 aa7.27□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 BMPR2Q13873 1038 aa7.27□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 IKBKEQ14164 716 aa7.27□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 C16orf72Q14CZ0 275 aa7.27□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 STILQ15468 1287 aa7.27□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 SPATS1Q496A3 300 aa7.27□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 KCNT1Q5JUK3 1230 aa7.27□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 SPANXN3Q5MJ09 141 aa7.27□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 SLC9A4Q6AI14 798 aa7.27□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 OVOS1Q6IE37 1185 aa7.27□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 SPOPLQ6IQ16 392 aa7.27□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 LINC00299Q6ZSB3 139 aa7.27□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa7.27□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 GPR180Q86V85 440 aa7.27□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 THNSL2Q86YJ6 484 aa7.27□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 C10orf107Q8IVU9 208 aa7.27□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 GIPC3Q8TF64 312 aa7.27□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 HSPH1Q92598 858 aa7.27□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 COPS5Q92905 334 aa7.27□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 NRBF2Q96F24 287 aa7.27□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 ABHD8Q96I13 439 aa7.27□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF778Q96MU6 729 aa7.27□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 CDRT15Q96T59 188 aa7.27□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 ADPGKQ9BRR6 497 aa7.27□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 WDR41Q9HAD4 459 aa7.27□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 CD320Q9NPF0 282 aa7.27□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP7.27□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 GID8Q9NWU2 228 aa7.27□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 REV1Q9UBZ9 1251 aa7.27□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 KLHL3Q9UH77 587 aa7.27□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 KIAA1257Q9ULG3 409 aa7.27□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa7.27□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF711Q9Y462 761 aa7.27□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa7.27□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 SLC35F4A4IF30 521 aa7.26□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 RRN3P2A6NIE6 340 aa7.26□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 GFRA2O00451 464 aa7.26□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 TPP1O14773 563 aa7.26□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 AIM2O14862 343 aa7.26□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 SUPT3HO75486 399 aa7.26□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 PIAS1O75925 651 aa7.26□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 GSRP00390 522 aa7.26□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 TNNC2P02585 160 aa7.26□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 HMGCRP04035 888 aa7.26□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 MMP3P08254 477 aa7.26□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 OCM2P0CE71 109 aa7.26□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 OCMP0CE72 109 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61.8 ms