RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000306324.3

HOXD4-201, Transcript of homeobox D4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD4, Length 1,464 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD4-201ENST00000306324 TBC1D3DA0A087WVF3 549 aa22.53■■□□□ 1.2
HOXD4-201ENST00000306324 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa22.53■■□□□ 1.2
HOXD4-201ENST00000306324 TBC1D3EA0A087X179 549 aa22.53■■□□□ 1.2
HOXD4-201ENST00000306324 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa22.53■■□□□ 1.2
HOXD4-201ENST00000306324 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
HOXD4-201ENST00000306324 LRRC72A6NJI9 287 aa22.53■■□□□ 1.2
HOXD4-201ENST00000306324 TBC1D3LB9A6J9 549 aa22.53■■□□□ 1.2
HOXD4-201ENST00000306324 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
HOXD4-201ENST00000306324 TBC1D3HP0C7X1 549 aa22.53■■□□□ 1.2
HOXD4-201ENST00000306324 TIMP2P16035 220 aa22.53■■□□□ 1.2
HOXD4-201ENST00000306324 ABL2P42684 1182 aa22.53■■□□□ 1.2
HOXD4-201ENST00000306324 TAS2R38P59533 333 aa22.53■■□□□ 1.2
HOXD4-201ENST00000306324 SKOR1P84550 965 aa22.53■■□□□ 1.2
HOXD4-201ENST00000306324 PMS2CLQ68D20 193 aa22.53■■□□□ 1.2
HOXD4-201ENST00000306324 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa22.53■■□□□ 1.2
HOXD4-201ENST00000306324 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa22.53■■□□□ 1.2
HOXD4-201ENST00000306324 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa22.53■■□□□ 1.2
HOXD4-201ENST00000306324 ARMCX6Q7L4S7 300 aa22.53■■□□□ 1.2
HOXD4-201ENST00000306324 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
HOXD4-201ENST00000306324 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
HOXD4-201ENST00000306324 SPATA22Q8NHS9 363 aa22.53■■□□□ 1.2
HOXD4-201ENST00000306324 SPATA13Q96N96 652 aa22.53■■□□□ 1.2
HOXD4-201ENST00000306324 EPC1Q9H2F5 836 aa22.53■■□□□ 1.2
HOXD4-201ENST00000306324 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
HOXD4-201ENST00000306324 UBP1Q9NZI7 540 aa22.53■■□□□ 1.2
HOXD4-201ENST00000306324 RAB23Q9ULC3 237 aa22.53■■□□□ 1.2
HOXD4-201ENST00000306324 TSPAN11A1L157 253 aa22.52■■□□□ 1.2
HOXD4-201ENST00000306324 RHOBTB1O94844 696 aa22.52■■□□□ 1.2
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HOXD4-201ENST00000306324 STIP1P31948 543 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
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HOXD4-201ENST00000306324 UGP2Q16851 508 aa22.52■■□□□ 1.2
HOXD4-201ENST00000306324 ARMC12Q5T9G4 340 aa22.52■■□□□ 1.2
HOXD4-201ENST00000306324 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
HOXD4-201ENST00000306324 OR2T34Q8NGX1 318 aa22.52■■□□□ 1.2
HOXD4-201ENST00000306324 RAB7BQ96AH8 199 aa22.52■■□□□ 1.2
HOXD4-201ENST00000306324 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
HOXD4-201ENST00000306324 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
HOXD4-201ENST00000306324 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa22.51■■□□□ 1.19
HOXD4-201ENST00000306324 C5orf60A6NFR6 353 aa22.51■■□□□ 1.19
HOXD4-201ENST00000306324 UPK3BL1B0FP48 263 aa22.51■■□□□ 1.19
HOXD4-201ENST00000306324 UPK3BL2E5RIL1 263 aa22.51■■□□□ 1.19
HOXD4-201ENST00000306324 NEMP1O14524 444 aa22.51■■□□□ 1.19
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HOXD4-201ENST00000306324 PCDH8O95206 1070 aa22.51■■□□□ 1.19
HOXD4-201ENST00000306324 PGLSO95336 258 aa22.51■■□□□ 1.19
HOXD4-201ENST00000306324 CPP00450 1065 aa22.51■■□□□ 1.19
HOXD4-201ENST00000306324 IFNB1P01574 187 aa22.51■■□□□ 1.19
HOXD4-201ENST00000306324 PRKCGP05129 697 aa22.51■■□□□ 1.19
HOXD4-201ENST00000306324 ITGAVP06756 1048 aa22.51■■□□□ 1.19
HOXD4-201ENST00000306324 NBL1P41271 181 aa22.51■■□□□ 1.19
HOXD4-201ENST00000306324 KCNJ1P48048 391 aa22.51■■□□□ 1.19
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HOXD4-201ENST00000306324 FADS3Q9Y5Q0 445 aa22.51■■□□□ 1.19
HOXD4-201ENST00000306324 A0A1W2PQ67 120 aa22.5■■□□□ 1.19
HOXD4-201ENST00000306324 PMPCBO75439 489 aa22.5■■□□□ 1.19
HOXD4-201ENST00000306324 PDHA1P08559 390 aa22.5■■□□□ 1.19
HOXD4-201ENST00000306324 ITIH2P19823 946 aa22.5■■□□□ 1.19
HOXD4-201ENST00000306324 GSTA5Q7RTV2 222 aa22.5■■□□□ 1.19
HOXD4-201ENST00000306324 KDELC2Q7Z4H8 507 aa22.5■■□□□ 1.19
HOXD4-201ENST00000306324 CREG2Q8IUH2 290 aa22.5■■□□□ 1.19
HOXD4-201ENST00000306324 CADM4Q8NFZ8 388 aa22.5■■□□□ 1.19
HOXD4-201ENST00000306324 SNX19Q92543 992 aa22.5■■□□□ 1.19
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HOXD4-201ENST00000306324 PREBQ9HCU5 417 aa22.5■■□□□ 1.19
HOXD4-201ENST00000306324 PCDH12Q9NPG4 1184 aa22.5■■□□□ 1.19
HOXD4-201ENST00000306324 GGT7Q9UJ14 662 aa22.5■■□□□ 1.19
HOXD4-201ENST00000306324 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
HOXD4-201ENST00000306324 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
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HOXD4-201ENST00000306324 GCATO75600 419 aa22.49■■□□□ 1.19
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HOXD4-201ENST00000306324 ACTN2P35609 894 aa22.49■■□□□ 1.19
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HOXD4-201ENST00000306324 ZNF592Q92610 1267 aa22.49■■□□□ 1.19
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HOXD4-201ENST00000306324 RTP4Q96DX8 246 aa22.49■■□□□ 1.19
HOXD4-201ENST00000306324 FAM153AQ9UHL3 310 aa22.49■■□□□ 1.19
HOXD4-201ENST00000306324 PHTF1Q9UMS5 762 aa22.49■■□□□ 1.19
HOXD4-201ENST00000306324 AREL1O15033 823 aa22.48■■□□□ 1.19
HOXD4-201ENST00000306324 AP1G1O43747 822 aa22.48■■□□□ 1.19
HOXD4-201ENST00000306324 FZD6O60353 706 aa22.48■■□□□ 1.19
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