RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000340994.4

PKHD1-201, Transcript of PKHD1, fibrocystin/polyductin, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PKHD1, Length 11,589 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1-201ENST00000340994 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 VPS26BQ4G0F5 336 aa8.28□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 C10orf120Q5SQS8 335 aa8.28□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 ZZZ3Q8IYH5 903 aa8.28□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 A0A0A0MRY4 1105 aa8.28□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 PITPNM1O00562 1244 aa8.28□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 OTCP00480 354 aa8.28□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 BIKQ13323 160 aa8.28□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 AMIGO2Q86SJ2 522 aa8.28□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 SLC47A2Q86VL8 602 aa8.28□□□□□ -1.08
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PKHD1-201ENST00000340994 S100PBPQ96BU1 408 aa8.28□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 SIPA1Q96FS4 1042 aa8.28□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 SPATA13Q96N96 652 aa8.28□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 MMP19Q99542 508 aa8.28□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa8.28□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa8.28□□□□□ -1.08
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PKHD1-201ENST00000340994 SLC22A3O75751 556 aa8.27□□□□□ -1.08
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PKHD1-201ENST00000340994 TTPAP49638 278 aa8.27□□□□□ -1.08
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PKHD1-201ENST00000340994 HERC6Q8IVU3 1022 aa8.27□□□□□ -1.08
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PKHD1-201ENST00000340994 MTMR10Q9NXD2 777 aa8.27□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 ISPDA4D126 451 aa8.27□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 PRAMEF1O95521 474 aa8.27□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 FTH1P02794 183 aa8.27□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 PTPN3P26045 913 aa8.27□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 CDC25CP30307 473 aa8.27□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 GRIA4P48058 902 aa8.27□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 PGDP52209 483 aa8.27□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 TPTEP56180 551 aa8.27□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 LIPEQ05469 1076 aa8.27□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 ZBED5Q49AG3 693 aa8.27□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 TOP1MTQ969P6 601 aa8.27□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 PFDN5Q99471 154 aa8.27□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 CDH7Q9ULB5 785 aa8.27□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 RPTORQ8N122 1335 aa8.27□□□□□ -1.09
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PKHD1-201ENST00000340994 FADS2O95864 444 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
PKHD1-201ENST00000340994 MSR1P21757 451 aa8.27□□□□□ -1.09
PKHD1-201ENST00000340994 SLC25A3Q00325 362 aa8.27□□□□□ -1.09
PKHD1-201ENST00000340994 MAB21L1Q13394 359 aa8.27□□□□□ -1.09
PKHD1-201ENST00000340994 TCEA2Q15560 299 aa8.27□□□□□ -1.09
PKHD1-201ENST00000340994 ADNP2Q6IQ32 1131 aa8.27□□□□□ -1.09
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PKHD1-201ENST00000340994 CYP2A13Q16696 494 aa8.27□□□□□ -1.09
PKHD1-201ENST00000340994 SMU1Q2TAY7 513 aa8.27□□□□□ -1.09
PKHD1-201ENST00000340994 CRELD1Q96HD1 420 aa8.27□□□□□ -1.09
PKHD1-201ENST00000340994 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
PKHD1-201ENST00000340994 H7C4K7 107 aa8.27□□□□□ -1.09
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PKHD1-201ENST00000340994 FOSL1P15407 271 aa8.27□□□□□ -1.09
PKHD1-201ENST00000340994 CCR3P51677 355 aa8.27□□□□□ -1.09
PKHD1-201ENST00000340994 HUNKP57058 714 aa8.27□□□□□ -1.09
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PKHD1-201ENST00000340994 KAT5Q92993 513 aa8.27□□□□□ -1.09
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PKHD1-201ENST00000340994 CSH2P0DML3 217 aa8.27□□□□□ -1.09
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PKHD1-201ENST00000340994 DOK7Q18PE1 504 aa8.27□□□□□ -1.09
PKHD1-201ENST00000340994 C16orf86Q6ZW13 317 aa8.27□□□□□ -1.09
PKHD1-201ENST00000340994 HDDC3Q8N4P3 179 aa8.27□□□□□ -1.09
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PKHD1-201ENST00000340994 DPP3Q9NY33 737 aa8.27□□□□□ -1.09
PKHD1-201ENST00000340994 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa8.27□□□□□ -1.09
PKHD1-201ENST00000340994 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa8.27□□□□□ -1.09
PKHD1-201ENST00000340994 HOXC6P09630 235 aa8.27□□□□□ -1.09
PKHD1-201ENST00000340994 ITGA4P13612 1032 aa8.27□□□□□ -1.09
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