RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368078.7

CASQ1-201, Transcript of calsequestrin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CASQ1, Length 1,897 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1-201ENST00000368078 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
CASQ1-201ENST00000368078 SRLQ86TD4 932 aa15.48■□□□□ 0.07
CASQ1-201ENST00000368078 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
CASQ1-201ENST00000368078 OR13J1Q8NGT2 312 aa15.48■□□□□ 0.07
CASQ1-201ENST00000368078 ACDQ96AP0 544 aa15.48■□□□□ 0.07
CASQ1-201ENST00000368078 RMDN1Q96DB5 314 aa15.48■□□□□ 0.07
CASQ1-201ENST00000368078 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
CASQ1-201ENST00000368078 ZFYVE19Q96K21 471 aa15.48■□□□□ 0.07
CASQ1-201ENST00000368078 RANBP9Q96S59 729 aa15.48■□□□□ 0.07
CASQ1-201ENST00000368078 CCT8L2Q96SF2 557 aa15.48■□□□□ 0.07
CASQ1-201ENST00000368078 CPNE1Q99829 537 aa15.48■□□□□ 0.07
CASQ1-201ENST00000368078 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
CASQ1-201ENST00000368078 TBC1D14Q9P2M4 693 aa15.48■□□□□ 0.07
CASQ1-201ENST00000368078 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
CASQ1-201ENST00000368078 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
CASQ1-201ENST00000368078 UNC80Q8N2C7 3258 aa15.48■□□□□ 0.07
CASQ1-201ENST00000368078 MROH6A6NGR9 719 aa15.47■□□□□ 0.07
CASQ1-201ENST00000368078 AHSGP02765 367 aa15.47■□□□□ 0.07
CASQ1-201ENST00000368078 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
CASQ1-201ENST00000368078 FGF1P05230 155 aa15.47■□□□□ 0.07
CASQ1-201ENST00000368078 HLA-DPA1P20036 260 aa15.47■□□□□ 0.07
CASQ1-201ENST00000368078 WEE1P30291 646 aa15.47■□□□□ 0.07
CASQ1-201ENST00000368078 FOXN2P32314 431 aa15.47■□□□□ 0.07
CASQ1-201ENST00000368078 GP5P40197 560 aa15.47■□□□□ 0.07
CASQ1-201ENST00000368078 ARSDP51689 593 aa15.47■□□□□ 0.07
CASQ1-201ENST00000368078 PLK1P53350 603 aa15.47■□□□□ 0.07
CASQ1-201ENST00000368078 MPP1Q00013 466 aa15.47■□□□□ 0.07
CASQ1-201ENST00000368078 TCEAL5Q5H9L2 206 aa15.47■□□□□ 0.07
CASQ1-201ENST00000368078 PPM1JQ5JR12 505 aa15.47■□□□□ 0.07
CASQ1-201ENST00000368078 GRTP1Q5TC63 336 aa15.47■□□□□ 0.07
CASQ1-201ENST00000368078 ZNF449Q6P9G9 518 aa15.47■□□□□ 0.07
CASQ1-201ENST00000368078 FOXR1Q6PIV2 292 aa15.47■□□□□ 0.07
CASQ1-201ENST00000368078 LVRNQ6Q4G3 990 aa15.47■□□□□ 0.07
CASQ1-201ENST00000368078 NPAS3Q8IXF0 933 aa15.47■□□□□ 0.07
CASQ1-201ENST00000368078 MDGA1Q8NFP4 955 aa15.47■□□□□ 0.07
CASQ1-201ENST00000368078 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
CASQ1-201ENST00000368078 CKAP2Q8WWK9 683 aa15.47■□□□□ 0.07
CASQ1-201ENST00000368078 FGF13Q92913 245 aa15.47■□□□□ 0.07
CASQ1-201ENST00000368078 RBBP8Q99708 897 aa15.47■□□□□ 0.07
CASQ1-201ENST00000368078 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
CASQ1-201ENST00000368078 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
CASQ1-201ENST00000368078 TXNDC16Q9P2K2 825 aa15.47■□□□□ 0.07
CASQ1-201ENST00000368078 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
CASQ1-201ENST00000368078 GGT7Q9UJ14 662 aa15.47■□□□□ 0.07
CASQ1-201ENST00000368078 OR51F1A6NGY5 319 aa15.46■□□□□ 0.07
CASQ1-201ENST00000368078 TPP1O14773 563 aa15.46■□□□□ 0.07
CASQ1-201ENST00000368078 PAPLNO95428 1278 aa15.46■□□□□ 0.07
CASQ1-201ENST00000368078 CES1P23141 567 aa15.46■□□□□ 0.07
