RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000340840.6

TRERF1-201, Transcript of transcriptional regulating factor 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TRERF1, Length 4,174 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRERF1-201ENST00000340840 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa9.5□□□□□ -0.89
TRERF1-201ENST00000340840 DYTNA2CJ06 578 aa9.5□□□□□ -0.89
TRERF1-201ENST00000340840 TMEM233B4DJY2 109 aa9.5□□□□□ -0.89
TRERF1-201ENST00000340840 GRID2O43424 1007 aa9.5□□□□□ -0.89
TRERF1-201ENST00000340840 CA12O43570 354 aa9.5□□□□□ -0.89
TRERF1-201ENST00000340840 CBFA2T3O75081 653 aa9.5□□□□□ -0.89
TRERF1-201ENST00000340840 SMIM18P0DKX4 95 aa9.5□□□□□ -0.89
TRERF1-201ENST00000340840 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
TRERF1-201ENST00000340840 C21orf59P57076 290 aa9.5□□□□□ -0.89
TRERF1-201ENST00000340840 ZNF460Q14592 562 aa9.5□□□□□ -0.89
TRERF1-201ENST00000340840 CYP51A1Q16850 503 aa9.5□□□□□ -0.89
TRERF1-201ENST00000340840 Q3C1V9 767 aa9.5□□□□□ -0.89
TRERF1-201ENST00000340840 PKDCCQ504Y2 493 aa9.5□□□□□ -0.89
TRERF1-201ENST00000340840 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
TRERF1-201ENST00000340840 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa9.5□□□□□ -0.89
TRERF1-201ENST00000340840 OTOP3Q7RTS5 596 aa9.5□□□□□ -0.89
TRERF1-201ENST00000340840 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
TRERF1-201ENST00000340840 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
TRERF1-201ENST00000340840 CLEC4FQ8N1N0 589 aa9.5□□□□□ -0.89
TRERF1-201ENST00000340840 BBS5Q8N3I7 341 aa9.5□□□□□ -0.89
TRERF1-201ENST00000340840 KLHL23Q8NBE8 558 aa9.5□□□□□ -0.89
TRERF1-201ENST00000340840 HEXDCQ8WVB3 486 aa9.5□□□□□ -0.89
TRERF1-201ENST00000340840 OSCP1Q8WVF1 389 aa9.5□□□□□ -0.89
TRERF1-201ENST00000340840 VPS50Q96JG6 964 aa9.5□□□□□ -0.89
TRERF1-201ENST00000340840 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
TRERF1-201ENST00000340840 COLEC11Q9BWP8 271 aa9.5□□□□□ -0.89
TRERF1-201ENST00000340840 SEPT3Q9UH03 358 aa9.5□□□□□ -0.89
TRERF1-201ENST00000340840 PRSS51A0A1B0GVH4 220 aa9.49□□□□□ -0.89
TRERF1-201ENST00000340840 ZNF195O14628 629 aa9.49□□□□□ -0.89
TRERF1-201ENST00000340840 GSRP00390 522 aa9.49□□□□□ -0.89
TRERF1-201ENST00000340840 IQCF3P0C7M6 154 aa9.49□□□□□ -0.89
TRERF1-201ENST00000340840 CKMT2P17540 419 aa9.49□□□□□ -0.89
TRERF1-201ENST00000340840 AXLP30530 894 aa9.49□□□□□ -0.89
TRERF1-201ENST00000340840 CYP2C18P33260 490 aa9.49□□□□□ -0.89
TRERF1-201ENST00000340840 SYPL2Q5VXT5 272 aa9.49□□□□□ -0.89
TRERF1-201ENST00000340840 WSCD1Q658N2 575 aa9.49□□□□□ -0.89
TRERF1-201ENST00000340840 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
TRERF1-201ENST00000340840 RNF111Q6ZNA4 994 aa9.49□□□□□ -0.89
TRERF1-201ENST00000340840 KIAA0408Q6ZU52 694 aa9.49□□□□□ -0.89
TRERF1-201ENST00000340840 CBR4Q8N4T8 237 aa9.49□□□□□ -0.89
TRERF1-201ENST00000340840 TOP6BLQ8N6T0 577 aa9.49□□□□□ -0.89
TRERF1-201ENST00000340840 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP9.49□□□□□ -0.89
TRERF1-201ENST00000340840 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
TRERF1-201ENST00000340840 ADNPQ9H2P0 1102 aa9.49□□□□□ -0.89
TRERF1-201ENST00000340840 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa9.49□□□□□ -0.89
TRERF1-201ENST00000340840 GLOD4Q9HC38 313 aa9.49□□□□□ -0.89
TRERF1-201ENST00000340840 C8orf4Q9NR00 106 aa9.49□□□□□ -0.89
TRERF1-201ENST00000340840 BLOC1S6Q9UL45 172 aa9.49□□□□□ -0.89
TRERF1-201ENST00000340840 ORC6Q9Y5N6 252 aa9.49□□□□□ -0.89
