RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000334414.10

PTPRB-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 12,316 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-202ENST00000334414 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
PTPRB-202ENST00000334414 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRB-202ENST00000334414 SPATA13Q96N96 652 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRB-202ENST00000334414 SPEF2Q9C093 1822 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRB-202ENST00000334414 URADA6NGE7 173 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRB-202ENST00000334414 TFECO14948 347 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
PTPRB-202ENST00000334414 NPTX2P47972 431 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRB-202ENST00000334414 ECT2LQ008S8 904 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRB-202ENST00000334414 FGL1Q08830 312 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRB-202ENST00000334414 CSHL1Q14406 222 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRB-202ENST00000334414 FAXCQ5TGI0 409 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRB-202ENST00000334414 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRB-202ENST00000334414 VPS35Q96QK1 796 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRB-202ENST00000334414 MMP19Q99542 508 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRB-202ENST00000334414 MRTO4Q9UKD2 239 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
PTPRB-202ENST00000334414 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
PTPRB-202ENST00000334414 VWDEQ8N2E2 1590 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRB-202ENST00000334414 CENPBD1B2RD01 187 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRB-202ENST00000334414 DHX15O43143 795 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
PTPRB-202ENST00000334414 SLC25A27O95847 323 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRB-202ENST00000334414 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
PTPRB-202ENST00000334414 RPS9P46781 194 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
PTPRB-202ENST00000334414 GLRBP48167 497 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRB-202ENST00000334414 IDH2P48735 452 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
PTPRB-202ENST00000334414 GALK1P51570 392 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRB-202ENST00000334414 TEAD4Q15561 434 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRB-202ENST00000334414 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRB-202ENST00000334414 HTRA1Q92743 480 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRB-202ENST00000334414 HIPK3Q9H422 1215 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRB-202ENST00000334414 ANKRA2Q9H9E1 313 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRB-202ENST00000334414 E7ENX8 843 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRB-202ENST00000334414 RLN2P04090 185 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRB-202ENST00000334414 CAMK1Q14012 370 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRB-202ENST00000334414 MAPKAPK3Q16644 382 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRB-202ENST00000334414 UCMAQ8WVF2 138 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRB-202ENST00000334414 TCEAL3Q969E4 200 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRB-202ENST00000334414 TLR10Q9BXR5 811 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRB-202ENST00000334414 CRISPLD1Q9H336 500 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRB-202ENST00000334414 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
PTPRB-202ENST00000334414 IGSF9Q9P2J2 1179 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRB-202ENST00000334414 XPR1Q9UBH6 696 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRB-202ENST00000334414 ERCC6L2Q5T890 1561 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRB-202ENST00000334414 GSC2O15499 205 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRB-202ENST00000334414 PRAMEF1O95521 474 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRB-202ENST00000334414 IFNA6P05013 189 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRB-202ENST00000334414 SLC6A4P31645 630 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRB-202ENST00000334414 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP5.55□□□□□ -1.52
PTPRB-202ENST00000334414 ITGA7Q13683 1181 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRB-202ENST00000334414 AFTPHQ6ULP2 937 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRB-202ENST00000334414 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRB-202ENST00000334414 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRB-202ENST00000334414 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
PTPRB-202ENST00000334414 KAT6BQ8WYB5 2073 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRB-202ENST00000334414 DFNA5O60443 496 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRB-202ENST00000334414 H6PDO95479 791 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRB-202ENST00000334414 ASLP04424 464 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRB-202ENST00000334414 DBTP11182 482 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
PTPRB-202ENST00000334414 EPCAMP16422 314 aa5.55□□□□□ -1.52
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PTPRB-202ENST00000334414 CHRNA5P30532 468 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRB-202ENST00000334414 HALP42357 657 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRB-202ENST00000334414 MAZP56270 477 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
PTPRB-202ENST00000334414 KCNJ2P63252 427 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRB-202ENST00000334414 PWP1Q13610 501 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRB-202ENST00000334414 WDR59Q6PJI9 974 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRB-202ENST00000334414 LINC00471Q8N535 108 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRB-202ENST00000334414 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
PTPRB-202ENST00000334414 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRB-202ENST00000334414 CHST13Q8NET6 341 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRB-202ENST00000334414 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
PTPRB-202ENST00000334414 GIMAP5Q96F15 307 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRB-202ENST00000334414 ZNF347Q96SE7 839 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRB-202ENST00000334414 PFDN5Q99471 154 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRB-202ENST00000334414 RNF146Q9NTX7 359 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRB-202ENST00000334414 HMGXB4Q9UGU5 601 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRB-202ENST00000334414 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
PTPRB-202ENST00000334414 TAF6LQ9Y6J9 622 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRB-202ENST00000334414 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
PTPRB-202ENST00000334414 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
PTPRB-202ENST00000334414 ASMTP46597 345 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRB-202ENST00000334414 CLK3P49761 638 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
PTPRB-202ENST00000334414 TMBIM6P55061 237 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRB-202ENST00000334414 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
PTPRB-202ENST00000334414 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
PTPRB-202ENST00000334414 MED22Q15528 200 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRB-202ENST00000334414 ERFEQ4G0M1 354 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRB-202ENST00000334414 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
PTPRB-202ENST00000334414 MTSS1LQ765P7 747 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRB-202ENST00000334414 BAP1Q92560 729 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRB-202ENST00000334414 ACOX2Q99424 681 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRB-202ENST00000334414 EHD4Q9H223 541 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRB-202ENST00000334414 FBXO44Q9H4M3 255 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRB-202ENST00000334414 CDHR5Q9HBB8 845 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRB-202ENST00000334414 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
PTPRB-202ENST00000334414 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRB-202ENST00000334414 ILVBLA1L0T0 632 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRB-202ENST00000334414 MTA2O94776 668 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRB-202ENST00000334414 FADS2O95864 444 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
PTPRB-202ENST00000334414 MYBL2P10244 700 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRB-202ENST00000334414 MNDAP41218 407 aa5.55□□□□□ -1.52
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