CASQ1-201ENST00000368078 SP100P23497 879 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
CASQ1-201ENST00000368078 FSHRP23945 695 aa15.46■□□□□ 0.07
CASQ1-201ENST00000368078 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP15.46■□□□□ 0.07
CASQ1-201ENST00000368078 NAB1Q13506 487 aa15.46■□□□□ 0.07
CASQ1-201ENST00000368078 QPCTQ16769 361 aa15.46■□□□□ 0.07
CASQ1-201ENST00000368078 TMEM215Q68D42 235 aa15.46■□□□□ 0.07
CASQ1-201ENST00000368078 FSTL4Q6MZW2 842 aa15.46■□□□□ 0.07
CASQ1-201ENST00000368078 SYCE2Q6PIF2 218 aa15.46■□□□□ 0.07
CASQ1-201ENST00000368078 TIFABQ6ZNK6 161 aa15.46■□□□□ 0.07
CASQ1-201ENST00000368078 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
CASQ1-201ENST00000368078 CAMK1DQ8IU85 385 aa15.46■□□□□ 0.07
CASQ1-201ENST00000368078 NDUFAF2Q8N183 169 aa15.46■□□□□ 0.07
CASQ1-201ENST00000368078 DCLK2Q8N568 766 aa15.46■□□□□ 0.07
CASQ1-201ENST00000368078 LPCAT1Q8NF37 534 aa15.46■□□□□ 0.07
CASQ1-201ENST00000368078 HDAC10Q969S8 669 aa15.46■□□□□ 0.07
CASQ1-201ENST00000368078 TIFAQ96CG3 184 aa15.46■□□□□ 0.07
CASQ1-201ENST00000368078 MTBPQ96DY7 904 aa15.46■□□□□ 0.07
CASQ1-201ENST00000368078 ASIC4Q96FT7 647 aa15.46■□□□□ 0.07
CASQ1-201ENST00000368078 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
CASQ1-201ENST00000368078 MCMBPQ9BTE3 642 aa15.46■□□□□ 0.07
CASQ1-201ENST00000368078 CAB39LQ9H9S4 337 aa15.46■□□□□ 0.07
CASQ1-201ENST00000368078 PCMTD2Q9NV79 361 aa15.46■□□□□ 0.07
CASQ1-201ENST00000368078 HAUS2Q9NVX0 235 aa15.46■□□□□ 0.07
CASQ1-201ENST00000368078 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
CASQ1-201ENST00000368078 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP15.46■□□□□ 0.07
CASQ1-201ENST00000368078 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa15.46■□□□□ 0.07
CASQ1-201ENST00000368078 WDR91A4D1P6 747 aa15.46■□□□□ 0.06
CASQ1-201ENST00000368078 SRCP12931 536 aa15.46■□□□□ 0.06
CASQ1-201ENST00000368078 TCF3P15923 654 aa15.46■□□□□ 0.06
CASQ1-201ENST00000368078 ABL2P42684 1182 aa15.46■□□□□ 0.06
CASQ1-201ENST00000368078 NEK3P51956 506 aa15.46■□□□□ 0.06
CASQ1-201ENST00000368078 SLC18A1P54219 525 aa15.46■□□□□ 0.06
CASQ1-201ENST00000368078 PDE1BQ01064 536 aa15.46■□□□□ 0.06
CASQ1-201ENST00000368078 DHCR24Q15392 516 aa15.46■□□□□ 0.06
CASQ1-201ENST00000368078 CMC1Q7Z7K0 106 aa15.46■□□□□ 0.06
CASQ1-201ENST00000368078 SPNS2Q8IVW8 549 aa15.46■□□□□ 0.06
CASQ1-201ENST00000368078 LRRC34Q8IZ02 419 aa15.46■□□□□ 0.06
CASQ1-201ENST00000368078 OR13C4Q8NGS5 318 aa15.46■□□□□ 0.06
CASQ1-201ENST00000368078 BRSK1Q8TDC3 778 aa15.46■□□□□ 0.06
CASQ1-201ENST00000368078 PTPRN2Q92932 1015 aa15.46■□□□□ 0.06
CASQ1-201ENST00000368078 TBATAQ96M53 351 aa15.46■□□□□ 0.06
CASQ1-201ENST00000368078 ASB16Q96NS5 453 aa15.46■□□□□ 0.06
CASQ1-201ENST00000368078 GGA2Q9UJY4 613 aa15.46■□□□□ 0.06
CASQ1-201ENST00000368078 EYSQ5T1H1 3165 aa15.45■□□□□ 0.06
CASQ1-201ENST00000368078 ANKRD66B4E2M5 251 aa15.45■□□□□ 0.06
CASQ1-201ENST00000368078 COPEO14579 308 aa15.45■□□□□ 0.06
CASQ1-201ENST00000368078 BNIP3LO60238 219 aa15.45■□□□□ 0.06
CASQ1-201ENST00000368078 PIGNO95427 931 aa15.45■□□□□ 0.06
CASQ1-201ENST00000368078 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
CASQ1-201ENST00000368078 CNTFP26441 200 aa15.45■□□□□ 0.06
CASQ1-201ENST00000368078 SPRP35270 261 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
CASQ1-201ENST00000368078 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.1 ms