RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317063.10

CHTF18-202, Transcript of chromosome transmission fidelity factor 18, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CHTF18, Length 2,988 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTF18-202ENST00000317063 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
CHTF18-202ENST00000317063 SLC17A6Q9P2U8 582 aa16.47■□□□□ 0.23
CHTF18-202ENST00000317063 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa16.47■□□□□ 0.23
CHTF18-202ENST00000317063 SDR42E2A6NKP2 422 aa16.47■□□□□ 0.23
CHTF18-202ENST00000317063 CACNG3O60359 315 aa16.47■□□□□ 0.23
CHTF18-202ENST00000317063 LATS1O95835 1130 aa16.47■□□□□ 0.23
CHTF18-202ENST00000317063 BMP1P13497 986 aa16.47■□□□□ 0.23
CHTF18-202ENST00000317063 LMAN2Q12907 356 aa16.47■□□□□ 0.23
CHTF18-202ENST00000317063 ZNF77Q15935 545 aa16.47■□□□□ 0.23
CHTF18-202ENST00000317063 MAP7D1Q3KQU3 841 aa16.47■□□□□ 0.23
CHTF18-202ENST00000317063 MPPE1Q53F39 396 aa16.47■□□□□ 0.23
CHTF18-202ENST00000317063 NPAS3Q8IXF0 933 aa16.47■□□□□ 0.23
CHTF18-202ENST00000317063 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa16.47■□□□□ 0.23
CHTF18-202ENST00000317063 TEX26Q8N6G2 289 aa16.47■□□□□ 0.23
CHTF18-202ENST00000317063 ZNF778Q96MU6 729 aa16.47■□□□□ 0.23
CHTF18-202ENST00000317063 BBS2Q9BXC9 721 aa16.47■□□□□ 0.23
CHTF18-202ENST00000317063 CHRAC1Q9NRG0 131 aa16.47■□□□□ 0.23
CHTF18-202ENST00000317063 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP16.47■□□□□ 0.23
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CHTF18-202ENST00000317063 MYLKQ15746 1914 aa16.46■□□□□ 0.23
CHTF18-202ENST00000317063 GMNCA6NCL1 334 aa16.46■□□□□ 0.23
CHTF18-202ENST00000317063 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP16.46■□□□□ 0.23
CHTF18-202ENST00000317063 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP16.46■□□□□ 0.23
CHTF18-202ENST00000317063 FAM155BO75949 473 aa16.46■□□□□ 0.23
CHTF18-202ENST00000317063 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP16.46■□□□□ 0.237e-7■■■■■ 53.3
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CHTF18-202ENST00000317063 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP16.46■□□□□ 0.23
CHTF18-202ENST00000317063 WNT3AP56704 352 aa16.46■□□□□ 0.23
CHTF18-202ENST00000317063 CYTH1Q15438 398 aa16.46■□□□□ 0.23
CHTF18-202ENST00000317063 TMCO4Q5TGY1 634 aa16.46■□□□□ 0.23
CHTF18-202ENST00000317063 LONP2Q86WA8 852 aa16.46■□□□□ 0.23
CHTF18-202ENST00000317063 ARRDC2Q8TBH0 407 aa16.46■□□□□ 0.23
CHTF18-202ENST00000317063 ALG14Q96F25 216 aa16.46■□□□□ 0.23
CHTF18-202ENST00000317063 TTC25Q96NG3 672 aa16.46■□□□□ 0.23
CHTF18-202ENST00000317063 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP16.46■□□□□ 0.23
CHTF18-202ENST00000317063 ABCB8Q9NUT2 735 aa16.46■□□□□ 0.23
CHTF18-202ENST00000317063 VPS51Q9UID3 782 aa16.46■□□□□ 0.23
CHTF18-202ENST00000317063 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP16.46■□□□□ 0.23
CHTF18-202ENST00000317063 OR51B4Q9Y5P0 310 aa16.46■□□□□ 0.23
CHTF18-202ENST00000317063 DOCK8Q8NF50 2099 aa16.46■□□□□ 0.23
CHTF18-202ENST00000317063 ALADP13716 330 aa16.46■□□□□ 0.23
CHTF18-202ENST00000317063 CREB1P16220 341 aa16.46■□□□□ 0.23
CHTF18-202ENST00000317063 FSHRP23945 695 aa16.46■□□□□ 0.23
CHTF18-202ENST00000317063 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP16.46■□□□□ 0.23
CHTF18-202ENST00000317063 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP16.46■□□□□ 0.23
CHTF18-202ENST00000317063 PHEXP78562 749 aa16.46■□□□□ 0.23
CHTF18-202ENST00000317063 CDK16Q00536 496 aa16.46■□□□□ 0.23