TRERF1-201ENST00000340840 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa9.49□□□□□ -0.89
TRERF1-201ENST00000340840 SDHDO14521 159 aa9.49□□□□□ -0.89
TRERF1-201ENST00000340840 CXCL11O14625 94 aa9.49□□□□□ -0.89
TRERF1-201ENST00000340840 HCRTO43612 131 aa9.49□□□□□ -0.89
TRERF1-201ENST00000340840 AHSGP02765 367 aa9.49□□□□□ -0.89
TRERF1-201ENST00000340840 SOX11P35716 441 aa9.49□□□□□ -0.89
TRERF1-201ENST00000340840 MOCOSQ96EN8 888 aa9.49□□□□□ -0.89
TRERF1-201ENST00000340840 PGLYRP2Q96PD5 576 aa9.49□□□□□ -0.89
TRERF1-201ENST00000340840 ALG9Q9H6U8 611 aa9.49□□□□□ -0.89
TRERF1-201ENST00000340840 MID1IP1Q9NPA3 183 aa9.49□□□□□ -0.89
TRERF1-201ENST00000340840 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa9.49□□□□□ -0.89
TRERF1-201ENST00000340840 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
TRERF1-201ENST00000340840 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
TRERF1-201ENST00000340840 NEMP2A6NFY4 417 aa9.49□□□□□ -0.89
TRERF1-201ENST00000340840 ZBTB42B2RXF5 422 aa9.49□□□□□ -0.89
TRERF1-201ENST00000340840 VILLO15195 856 aa9.49□□□□□ -0.89
TRERF1-201ENST00000340840 SNAP91O60641 907 aa9.49□□□□□ -0.89
TRERF1-201ENST00000340840 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
TRERF1-201ENST00000340840 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
TRERF1-201ENST00000340840 HCAR3P49019 387 aa9.49□□□□□ -0.89
TRERF1-201ENST00000340840 NDUFV1P49821 464 aa9.49□□□□□ -0.89
TRERF1-201ENST00000340840 NEDD8Q15843 81 aa9.49□□□□□ -0.89
TRERF1-201ENST00000340840 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
TRERF1-201ENST00000340840 CLYBLQ8N0X4 340 aa9.49□□□□□ -0.89
TRERF1-201ENST00000340840 GIPC3Q8TF64 312 aa9.49□□□□□ -0.89
TRERF1-201ENST00000340840 ROPN1LQ96C74 230 aa9.49□□□□□ -0.89
TRERF1-201ENST00000340840 FBXW11Q9UKB1 542 aa9.49□□□□□ -0.89
TRERF1-201ENST00000340840 TCAF1Q9Y4C2 921 aa9.49□□□□□ -0.89
TRERF1-201ENST00000340840 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa9.49□□□□□ -0.89
TRERF1-201ENST00000340840 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
TRERF1-201ENST00000340840 SUPT3HB4E1H0 165 aa9.49□□□□□ -0.89
TRERF1-201ENST00000340840 SNX2O60749 519 aa9.49□□□□□ -0.89
TRERF1-201ENST00000340840 SLC35E2BP0CK96 405 aa9.49□□□□□ -0.89
TRERF1-201ENST00000340840 LBPP18428 481 aa9.49□□□□□ -0.89
TRERF1-201ENST00000340840 SCNN1BP51168 640 aa9.49□□□□□ -0.89
TRERF1-201ENST00000340840 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
TRERF1-201ENST00000340840 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP9.49□□□□□ -0.89
TRERF1-201ENST00000340840 EML3Q32P44 896 aa9.49□□□□□ -0.89
TRERF1-201ENST00000340840 TMTC4Q5T4D3 741 aa9.49□□□□□ -0.89
TRERF1-201ENST00000340840 MRNIPQ6NTE8 343 aa9.49□□□□□ -0.89
TRERF1-201ENST00000340840 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa9.49□□□□□ -0.89
TRERF1-201ENST00000340840 PACRGLQ8N7B6 248 aa9.49□□□□□ -0.89
TRERF1-201ENST00000340840 SPATA22Q8NHS9 363 aa9.49□□□□□ -0.89
TRERF1-201ENST00000340840 BORCS5Q969J3 196 aa9.49□□□□□ -0.89
TRERF1-201ENST00000340840 ISL2Q96A47 359 aa9.49□□□□□ -0.89
TRERF1-201ENST00000340840 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
TRERF1-201ENST00000340840 BDH2Q9BUT1 245 aa9.49□□□□□ -0.89
TRERF1-201ENST00000340840 KIFC1Q9BW19 673 aa9.49□□□□□ -0.89
TRERF1-201ENST00000340840 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
TRERF1-201ENST00000340840 V9GYQ6 96 aa9.49□□□□□ -0.89
TRERF1-201ENST00000340840 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.7 ms