RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284617.6

CCSAP-201, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-201ENST00000284617 MAGEC1O60732 1142 aa21.27■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 SH3BGRLO75368 114 aa21.27■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 TGDSO95455 350 aa21.27■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 WDR60Q8WVS4 1066 aa21.27■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 MYLPFQ96A32 169 aa21.27■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 DUSP16Q9BY84 665 aa21.27■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP21.27■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 PACSIN3Q9UKS6 424 aa21.27■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP21.27■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 WNT7AO00755 349 aa21.27■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 SNPHO15079 494 aa21.27■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa21.27■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa21.27■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 LPOP22079 712 aaPredicted RBP21.27■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 SMIM11AP58511 58 aa21.27■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP21.27■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 CDK18Q07002 472 aa21.27■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa21.27■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP21.27■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa21.27■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 VWA7Q9Y334 891 aa21.27■■□□□ 1
CCSAP-201ENST00000284617 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa21.27■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 GSTM5P46439 218 aa21.27■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 BEX3Q00994 111 aa21.27■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 PPM1LQ5SGD2 360 aa21.27■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa21.27■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 KLHL17Q6TDP4 642 aa21.27■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa21.27■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 PPP1R16AQ96I34 528 aa21.27■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 TRIM8Q9BZR9 551 aa21.27■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 ERVK-5Q9HDB9 667 aa21.27■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 SLC17A7Q9P2U7 560 aa21.27■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 YDJCA8MPS7 323 aa21.26■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 AVILO75366 819 aa21.26■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 PIAS1O75925 651 aa21.26■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 TPSB2P20231 275 aa21.26■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 RPL38P63173 70 aaKnown RBP21.26■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 CSNK2BP67870 215 aa21.26■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 CTBP1Q13363 440 aa21.26■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 TPSAB1Q15661 275 aa21.26■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 SLC25A52Q3SY17 297 aa21.26■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP21.26■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 EEF1DP3Q658K8 133 aa21.26■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 GATAD2AQ86YP4 633 aa21.26■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 KBTBD8Q8NFY9 601 aa21.26■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 ZFP28Q8NHY6 868 aa21.26■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa21.26■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 SLC12A4Q9UP95 1085 aa21.26■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 ANGPT4Q9Y264 503 aa21.26■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 A8MX80 341 aa21.26■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 AMHP03971 560 aa21.26■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 ABL2P42684 1182 aa21.26■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP21.26■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa21.26■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 ISLR2Q6UXK2 745 aa21.26■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 JOSD2Q8TAC2 188 aa21.26■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP21.26■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 AP4B1Q9Y6B7 739 aa21.26■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 BBIP1A8MTZ0 92 aa21.26■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 CRHR1P34998 444 aa21.26■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 SPIDRQ14159 915 aa21.26■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 GPR180Q86V85 440 aa21.26■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 UBASH3BQ8TF42 649 aa21.26■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 CLN6Q9NWW5 311 aa21.26■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 PLLPQ9Y342 182 aa21.26■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP21.26■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 FOLH1Q04609 750 aa21.26■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 RIPK1Q13546 671 aa21.26■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 UGCGQ16739 394 aa21.26■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP21.26■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 NELL1Q92832 810 aa21.26■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 PLGRKTQ9HBL7 147 aa21.26■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 RNF19AQ9NV58 838 aa21.26■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 CLIC5Q9NZA1 410 aa21.26■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 AK5Q9Y6K8 562 aa21.26■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP21.25■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP21.25■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP21.25■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF232Q9UNY5 417 aa21.25■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 BTRCQ9Y297 605 aa21.25■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa21.25■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 ABLIM1O14639 778 aa21.25■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP21.25■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 ARHGAP8P85298 464 aa21.25■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 PTSQ03393 145 aa21.25■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 TATDN1Q6P1N9 297 aa21.25■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 MZT2AQ6P582 158 aa21.25■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 MECRQ9BV79 373 aa21.25■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM109Q9BVC6 243 aa21.25■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 PPLO60437 1756 aa21.25■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 H7C0S8 307 aa21.25■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP21.25■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 FFAR3O14843 346 aa21.25■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 GPR42O15529 346 aa21.25■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 B4GALT4O60513 344 aa21.25■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 COL6A2P12110 1019 aa21.25■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP21.25■□□□□ 0.995e-7■□□□□ 11.3
CCSAP-201ENST00000284617 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP21.25■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP21.25■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 FAIM2Q9BWQ8 316 aa21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.1 ms