RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361543.3

SGMS1-201, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SGMS1, Length 1,096 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-201ENST00000361543 SPA17Q15506 151 aa7.75□□□□□ -1.17
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SGMS1-201ENST00000361543 CCDC122Q5T0U0 273 aa7.75□□□□□ -1.17
SGMS1-201ENST00000361543 AFMIDQ63HM1 303 aa7.75□□□□□ -1.17
SGMS1-201ENST00000361543 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP7.75□□□□□ -1.17
SGMS1-201ENST00000361543 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa7.75□□□□□ -1.17
SGMS1-201ENST00000361543 H2AFVQ71UI9 128 aa7.75□□□□□ -1.17
SGMS1-201ENST00000361543 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa7.75□□□□□ -1.17
SGMS1-201ENST00000361543 TTC7BQ86TV6 843 aa7.75□□□□□ -1.17
SGMS1-201ENST00000361543 PARP9Q8IXQ6 854 aa7.75□□□□□ -1.17
SGMS1-201ENST00000361543 EID2Q8N6I1 236 aa7.75□□□□□ -1.17
SGMS1-201ENST00000361543 DENND6BQ8NEG7 585 aa7.75□□□□□ -1.17
SGMS1-201ENST00000361543 FAM174AQ8TBP5 190 aa7.75□□□□□ -1.17
SGMS1-201ENST00000361543 TEKT4Q8WW24 435 aa7.75□□□□□ -1.17
SGMS1-201ENST00000361543 BTBD6Q96KE9 485 aa7.75□□□□□ -1.17
SGMS1-201ENST00000361543 CNDP2Q96KP4 475 aaKnown RBP7.75□□□□□ -1.17
SGMS1-201ENST00000361543 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa7.75□□□□□ -1.17
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SGMS1-201ENST00000361543 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP7.75□□□□□ -1.17
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SGMS1-201ENST00000361543 IP6K2Q9UHH9 426 aa7.75□□□□□ -1.17
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SGMS1-201ENST00000361543 NENFQ9UMX5 172 aa7.75□□□□□ -1.17
SGMS1-201ENST00000361543 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP7.74□□□□□ -1.17
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SGMS1-201ENST00000361543 FAM221BA6H8Z2 402 aa7.74□□□□□ -1.17
SGMS1-201ENST00000361543 POM121BA6NF01 834 aa7.74□□□□□ -1.17
SGMS1-201ENST00000361543 MYO1FO00160 1098 aa7.74□□□□□ -1.17
SGMS1-201ENST00000361543 ENC1O14682 589 aa7.74□□□□□ -1.17
SGMS1-201ENST00000361543 FPGTO14772 594 aa7.74□□□□□ -1.17
SGMS1-201ENST00000361543 RAD51BO15315 384 aa7.74□□□□□ -1.17
SGMS1-201ENST00000361543 PALMO75781 387 aa7.74□□□□□ -1.17
SGMS1-201ENST00000361543 LDOC1O95751 146 aaPredicted RBP7.74□□□□□ -1.17
SGMS1-201ENST00000361543 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP7.74□□□□□ -1.17
SGMS1-201ENST00000361543 RARAP10276 462 aa7.74□□□□□ -1.17
SGMS1-201ENST00000361543 XPAP23025 273 aaPredicted RBP7.74□□□□□ -1.17
SGMS1-201ENST00000361543 SERPINA4P29622 427 aa7.74□□□□□ -1.17
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SGMS1-201ENST00000361543 Q6ZSR6 202 aa7.74□□□□□ -1.17
SGMS1-201ENST00000361543 POLNQ7Z5Q5 900 aa7.74□□□□□ -1.17
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SGMS1-201ENST00000361543 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa7.74□□□□□ -1.17
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SGMS1-201ENST00000361543 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa7.74□□□□□ -1.17
SGMS1-201ENST00000361543 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa7.74□□□□□ -1.17
SGMS1-201ENST00000361543 PCDH18Q9HCL0 1135 aa7.74□□□□□ -1.17
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SGMS1-201ENST00000361543 ETNK2Q9NVF9 386 aa7.74□□□□□ -1.17
SGMS1-201ENST00000361543 KLHL11Q9NVR0 708 aa7.74□□□□□ -1.17
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SGMS1-201ENST00000361543 MMP20O60882 483 aa7.73□□□□□ -1.17
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SGMS1-201ENST00000361543 SERPINB6P35237 376 aa7.73□□□□□ -1.17
SGMS1-201ENST00000361543 IGFALSP35858 605 aa7.73□□□□□ -1.17
SGMS1-201ENST00000361543 GJC1P36383 396 aa7.73□□□□□ -1.17
SGMS1-201ENST00000361543 MMP12P39900 470 aa7.73□□□□□ -1.17
SGMS1-201ENST00000361543 CSNK1DP48730 415 aa7.73□□□□□ -1.17
SGMS1-201ENST00000361543 ACADVLP49748 655 aa7.73□□□□□ -1.17
SGMS1-201ENST00000361543 CDH6P55285 790 aa7.73□□□□□ -1.17
SGMS1-201ENST00000361543 ELP6Q0PNE2 266 aa7.73□□□□□ -1.17
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