CHTF18-202ENST00000317063 POU6F1Q14863 301 aa16.46■□□□□ 0.23
CHTF18-202ENST00000317063 LMNTD2Q8IXW0 634 aa16.46■□□□□ 0.23
CHTF18-202ENST00000317063 LEMD2Q8NC56 503 aa16.46■□□□□ 0.23
CHTF18-202ENST00000317063 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP16.46■□□□□ 0.23
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CHTF18-202ENST00000317063 FSD1LQ9BXM9 530 aa16.46■□□□□ 0.23
CHTF18-202ENST00000317063 SLC25A51Q9H1U9 297 aa16.46■□□□□ 0.23
CHTF18-202ENST00000317063 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP16.46■□□□□ 0.23
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CHTF18-202ENST00000317063 UGT1A9O60656 530 aa16.45■□□□□ 0.22
CHTF18-202ENST00000317063 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP16.45■□□□□ 0.22
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CHTF18-202ENST00000317063 HLA-FP30511 346 aa16.45■□□□□ 0.22
CHTF18-202ENST00000317063 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP16.45■□□□□ 0.22
CHTF18-202ENST00000317063 DENND5AQ6IQ26 1287 aa16.45■□□□□ 0.22
CHTF18-202ENST00000317063 CPXM2Q8N436 756 aa16.45■□□□□ 0.22
CHTF18-202ENST00000317063 OR6K2Q8NGY2 324 aa16.45■□□□□ 0.22
CHTF18-202ENST00000317063 TTC8Q8TAM2 541 aa16.45■□□□□ 0.22
CHTF18-202ENST00000317063 SMIM14Q96QK8 99 aa16.45■□□□□ 0.22
CHTF18-202ENST00000317063 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP16.45■□□□□ 0.22
CHTF18-202ENST00000317063 UGT1A7Q9HAW7 530 aa16.45■□□□□ 0.22
CHTF18-202ENST00000317063 UGT1A10Q9HAW8 530 aa16.45■□□□□ 0.22
CHTF18-202ENST00000317063 UGT1A8Q9HAW9 530 aa16.45■□□□□ 0.22
CHTF18-202ENST00000317063 CASS4Q9NQ75 786 aa16.45■□□□□ 0.22
CHTF18-202ENST00000317063 SMYD2Q9NRG4 433 aa16.45■□□□□ 0.22
CHTF18-202ENST00000317063 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP16.45■□□□□ 0.22
CHTF18-202ENST00000317063 ZMPSTE24O75844 475 aa16.45■□□□□ 0.22
CHTF18-202ENST00000317063 SUN1O94901 812 aa16.45■□□□□ 0.22
CHTF18-202ENST00000317063 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa16.45■□□□□ 0.22
CHTF18-202ENST00000317063 IRF7Q92985 503 aa16.45■□□□□ 0.22
CHTF18-202ENST00000317063 ASIC4Q96FT7 647 aa16.45■□□□□ 0.22
CHTF18-202ENST00000317063 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP16.45■□□□□ 0.22
CHTF18-202ENST00000317063 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP16.45■□□□□ 0.22
CHTF18-202ENST00000317063 LRRC40Q9H9A6 602 aa16.45■□□□□ 0.22
CHTF18-202ENST00000317063 ANXA9O76027 345 aa16.44■□□□□ 0.22
CHTF18-202ENST00000317063 PRKCGP05129 697 aa16.44■□□□□ 0.22
CHTF18-202ENST00000317063 TYRP14679 529 aa16.44■□□□□ 0.22
CHTF18-202ENST00000317063 GSTT1P30711 240 aa16.44■□□□□ 0.22
CHTF18-202ENST00000317063 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP16.44■□□□□ 0.22
CHTF18-202ENST00000317063 MFSD3Q96ES6 412 aa16.44■□□□□ 0.22
CHTF18-202ENST00000317063 TM6SF2Q9BZW4 377 aa16.44■□□□□ 0.22
CHTF18-202ENST00000317063 SPHK2Q9NRA0 654 aa16.44■□□□□ 0.22
CHTF18-202ENST00000317063 INIPQ9NRY2 104 aa16.44■□□□□ 0.22
CHTF18-202ENST00000317063 A8MUI8 341 aa16.44■□□□□ 0.22
CHTF18-202ENST00000317063 GOLGA8TH3BQL2 631 aa16.44■□□□□ 0.22
CHTF18-202ENST00000317063 CYBBP04839 570 aa16.44■□□□□ 0.22
CHTF18-202ENST00000317063 PIRTP0C851 137 aa16.44■□□□□ 0.22
CHTF18-202ENST00000317063 STK19P49842 368 aaPredicted RBP16.44■□□□□ 0.22
CHTF18-202ENST00000317063 PTPRRQ15256 657 aa16.44■□□□□ 0.22
CHTF18-202ENST00000317063 KDELC1Q6UW63 502 aa16.44■□□□□ 0.22
CHTF18-202ENST00000317063 CTAGE3PQ8IX95 158 aa16.44■□□□□ 0.22
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